The present invention provides a fluorescent molecular marker of Rice Waxy gene Wx and its application. The primers include RWx FG primers, RWx FT primers, RWx R primers, RWx 1 universal primers, and 2 universal primers. The sequence of the RWx FG primers is shown in SEQ ID NO:1, the sequence of the RWx FT primers is shown in SEQ ID NO:2, and the sequence of the RWx FT primers is shown in SEQ ID:NO:3, respectively. The sequence of the #1 universal primer is shown in SEQ ID NO:4 and the sequence of the #2 universal primer is shown in SEQ ID NO:5. By adopting the technical scheme of the present invention, the detection sample is amplified only once by PCR without electrophoresis detection, and the amplified data is obtained directly on the original board by fluorescence scanner; the operation is simple, fast, low cost, accurate results, and the real closed tube operation is realized.
【技术实现步骤摘要】
一种水稻蜡质基因Wx的荧光分子标记及其应用
本专利技术属于分子生物
,尤其涉及一种水稻蜡质基因Wx的荧光分子标记及其应用。
技术介绍
水稻是重要的粮食作物,世界上有100多个国家种植水稻,全球2/3的人口以水稻为主粮。随着社会经济的发展和消费水平的提高,人们对稻米品质和安全要求越来越高,优质软米具有食味佳、富有弹性、冷后不易变硬等特点被大多数消费者所喜爱。影响水稻蒸煮品质的一个重要因素是沉积于胚乳中的淀粉品质,其分为直链和支链淀粉,直链淀粉是鉴定稻米品质的主要指标之一。稻米中直链淀粉含量高,糊化温度也往往较高,胶稠度降低,从而使米饭的黏性、柔软性和光泽度变差,进而严重影响米饭的质地与食味。水稻蜡质基因(Wx)编码结合在淀粉粒上的淀粉合成酶(GBSSI)催化水稻胚乳中的直链淀粉合成。Wx基因的主要等位变异类型较复杂,在稻属栽培种中具有非常丰富的变异类型。Wxa主要存在于籼稻品种中,控制高直链淀粉含量的形成,稻米直链淀粉含量一般都在20%以上,最高的可达30%以上,导致了米饭的质地与食味降低。Wxb等位类型主要存在于粳稻品种中,直链淀粉含量相比籼稻的水稻品种低了很多,一般在15-18%。这类稻米由于直链淀粉含量中等偏低,米饭黏性、柔软性和光泽度明显优于Wxa类品种。鉴于水稻Wx基因对稻米品质的影响,而其表型鉴定受环境影响,且在籽粒成熟收获后才能进行,对低直链淀粉含量的品种选育增加了难度,因此越来越多的水稻育种研究者利用分子标记辅助选择技术进行水稻低直链淀粉品种的选育。如专利CN1330861A中介绍的采用PCR扩增的方法,但是完成后需要进行酶切、转移到琼 ...
【技术保护点】
1.一种水稻蜡质基因
【技术特征摘要】
1.一种水稻蜡质基因Wx的荧光分子标记的引物,其特征在于:包括RWx-FG引物、RWx-FT引物、RWx-R引物、#1通用引物、#2通用引物,所述RWx-FG引物的序列如SEQIDNO:1所示,所述RWx-FT引物的序列如SEQIDNO:2所示,所述RWx-R引物的序列如SEQIDNO:3所示,所述#1通用引物的序列如SEQIDNO:4所示,所述#2通用引物的序列如SEQIDNO:5所示。2.一种水稻蜡质基因Wx的荧光分子标记,其特征在于:其采用如权利要求1所述的水稻蜡质基因Wx的荧光分子标记的引物对水稻植株中的基因进行扩增,将得到的扩增引物在包含FAM、HEX和ROX三种荧光检测通道的酶标仪中进行检测,如果扫描获得HEX荧光信号,则为含Wxb等位基因;如果扫描获得FAM荧光信号,则为含Wxa等位基因。3.根据权利要求2所述的水稻蜡质基因Wx的荧光分子标记,其特征在于:其采用以下步骤实施:步骤S1,提取水稻植株的基因组DNA;步骤S2,将RWx-FG引物、RWx-FT引物、RWx-R引物、#1通用引物、#2通用引物同时加入到PCR反应体系中进行扩增获得PCR产物,其中PCR的反应程序为:94℃,3min;然后10个循环94℃,...
【专利技术属性】
技术研发人员:邓国富,黄娟,高利军,戴高兴,卿冬进,高菊,梁海福,伍豪,周维永,周萌,陈韦韦,
申请(专利权)人:广西壮族自治区农业科学院,
类型:发明
国别省市:广西,45
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