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一种用于基因组步移的步移引物及其应用的PCR方法技术

技术编号:21847051 阅读:47 留言:0更新日期:2019-08-13 23:28
本发明专利技术提供一种用于基因组步移的步移引物及其应用的PCR方法,其中步移引物包括用于基因组步移PCR反应的三套步移引物,分别为NSP1、NSP2、NSP3,每套所述步移引物包括分别用于三轮PCR反应的3条引物,分别为NSPx‑P、NSPx‑S、NSPx‑T,x=1、2、3,其长度均为25nt,同一套步移引物3’端的12个碱基完全相同,5’端的13个碱基序列完全不同。本发明专利技术涉及的PCR方法能够根据已知基因组DNA序列,高效获取侧翼未知序列,具有高效、简便、特异性高、灵敏度高、一次性获得的未知序列较长等特点。

A Step-by-Step Primer for Genome Walking and Its Application in PCR

【技术实现步骤摘要】
一种用于基因组步移的步移引物及其应用的PCR方法
本专利技术涉及PCR步移
,具体涉及一种用于基因组步移的步移引物及其应用的PCR方法。
技术介绍
基因组步移技术(GenomeWalking)是一种重要的分子生物学研究技术,使用这种技术可以有效获取与已知序列相邻的未知序列。染色体步移技术主要有以下几方面的应用:1.根据已知的基因或分子标记连续步移,获取人、动物和植物的重要调控基因,可以用于研究结构基因的表达调控。如分离克隆启动子并对其功能进行研究;2.查获取新物种中基因的非保守区域,从而获得完整的基因序列;3.鉴定T-DNA或转座子的插入位点,鉴定基因枪转基因法等转基因技术所导致的外源基因的插入位点等;4.用于染色体测序工作中的空隙填补,获得完整的基因组序列;5.用于人工染色体PAC、YAC和BAC的片段搭接。对于基因组测序已经完成的少数物种(如人、小鼠、线虫、水稻、拟南芥等)来说,可以轻松地从数据库中找到某物种已知序列的侧翼序列。但是,对于大多数生物而言,在不了解它们的基因组序列以前,想要知道一个已知区域两侧的DNA序列,只能采用染色体步移技术。以PCR(Polymerase本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于基因组步移的步移引物,其特征在于,包括用于基因组步移PCR反应的三套步移引物,分别为NSP1、NSP2、NSP3,每套所述步移引物包括分别用于三轮PCR反应的3条引物,分别为NSPx‑P、NSPx‑S、NSPx‑T,x=1、2、3,其长度均为25nt,同一套步移引物3’端的12个碱基完全相同,5’端的13个碱基序列完全不同。

【技术特征摘要】
1.一种用于基因组步移的步移引物,其特征在于,包括用于基因组步移PCR反应的三套步移引物,分别为NSP1、NSP2、NSP3,每套所述步移引物包括分别用于三轮PCR反应的3条引物,分别为NSPx-P、NSPx-S、NSPx-T,x=1、2、3,其长度均为25nt,同一套步移引物3’端的12个碱基完全相同,5’端的13个碱基序列完全不同。2.根据权利要求1所述的用于基因组步移的步移引物,其特征在于,在所述NSP1、NSP2和NSP3中,其G-C含量均为45-55%,Tm值为:Tm=4℃(G+C)+2℃(A+T)。3.根据权利要求1所述的用于基因组步移的步移引物,其特征在于,NSP1-P、NSP1-S、NSP1-T、NSP2-P、NSP2-S、NSP2-T、NSP3-P、NSP3-S、NSP3-T的序列依次如SEQIDNO.1至SEQIDNO.9所示。4.一种使用权利要求1所述的用于基因组步移的步移引物的PCR方法,其特征在于,包括以下步骤:第一轮PCR反应:与待测DNA已知序列互补的SP1和步移引物NSP1对待测DNA模板进行PCR反应;第二轮PCR反应:以与待测DNA已知序列互补的SP2和步移引物NSP2为扩增引物,以第一轮PCR的产物为模板进行PCR反应,所述SP2位于SP1的5’端至3’端的内侧;第三轮PCR反应:以与待测DNA已知序列互补的SP3和步移引物NSP3为扩增引物,以第二轮PCR的产物为模板进行PCR反应,所述SP3位于SP2的5’端至3’端的内侧。5.根据权利要求4所述的用于基因组步移的PCR方法,其特征在于,在所述NSP1、NSP2和NSP3中,其G-C含量均为45-55%,Tm值为:Tm=4℃(G+C)+2℃(A+T)。6.根据权利要求...

【专利技术属性】
技术研发人员:蔡庆贤汪梦兰高志良
申请(专利权)人:蔡庆贤
类型:发明
国别省市:广东,44

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