一种检测人类脊髓性肌萎缩症基因突变的飞行时间质谱核酸分析方法技术

本发明专利技术公开了一种检测人类脊髓性肌萎缩症基因突变的飞行时间质谱核酸分析方法，利用一个包括扩增引物和质谱延伸探针引物的引物组合。此方法对SMN1、SMN2、NAIP、H4F5、GTF2H2基因相关序列拷贝数进行定量检测，分析是否有缺失、缺失数量和多拷贝，从而能够直接推断临床表型严重程度；具有良好的灵敏度、特异性、稳定性与准确性，有效解决假阴性及假阳性等技术瓶颈；操作简单、成本相对较低、结果稳定可靠；通量高成本低，具有普遍的代表性和通用性，易于实现自动化和规模化检测，适合大规模人群筛查；还能对部分常见的SMN1上点突变进行基因分型检测；满足当前SMA防治中大规模人群筛查、产前诊断和常规分子诊断的需要。

A time-of-flight mass spectrometry nucleic acid analysis method for detecting gene mutations in human spinal muscular atrophy

The invention discloses a time-of-flight mass spectrometry nucleic acid analysis method for detecting gene mutation of human spinal muscular atrophy, using a primer combination including amplification primer and mass spectrum extension probe primer. This method can detect the copy number of SMN1, SMN2, NAIP, h4f5, gtf2h2 gene related sequences quantitatively, analyze whether there is deletion, deletion number and multiple copies, so as to directly infer the severity of clinical phenotype; it has good sensitivity, specificity, stability and accuracy, and effectively solves the technical bottleneck of false negative and false positive; it is simple in operation, relatively low in cost and knot The results are stable and reliable; the flux is high and low cost, universal and representative, easy to realize automatic and large-scale detection, suitable for large-scale population screening; it can also carry out genotyping test for some common point mutations on SMN1; it can meet the needs of large-scale population screening, prenatal diagnosis and conventional molecular diagnosis in current SMA prevention and treatment.

【技术实现步骤摘要】
一种检测人类脊髓性肌萎缩症基因突变的飞行时间质谱核酸分析方法
本专利技术涉及生物检测
，更具体地，涉及一种检测人类脊髓性肌萎缩症基因突变的飞行时间质谱核酸分析方法。
技术介绍
脊髓性肌萎缩症(SpinalMuscularAtrophy,SMA)是一组常见的常染色体隐性遗传病，居致死性常染色体隐性遗传病的第二位，活产婴儿中患者发生率为1/6000～1/10000。临床上，SMA一般分为4种类型：Ⅰ型(又称Werding-Hoffman病)是最严重的亚型(重型)，约占SMA患者的一半，发病急、进展快，一般在出生6个月之内发病，多于2岁之内死亡；SMAⅡ型为慢性婴儿型(中间型)，通常在7～18个月内发病，大多可以存活10～20岁；SMAⅢ型(又称Wohlfart-Kugelberg-Welander病)为青少年型(轻型)，出生18个月后才发病，病情发展缓慢，一般可存活至成年，多因呼吸肌麻痹或全身功能衰竭死亡；SMAⅣ型则为成年型(极轻型)，一般于20～30岁以后发病，主要表现为缓慢逐渐发生的上下肢近端无力和肌肉萎缩，成年期都能够行走。总本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一个用检测人类脊髓性肌萎缩症基因突变的引物组合，其特征在于，包括扩增引物和质谱延伸探针引物，其中扩增引物为核苷酸序列如SEQ ID NO：1～22所示序列中的一条或多条，质谱延伸探针引物为核苷酸序列如SEQ ID NO：23～35所示序列中的一条或多条。/n

【技术特征摘要】
1.一个用检测人类脊髓性肌萎缩症基因突变的引物组合，其特征在于，包括扩增引物和质谱延伸探针引物，其中扩增引物为核苷酸序列如SEQIDNO：1～22所示序列中的一条或多条，质谱延伸探针引物为核苷酸序列如SEQIDNO：23～35所示序列中的一条或多条。


2.权利要求1所述的引物组合在制备同时检测SMN1、SMN2、NAIP、GTF2H2和/或H4F5基因型及拷贝数的产品中的应用。


3.一种人类脊髓性肌萎缩症基因检测试剂盒，其特征在于，包括权利要求1所述引物组合。


4.根据权利要求3所述的人类脊髓性肌萎缩症基因检测试剂盒，其特征在于，还包括多重PCR反应试剂、单碱基延伸反应试剂和去dNTP混合物反应试剂。


5.根据权利要求3所述的人类脊髓性肌萎缩症基因检测试剂盒，其特征在于，权利要求1所述引物组合为含有核苷酸序列如SEQIDNO：1～22所示序列中的一条或多条的PCR反应扩增引物混合液和核苷酸序列如SEQIDNO：23～35所示序列中的一条或多条的延伸引物混合液。


6.根据权利要求5所述的人类脊髓性肌萎缩症基因检测试剂盒，其特征在于，...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨学习，周万军，吴英松，朱安娜，李明，徐惠玲，李婕，
申请(专利权)人：广州市达瑞生物技术股份有限公司，
类型：发明
国别省市：广东;44