用于构建扩增子测序文库的引物组、试剂盒和方法技术

本发明专利技术公开了一种构建扩增子测序文库的方法，其包括：采用捕获延伸引物对包括目标序列的样本进行线性扩增；采用扩增引物对对线性扩增产物进行PCR扩增，得到扩增子测序文库；捕获延伸引物的5’端到3’端依次包括第一靶向序列、UMI序列和单向引物，第一靶向序列包括Read1测序引物序列或Read2测序引物序列，单向引物用于扩增目标序列，捕获延伸引物用于对目标序列进行线性扩增。该方法可通过捕获延伸引物基于原始模板进行线性扩增，提高了原始模板的利用率；并且，捕获延伸引物中含有UMI序列，且合成链信息直接来源于原始模板，避免了多次扩增时带来的错配积累。由此得到扩增子测序文库能够实现超低频突变的高灵敏检测。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于测序建库，具体涉及一种用于构建扩增子测序文库的引物组、试剂盒和方法。

技术介绍

1、扩增子建库是通过设计多重特异性引物组，对核酸样本一个或多个目标检测位点进行pcr扩增富集，随后经第二轮pcr对扩增序列引入通用二代测序引物，形成靶标扩增子文库的建库方法。扩增子建库有流程短、低成本和低样本投入等优势，且具备高检测灵敏度的潜力。

2、扩增子测序应用领域：(1)癌症基因测序：靶向癌症测序侧重于一组精选的基因、基因区域或扩增子，它们与癌症有着已知的关联，预先设计的集合和定制集合都可用于研究目标靶向基因；(2)疾病筛查：使用ngs可通过同时评估多个基因来发现遗传病的致病变异，与传统方法相比，使用ngs可降低成本，因为传统方法通常成本较高且不确定，同时需要大量测试；(3)植物和动物测序：预设的基因组区域靶向重测序可以发现动物和植物中的基因变异，这些变异可能代表了有益的突变，可以帮助做出育种决策，还可能揭示与疾病易感性相关的突变。

3、针对治疗后的癌症患者，血液中会有微小残留病变(minimal residula disease，m本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.引物组，其特征在于，包括：

2.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，所述扩增引物对包括扩增引物1和扩增引物2；

3.根据权利要求2所述的引物组，其特征在于，所述扩增引物2进一步包括第二靶向引物，所述第二靶向引物的3’端和所述反向引物的5’端相连；

4.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，进一步包括Index扩增引物对；

5.一种试剂盒，其特征在于，包括权利要求1～4任一项所述的引物组。

6.一种构建扩增子测序文库的方法，其特征在于，包括：

7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述Index扩增引物对...

【技术特征摘要】

1.引物组，其特征在于，包括：

2.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，所述扩增引物对包括扩增引物1和扩增引物2；

3.根据权利要求2所述的引物组，其特征在于，所述扩增引物2进一步包括第二靶向引物，所述第二靶向引物的3’端和所述反向引物的5’端相连；

4.根据权利要求1所述的引物组，其特征在于，进一步包括index扩增引物对；

5.一种试剂盒，其特征在于，包括权利要求1～4任一项所述的引物组。

6.一种构...

【专利技术属性】
技术研发人员：李良鉴，王洋，郑祥，吴亚林，
申请(专利权)人：杭州瑞普基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：