核苷衍生物或其盐、多核苷酸合成试剂、多核苷酸的制备方法、多核苷酸以及结合核酸分子的制备方法技术

本发明专利技术提供新型核苷衍生物或其盐、多核苷酸合成试剂、多核苷酸的制备方法、多核苷酸以及结合核酸分子的制备方法。本发明专利技术的核苷衍生物或其盐由下列化学式(1)表示。

Nucleoside derivatives or salts, polynucleotide synthesis reagents, preparation methods of polynucleotides, preparation methods of polynucleotides and binding nucleic acid molecules

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】核苷衍生物或其盐、多核苷酸合成试剂、多核苷酸的制备方法、多核苷酸以及结合核酸分子的制备方法
本专利技术涉及核苷衍生物或其盐、多核苷酸合成试剂、多核苷酸的制备方法、多核苷酸以及结合核酸分子的制备方法。
技术介绍
为了分析样本中的靶标，使用与靶标结合的结合分子。除抗体外，与靶标结合的结合核酸分子如适配体也用作与靶标结合的结合分子(专利文献1)。作为获得结合核酸分子的方法，SELEX(通过指数富集方法的配体系统进化(SystematicEvolutionofLigandsbyExponentialEnrichmentmethod))是已知的，其中使靶标与大量候选多核苷酸接触，然后从所述候选多核苷酸中选择与所述靶标结合的多核苷酸作为结合核酸分子。当通过SELEX方法获得结合核酸分子时，除了构成所述结合核酸分子的天然核苷分子之外，还使用通过修饰天然核苷分子获得的经修饰的核苷分子。然而，利用已知的天然核苷及其衍生物，还存在不能获得对其具有足够结合能力的结合核酸分子的靶标。因此，需要可用于例如制备适配体的经修饰的核苷衍生物。引用列表专利文献专利文献1：JP2012-200204A
技术实现思路
技术问题因此，本专利技术旨在提供新的核苷衍生物或其盐、多核苷酸合成试剂、多核苷酸的制备方法、多核苷酸以及结合核酸分子的制备方法。问题的解决方案本专利技术的核苷衍生物或其盐由以下化学式(1)表示。化学式(1)中，Su是在核苷残基处具有糖骨架的原子团或在核苷酸残基处具有磷酸糖骨架的原子团，并且可以具有或不具有保护基，L1和L2各自独立地为具有2-10个碳原子的直链或支链、饱和或不饱和烃基，X1为亚氨基(-NR1-)、醚基(-O-)或硫醚基(-S-)，且R1是氢原子或具有2-10个碳原子的直链或支链、饱和或不饱和烃基。本专利技术的多核苷酸合成试剂包含含有本专利技术的核苷衍生物或其盐的核苷酸衍生物或其盐。本专利技术的多核苷酸的制备方法包括使用含有本专利技术的核苷衍生物或其盐的核苷酸衍生物或其盐合成多核苷酸的步骤。本专利技术的多核苷酸包含作为结构单元的含有本专利技术的核苷衍生物或其盐的核苷酸衍生物或其盐。本专利技术的结合核酸分子的制备方法包括使候选多核苷酸和靶标彼此接触，并选择与所述靶标结合的候选多核苷酸作为与所述靶标结合的结合核酸分子的步骤，所述候选多核苷酸是本专利技术的多核苷酸。专利技术的有益效果本专利技术可提供新的核苷衍生物或其盐。附图说明[图1]图1A和1B是说明实施例2中α-淀粉酶结合核酸分子与淀粉酶的结合能力的图。[图2]图2A和2B是说明实施例2中分泌型免疫球蛋白A(sIgA)结合核酸分子与sIgA的结合能力的图。[图3]图3是说明实施例2中淀粉酶结合核酸分子与淀粉酶的结合能力的图。[图4]图4是说明实施例2中分泌型免疫球蛋白A(sIgA)结合核酸分子与sIgA的结合能力的图。[图5]图5是说明实施例2中毛细管电泳结果的图。[图6]图6显示了说明比较例中结合核酸分子与淀粉酶的结合能力的图。实施方案的描述(核苷衍生物或其盐)如上所述，本专利技术的核苷衍生物或其盐由下列化学式(1)表示。在化学式(1)中，Su是在核苷残基处具有糖骨架的原子团或在核苷酸残基处具有磷酸糖骨架的原子团，并且可以具有或不具有保护基，L1和L2各自独立地为具有2-10个碳原子的直链或支链、饱和或不饱和烃基，X1为亚氨基(-NR1-)、醚基(-O-)或硫醚基(-S-)，且R1是氢原子或具有2-10个碳原子的直链或支链、饱和或不饱和烃基。本专利技术的核苷衍生物具有嘌呤环状结构和嘧啶环状结构中的两种结构。因此，与具有一个嘌呤环状结构或一个嘧啶环状结构的核苷衍生物相比，本专利技术的核苷衍生物具有例如相对较大数量的能够在分子内或分子间相互作用的原子。因此，例如，与具有一个嘌呤环状结构或一个嘧啶环状结构的核苷衍生物相比，包括本专利技术的核苷衍生物的结合核酸分子对靶标具有改善的结合能力。因此，用本专利技术的核苷衍生物，可以制备例如对靶标表现出优异结合能力的结合核酸分子。在化学式(1)中，L1和L2各自独立地为具有2-10个碳原子的直链或支链、饱和或不饱和的烃基。L1的碳原子数的下限为2，其上限为10，优选为8或6，并且其范围为例如2-8、2-6。L1的碳原子数优选为2。L2的碳原子数的下限为2，其上限为10，优选为8或6，并且其范围为例如2-8、2-6。L2的碳原子数优选为2。L1和L2的具体实例包括亚乙基(-CH2-CH2-)、亚乙烯基(-CH＝CH-)、亚丙基(-CH2-CH2-CH2-)、异亚丙基(-CH2-CH(CH3)-)、亚丁基(-CH2-CH2-CH2-CH2-)、甲基亚丁基(-CH2-CH(CH3)-CH2-CH2-)、二甲基亚丁基(-CH2-CH(CH3)-CH(CH3)-CH2-)、乙基亚丁基(-CH2-CH(C2H5)-CH2-CH2-)、亚戊基(-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-)、亚己基(-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-)、亚庚基(-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-)和亚辛基(-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-)。L1优选为亚乙烯基(-CH＝CH-)。L2优选为亚乙基(-CH2-CH2-)。L1和L2可以是相同的烃基或不同的烃基。作为后者的具体实例，L1优选为亚乙烯基(-CH＝CH-)，且L2优选为亚乙基(-CH2-CH2-)。在化学式(1)中，X1是亚氨基(-NR1-)、醚基(-O-)或硫醚基(-S-)。在所述亚氨基中，R1是氢原子或具有2-10个碳原子的直链或支链、饱和或不饱和烃基，并且优选为氢原子。L1和L2的描述可以通过引用并入到具有2-10个碳原子的直链或支链、饱和或不饱和烃基的描述中。X1优选为亚氨基(-NR1-)。X1更优选为NH基。在化学式(1)中，在核苷残基处具有糖骨架的原子团没有特别限制，并且其实例包括在已知天然或人工核苷残基上具有糖骨架的原子团。在天然核苷残基处具有糖骨架的原子团的实例包括在核糖核苷残基处具有核糖骨架的原子团和在脱氧核糖核苷上具有脱氧核糖骨架的原子团。在人工核苷残基处具有糖骨架的原子团可以是，例如，在人工核苷残基处具有双环糖骨架的原子团，并且其具体实例可以是具有核糖骨架的原子团，其中ENA(2'-O，4'-C-亚乙基桥连的核酸)或LNA(锁定核酸)的2'位的氧原子和4'位的碳原子被交联。在核苷酸残基上具有磷酸糖骨架的原子团没有特别限制，其实例包括在已知天然或人工核苷酸残基处具有磷酸糖骨架的原子团。在天然核苷酸残基上具有磷酸糖骨架的原子团的实例包括在核糖核苷酸残基处具有磷酸核糖骨架的原子团和在脱氧核糖核苷酸上具有磷酸脱氧核糖骨架的原子团。在人工核苷酸残基上具有磷酸糖骨架的原子团可以是，例如，在人工核苷残基处具有磷酸双环糖骨架的原子团，其具体实例可以是具有磷酸核糖骨架的原子团，其中2'-O，4'-C-亚乙基桥连的核酸(ENA)或锁定核酸(LNA)的2'位的氧原子和4'位的碳原子被交联。在化学式(1)中，在核苷残基处具有糖骨架的原子团或在核苷酸残基处具有磷酸糖骨架的原子团优选由下列化学式(2)表示。在化学式(2)中，R2是氢原子、保护基团或由下列化学式(3)表示的基团，R3是氢原子、保护基本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.核苷衍生物或其盐，由下列化学式(1)表示：

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2016.11.28 JP 2016-2301961.核苷衍生物或其盐，由下列化学式(1)表示：其中，在所述化学式(1)中，Su是在核苷残基处具有糖骨架的原子团或在核苷酸残基处具有磷酸糖骨架的原子团，并且可以具有或不具有保护基，L1和L2各自独立地为具有2-10个碳原子的直链或支链、饱和或不饱和烃基，X1为亚氨基(-NR1-)、醚基(-O-)或硫醚基(-S-)，且R1是氢原子或具有2-10个碳原子的直链或支链、饱和或不饱和烃基。2.根据权利要求1所述的核苷衍生物或其盐，其中X1是亚氨基(-NR1-)。3.根据权利要求1或2中任一项所述的核苷衍生物或其盐，其中，L1是亚乙烯基(-CH＝CH-)。4.根据权利要求1-3中任一项所述的核苷衍生物或其盐，其中L2是亚乙基(-CH2-CH2-)。5.根据权利要求1-4中任一项所述的核苷衍生物或其盐，其中R1是氢原子。6.根据权利要求1-5中任一项所述的核苷衍生物或其盐，其中所述在核苷残基处具有糖骨架的原子团或在核苷酸残基处具有磷酸糖骨架的原子团由以下化学式(2)表示：其中，在所述化学式(2)中，R2是氢原子、保护基团或由下列化学式(3)表示的基团，R3是氢原子、保护基团或亚磷酰胺基团，R...

【专利技术属性】
技术研发人员：皆川宏贵，堀井克纪，秋富穰，金子直人，和贺岩，桑原正靖，
申请(专利权)人：日本电气方案创新株式会社，国立大学法人群马大学，
类型：发明
国别省市：日本,JP