【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】一种核酸、含有该核酸的组合物与缀合物及制备方法和用途
技术介绍
血脂异常,又名高脂血症,是脂肪代谢或运转异常,使血浆脂质高于正常值的一种全身性疾病,正严重威胁着全球患者的健康。现有的治疗血脂异常的药物主要有他汀类、胆固醇吸收抑制剂、树脂类、普罗步考、贝特类和烟酸及其衍生物。血管生成素样蛋白3(ANGPTL3)是一种主要在肝脏表达的分泌蛋白,因其基因结构与血管生成素相似得名。现有研究证实血脂异常与ANGPTL3的高表达量是有相关性的,ANGPTL3通过与脂肪组织结合,抑制脂蛋白脂肪酶的活性来调节脂质代谢。ANGPTL3的低表达可以减缓血脂异常引起的动脉粥样硬化。因此,若能从基因水平沉默基因表达,阻断ANGPTL3的生成,无疑将是最为理想的治疗手段。小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)可基于RNA干扰(RNA interference,RNAi)这一机制,以序列特异性的方式抑制或阻断任何感兴趣的目的基因的表达,从而达到治疗疾病的目的。siRNA稳定化修饰及其递送系统是小RNA药物开发中的两个关键技术。
技术实现思路
在一些实施方式中,本公开提供了一种能够抑制ANGPTL3基因表达的siRNA,该siRNA含有正义链和反义链,所述siRNA中的每个核苷酸各自独立地为修饰或未修饰的核苷酸,其中,所述正义链含有一段核苷酸序列I,所述反义链含有一段核苷酸序列II,所述核苷酸序列Ⅰ和所述核苷酸序列Ⅱ至少部分地反向互补形成双链区,其中,所述核苷酸序列Ⅰ含有核苷酸序列A,所述核苷酸序列A与SEQ ID ...
【技术保护点】
一种siRNA,所述siRNA含有正义链和反义链,所述siRNA中的每个核苷酸各自独立地为修饰或未修饰的核苷酸,其中,所述正义链含有一段核苷酸序列I,反义链含有一段核苷酸序列II,所述核苷酸序列Ⅰ和所述核苷酸序列Ⅱ至少部分地反向互补形成双链区,其中,所述核苷酸序列Ⅰ含有核苷酸序列A,所述核苷酸序列A与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异,且所述核苷酸序列Ⅱ含有核苷酸序列B,所述核苷酸序列B与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异:/n5'-CCAAGAGCACCAAGAACUZ-3'(SEQ ID NO:1);/n5'-Z'AGUUCUUGGUGCUCUUGG-3'(SEQ ID NO:2),/n其中,Z为A,Z'为U,/n所述核苷酸序列A中包含位置对应于Z的核苷酸Z
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20171201 CN 2017112493569;20171229 CN 201711482915一种siRNA,所述siRNA含有正义链和反义链,所述siRNA中的每个核苷酸各自独立地为修饰或未修饰的核苷酸,其中,所述正义链含有一段核苷酸序列I,反义链含有一段核苷酸序列II,所述核苷酸序列Ⅰ和所述核苷酸序列Ⅱ至少部分地反向互补形成双链区,其中,所述核苷酸序列Ⅰ含有核苷酸序列A,所述核苷酸序列A与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异,且所述核苷酸序列Ⅱ含有核苷酸序列B,所述核苷酸序列B与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列长度相等,且不多于3个核苷酸差异:
5'-CCAAGAGCACCAAGAACUZ-3'(SEQ ID NO:1);
5'-Z'AGUUCUUGGUGCUCUUGG-3'(SEQ ID NO:2),
其中,Z为A,Z'为U,
所述核苷酸序列A中包含位置对应于Z的核苷酸Z
A,所述核苷酸序列B中包含位置对应于Z'的核苷酸Z'
B,所述Z'
B是所述反义链5'末端的第一个核苷酸。
根据权利要求1所述的siRNA,其中,所述核苷酸序列A与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列之间不多于1个核苷酸差异,和/或所述核苷酸序列B与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列之间不多于1个核苷酸差异。
根据权利要求1或2所述的siRNA,其中,所述核苷酸序列B与SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列之间的核苷酸差异包括Z'
B位置处的差异,且Z'
B选自A、C或G。
根据权利要求1-3中任一项所述的siRNA,其中Z
A是与Z'
B互补的核苷酸。
根据权利要求1-4中任一项所述的siRNA,其中,所述核苷酸序列A和所述核苷酸序列B基本上反向互补、实质上反向互补或完全反向互补;所述基本上反向互补是指两个核苷酸序列之间存在不多于3个的碱基错配;所述实质上反向互补是指两个核苷酸序列之间存在不多于1个的碱基错配;完全反向互补是指两个核苷酸序列之间没有错配。
根据权利要求1-5中任一项所述的siRNA,其中,核苷酸序列A是SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列,核苷酸序列B是SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列:
5'-CCAAGAGCACCAAGAACUZ
A-3'(SEQ ID NO:3);
5'-Z'
BAGUUCUUGGUGCUCUUGG-3'(SEQ ID NO:4),
其中,Z
A选自A、U、G或C,并且Z'
B是与Z
A互补的核苷酸;并且,所述正义链和反义链长度相同或不同,所述正义链的长度为19-23个核苷酸,反义链的长度为20-26个核苷酸。
根据权利要求6所述的siRNA,其中Z
A为A,Z'
B为U。
根据权利要求1-7中任一项所述的siRNA,其中,所述核苷酸序列I还含有核苷酸序列III,所述核苷酸序列II还含有核苷酸序列IV,核苷酸序列III和核苷酸序列IV的长度各自独立地为1-4个核苷酸,所述核苷酸序列III连接在核苷酸序列A的5’末端,核苷酸序列IV连接在核苷酸序列B的3’末端,所述核苷酸序列Ⅲ和所述核苷酸序列Ⅳ长度相等并且实质上反向互补或完全反向互补;所述实质上反向互补是指两个核苷酸序列之间存在不多于1个的碱基错配;完全反向互补是指两个核苷酸序列之间没有错配。
根据权利要求8所述的siRNA,其中,所述核苷酸序列III和IV的长度均为1个核苷酸,所述核苷酸序列III的碱基为G;
或者,所述核苷酸序列III和IV的长度均为2个核苷酸,按照5’末端到3’末端的方向,核苷酸序列III的碱基组成为AG;
或者,所述核苷酸序列III和IV的长度均为3个核苷酸,按照5’末端到3’末端的方向,核苷酸序列III的碱基组成为AAG;
或者,所述核苷酸序列III和IV的长度均为4个核苷酸,按照5’末端到3’末端的方向,核苷酸序列III的碱基组成为CAAG。
根据权利要求1-9中任一项所述的siRNA,其中,所述核苷酸序列II还含有核苷酸序列V,核苷酸序列V的长度为1至3个核苷酸,连接在所述反义链的3’末端,构成反义链的3’垂悬末端。
根据权利要求10所述的siRNA,其中,所述核苷酸序列V的长度为2个核苷酸。
根据权利要求10或11所述的siRNA,其中,所述核苷酸序列V为连续的两个胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸或连续的两个尿嘧啶核糖核苷酸,或者所述核苷酸序列V与靶mRNA相应位置的核苷酸互补。
根据权利要求1-12中任一项所述的siRNA,其中,所述siRNA的正义链含有如SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列:
5’-CCAAGAGCACCAAGAACUZA-3’(SEQ ID NO:3);
5’-Z'BAGUUCUUGGUGCUCUUGGCU-3’(SEQ ID NO:5);
或者,所述siRNA的正义链含有如SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列:
5’-AGCCAAGAGCACCAAGAACUZA-3’(SEQ ID NO:6);
5’-Z'BAGUUCUUGGUGCUCUUGGCUUG-3’(SEQ ID NO:7);
其中,所述Z'B是反义链5'末端的第一个核苷酸,ZA选自A、U、G或C,并且Z'B是与ZA互补的核苷酸。
根据权利要求1-13中任一项所述的siRNA,其中,所述siRNA为siAN1或siAN2:
siAN1
正义链:5’-CCAAGAGCACCAAGAACUA-3’(SEQ ID NO:8);
反义链:5’-UAGUUCUUGGUGCUCUUGGCU-3’(SEQ ID NO:9);
siAN2
正义链:5’-AGCCAAGAGCACCAAGAACUA-3’(SEQ ID NO:10);
反义链:5’-UAGUUCUUGGUGCUCUUGGCUUG-3’(SEQ ID NO:11)。
根据权利要求1-14中任一项所述的siRNA,其中,所述正义链或所述反义链中的至少一个核苷酸为修饰的核苷酸,和/或至少一个磷酸酯基为具有修饰基团的磷酸酯基。
根据权利要求1-15中任一项所述的siRNA,其中,所述正义链和所述反义链中的每一个核苷酸独立地为氟代修饰的核苷酸或非氟代修饰的核苷酸。
根据权利要求16所述的siRNA,其中,所述氟代修饰的核苷酸位于核苷酸序列A和核苷酸序列B中,并且,按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列A的第7、8、9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸;按照5'末端到3'末端的方向,所述核苷酸序列B的第2、6、14、16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸。
根据权利要求16或17所述的siRNA,其中,按照5'末端到3'末端的方向,在所述正义链中,所述核苷酸序列A的第7、8、9位或者5、7、8、9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,所述正义链中其余位置的核苷酸为非氟代修饰的核苷酸;按照5'末端到3'末端的方向,在所述反义链中,所述核苷酸序列B的第2、6、14、16位或者2、6、8、9、14、16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,所述反义链中其余位置的核苷酸为非氟代修饰的核苷酸。
根据权利要求16-18中任一项所述的siRNA,其中,每一个非氟代修饰的核苷酸独立地选自核苷酸的核糖基2'位的羟基被非氟基团取代形成的核苷酸或核苷酸类似物中的一种。
根据权利要求19所述的siRNA,其中,核苷酸的核糖基2'位的羟基被非氟基团取代形成的核苷酸选自2'-烷氧基修饰的核苷酸、2'-经取代的烷氧基修饰的核苷酸、2'-烷基修饰的核苷酸、2'-经取代的烷基修饰的核苷酸、2'-氨基修饰的核苷酸、2'-经取代的氨基修饰的核苷酸、2'-脱氧核苷酸中的一种;核苷酸类似物选自异核苷酸、LNA、ENA、cET、UNA和GNA中的一种。
根据权利要求16-20所述的siRNA,其中,每一个非氟代修饰的核苷酸均为甲氧基修饰的核苷酸,所述甲氧基修饰的核苷酸指核糖基的2'-羟基被甲氧基取代而形成的核苷酸。
根据权利要求21所述的siRNA,其中,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的正义链中核苷酸序列A的第5、7、8和9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的正义链的其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸,并且,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的反义链中核苷酸序列B的第2、6、8、9、14和16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的反义链其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸;
或者,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的正义链中核苷酸序列A的第5、7、8和9位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的正义链的其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸,并且,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的反义链中核苷酸序列B的第2、6、14和16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的反义链其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸;
或者,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的正义链中核苷酸序列A的第7、8和9位的核苷酸为-氟代修饰的核苷酸,siRNA的正义链的其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸,并且,按照5’末端到3’末端的方向,所述siRNA的反义链中核苷酸序列B的第2、6、14和16位的核苷酸为氟代修饰的核苷酸,siRNA的反义链其余位置的核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸。
根据权利要求1-22中任一项所述的siRNA,其中,所述siRNA为siAN1-M1、siAN2-M1、siAN1-M2、siAN2-M2、siAN1-M3、siAN2-M3中的任意一种:
siAN1-M1
正义链:5’-CmCmAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:12)
反义链:5’-UmAfGmUmUmCfUmUfGfGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUm-3’(SEQ ID NO:13)
siAN2-M1
正义链:5’-AmGmCmCmAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:14)
反义链:5’-UmAfGmUmUmCfUmUfGfGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUmUmGm-3’(SEQ ID NO:15)
siAN1-M2
正义链:5’-CmCmAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:12)
反义链:5’-UmAfGmUmUmCfUmUmGmGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUm-3’(SEQ ID NO:16)
siAN2-M2
正义链:5’-AmGmCmCmAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:14)
反义链:5’-UmAfGmUmUmCfUmUmGmGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUmUmGm-3’(SEQ ID NO:17)
siAN1-M3
正义链:5’-CmCmAmAmGmAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:18)
反义链:5’-UmAfGmUmUmCfUmUmGmGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUm-3’(SEQ ID NO:16)
siAN2-M3
正义链:5’-AmGmCmCmAmAmGmAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:19)
反义链:5’-UmAfGmUmUmCfUmUmGmGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUmUmGm-3’(SEQ ID NO:17)
其中,大写字母C、G、U、A表示核苷酸的碱基组成;小写字母m表示该字母m左侧相邻的一个核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸;小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核苷酸为氟代修饰的核苷酸。
根据权利要求15所述的siRNA,其中,所述具有修饰基团的磷酸酯基为磷酸酯基中的磷酸二酯键中的至少一个氧原子被硫原子取代而形成的硫代磷酸酯基。
根据权利要求15或24所述的siRNA,其中,所述具有修饰基团的磷酸酯基为具有如式(1)所示结构的硫代磷酸酯基:
根据权利要求24或25所述的siRNA,其中,所述siRNA中,硫代磷酸酯基连接存在于由以下位置组成的组中的至少一处:
所述正义链的5'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;
所述正义链的5'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间;
所述正义链的3'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;
所述正义链的3'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间;
所述反义链的5'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;
所述反义链的5'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间;
所述反义链的3'末端端部第1个核苷酸和第2个核苷酸之间;以及
所述反义链的3'末端端部第2个核苷酸和第3个核苷酸之间。
根据权利要求1-26中任一项所述的siRNA,其中,所述siRNA为siAN1-M1S、siAN2-M1S、siAN1-M2S、siAN2-M2S、siAN1-M3S、siAN2-M3S中的任意一种:
siAN1-M1S
正义链:5’-CmsCmsAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:20)
反义链:5’-UmsAfsGmUmUmCfUmUfGfGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmsCmsUm-3’(SEQ ID NO:21)
siAN2-M1S
正义链:5’-AmsGmsCmCmAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:22)
反义链:5’-UmsAfsGmUmUmCfUmUfGfGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUmsUmsGm-3’(SEQ ID NO:23)
siAN1-M2S
正义链:5’-CmsCmsAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:20)
反义链:5’-UmsAfsGmUmUmCfUmUmGmGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmsCmsUm-3’(SEQ ID NO:24)
siAN2-M2S
正义链:5’-AmsGmsCmCmAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:22)
反义链:5’-UmsAfsGmUmUmCfUmUmGmGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUmsUmsGm-3’(SEQ ID NO:25)
siAN1-M3S
正义链:5’-CmsCmsAmAmGmAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:26)
反义链:5’-UmsAfsGmUmUmCfUmUmGmGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmsCmsUm-3’(SEQ ID NO:24)
siAN2-M3S
正义链:5’-AmsGmsCmCmAmAmGmAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:27)
反义链:5’-UmsAfsGmUmUmCfUmUmGmGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUmsUmsGm-3’(SEQ ID NO:25)
其中,大写字母C、G、U、A表示核苷酸的碱基组成;小写字母m表示该字母m左侧相邻的一个核苷酸为甲氧基修饰的核苷酸;小写字母f表示该字母f左侧相邻的一个核苷酸为氟代修饰的核苷酸;小写字母s表示该字母左右两个核苷酸之间为硫代磷酸酯基连接。
根据权利要求1-27中任一项所述的siRNA,其中,所述反义链的5’末端核苷酸为5’-磷酸核苷酸或5’-磷酸类似物修饰的核苷酸。
根据权利要求28所述的siRNA,其中,所述5’-磷酸核苷酸为具有如式(2)所示结构的核苷酸,所述5’-磷酸类似物修饰的核苷酸选自结构如式(3)-式(6)中任意一个所示的核苷酸,
其中,R选自H、OH、甲氧基或氟;Base表示碱基,选自A、U、C、G或T。
根据权利要求1-29中任一项所述的siRNA,其中,所述siRNA为siAN1-M1P1、siAN2-M1P1、siAN1-M2P1、siAN2-M2P1、siAN1-M3P1、siAN2-M3P1、siAN1-M1SP1、siAN2-M1SP1、siAN1-M2SP1、siAN2-M2SP1、siAN1-M3SP1、siAN2-M3SP1中的任意一种:
siAN1-M1P1
正义链:5’-CmCmAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:12)
反义链:5’-P1-UmAfGmUmUmCfUmUfGfGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUm-3’(SEQ ID NO:28)
siAN2-M1P1
正义链:5’-AmGmCmCmAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:14)
反义链:5’-P1-UmAfGmUmUmCfUmUfGfGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUmUmGm-3’(SEQ ID NO:29)
siAN1-M2P1
正义链:5’-CmCmAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:12)
反义链:5’-P1-UmAfGmUmUmCfUmUmGmGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUm-3’(SEQ ID NO:30)
siAN2-M2P1
正义链:5’-AmGmCmCmAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:14)
反义链:5’-P1-UmAfGmUmUmCfUmUmGmGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUmUmGm-3’(SEQ ID NO:31)
siAN1-M3P1
正义链:5’-CmCmAmAmGmAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:18)
反义链:5’-P1-UmAfGmUmUmCfUmUmGmGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUm-3’(SEQ ID NO:30)
siAN2-M3P1
正义链:5’-AmGmCmCmAmAmGmAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:19)
反义链:5’-P1-UmAfGmUmUmCfUmUmGmGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUmUmGm-3’(SEQ ID NO:31)
siAN1-M1SP1
正义链:5’-CmsCmsAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:20)
反义链:5’-P1-UmsAfsGmUmUmCfUmUfGfGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmsCmsUm-3’(SEQ ID NO:32)
siAN2-M1SP1
正义链:5’-AmsGmsCmCmAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmAm-3’(SEQ ID NO:22)
反义链:5’-P1-UmsAfsGmUmUmCfUmUfGfGmUmGmCmUfCmUfUmGmGmCmUmsUmsGm-3’(SEQ ID NO:33)
siAN1-M2SP1
正义链:5’-CmsCmsAmAmGfAmGfCfAfCmCmAmAmGmAmAmCmUmA...
【专利技术属性】
技术研发人员:张鸿雁,高山,康代武,孔丽娜,
申请(专利权)人:苏州瑞博生物技术有限公司,
类型:发明
国别省市:江苏;32
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