【技术实现步骤摘要】
一种混合库基因编辑T1代烟株筛选方法
本专利技术涉及计算机软件领域，具体涉及一种用于基因编辑育种中的高效准确混合库基因编辑T1代的海量烟株筛选方法。
技术介绍
基因编辑育种技术已被广泛用于各种植物的基因组修饰中，如拟南芥、水稻和烟草等。随着烟草基因编辑育种工厂的建成和素材创制的快速推进，海量基因编辑素材被创制出来，这些编辑素材在烟株表型筛选上成为关注重点，但相似烟株表型的烟叶化学成分及生理生化指标上具有差异。因此如何对海量的编辑素材进行烟株的高效精准筛选成为一个亟待解决的问题。由于烟株的筛选涉及烟株选择、烟叶样品采集及处理分析反馈等多个步骤，包括需要烟叶样品采集的烟株选择、烟株采样标记、特殊表型记录、烟叶采集装袋、烟叶冻存、烟叶冷冻干燥、烟叶磨碎、烟叶粉末存储、检测和验余样品的处理，最终根据烟叶的检测结果的反馈对海量的烟草烟株重新筛选等，以上流程的大部分工作通常在远离电脑端进行，传统采用人工用记号笔将烟株编码抄写至样品袋或者样品管上，再逐步将编码录入电脑端，这些操作对人员素质要求高，极容易产生各类差错，严重影响样品管理过程进而影响烟叶编辑素材的高效精确筛选。同时采...
【技术保护点】
1.一种混合库基因编辑T1代烟株筛选方法，其特征在于，包括：(1)使用掌上电脑采集样品信息并与服务器终端进行无线连接；(2)根据掌上电脑与服务器终端无线连接的结果对烟叶样品进行管理，实时完成需进行烟叶样品采集的烟株的筛选、烟叶样品的采集、签收、处理、存储、派样、检测、验余样品存储和验余样品处置的操作；并将检测结果反馈给烟株种植人员，从而完成混合库基因编辑T1代烟株筛选。
【技术特征摘要】
1.一种混合库基因编辑T1代烟株筛选方法，其特征在于，包括：(1)使用掌上电脑采集样品信息并与服务器终端进行无线连接；(2)根据掌上电脑与服务器终端无线连接的结果对烟叶样品进行管理，实时完成需进行烟叶样品采集的烟株的筛选、烟叶样品的采集、签收、处理、存储、派样、检测、验余样品存储和验余样品处置的操作；并将检测结果反馈给烟株种植人员，从而完成混合库基因编辑T1代烟株筛选。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述步骤(2)，其包括：(21)对基因编辑后的烟株T0代种子进行点种和编码，在并在苗期进行DNA测序，将烟株的DNA测序结果及对应的烟株编码上传至服务器终端；所述T0代种子为基因编辑再生苗烟株的种子，所述T1代烟株为T0代种子种出来的苗烟株；(22)观察哪些烟株已经达到现蕾期，使用掌上电脑对现蕾期烟株编码进行扫描，根据烟株编码对应的DNA测序结果和是否为首次采集对烟株进行筛选是否进行烟叶采集，从而完成烟株的筛选操作；(23)采集烟叶样品装入样品袋中并封口，通过蓝牙连接便携式打印机进行样品编码并打印，将打印后的样品编码贴在样品袋上并上传至服务器终端，从而完成烟叶样品采集的操作；(24)烟叶样品处理部门对采集的烟叶样品进行处理，然后存储在编码对应的固定位置，并采用掌上电脑扫描样品编码将存储位置上传至服务器终端，从而完成烟叶样品处理和存储操作；(25)烟叶样品派送部门将存储的烟叶样品派送给相应的检测人员并上传至服务器终端，从而完成烟叶样品派送操作；(26)检测完成后剩余样品退给样品存储部门，存储部门使用掌上电脑进行编码后存储，并上传至服务器终端；(27)样品检测人员将检测结果在电脑上记录并将上传给服务器终端，烟株种植人员根据检测结果及烟株表型记录情况完成混合库基因编辑T1代烟株筛选工作。3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述步骤(21)，其包括：(211)对基因编辑后的分化苗烟株进行挂牌编码，每棵分化苗烟株均有其对应的独立编码；(212)在苗期进行分子采样并进行DNA测序，测序分两步进行：第一步测序烟株是否有sgRNA插入，第二步测序烟株是否有基因编辑；(213)将烟株的DNA测序结果及对应的烟株编码上传至服务器终端。4.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述步骤(22)，其包括：(221)使用掌上电脑对烟株编码进行扫描，根据服务器终端进行判定烟株是否为首次烟叶采集，若是则是需要采集烟叶样品的烟株；反之则不采集烟叶样品；(222)得到步骤(221)为需要采集的烟株，继续使用掌上电脑对烟株编码进行扫描，根据服务器终端对应的DNA测序结果判断是否采集烟叶样品。5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述步骤(222)，...
【专利技术属性】
技术研发人员：李雪梅，高茜，曾婉俐，向海英，杨光宇，米其利，李晶，黄海涛，宋春满，
申请(专利权)人：云南中烟工业有限责任公司，
类型：发明
国别省市：云南,53
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