基因检测产品探针分管组合的优化方法、装置及系统制造方法及图纸

本发明专利技术实施例公开了一种基因检测产品探针分管组合的优化方法、装置及系统，该方法包括：获取基因检测产品对应基因组合的覆盖区域信息以及探针分管集合中各个探针分管的探针分管信息，所述探针分管信息包括探针分管所包含的探针和各个探针所对应的基因检测区域；利用预设的探针分管组合优化模型，根据所述覆盖区域信息和探针分管信息确定优化后的探针分管组合结果，所述探针分管组合结果为构建所述探针分管组合所需要的目标探针分管。本发明专利技术通过建立基因检测产品的探针分管组合优化模型，以产品所要求的覆盖区域为限制条件，能够快速地求解出覆盖区域最小的探针分管组合结果，降低探针分管组合成本，提高了整个基因检测产品的设计效率。

The Optimized Method, Device and System for Probe Combination of Gene Detection Products

The embodiment of the present invention discloses an optimization method, device and system for probes in gene detection products. The method includes acquiring information about the coverage area of corresponding gene combinations in gene detection products and probes in probes in probes in probes in probes in a collection of probes. The probes in a collection of probes include probes in the probes in the probes in the probes in the probes and corresponding genes in the probes in the probes in the probes in a collection of probes. Detection area; Using the preset optimization model of probe branch combination, the optimized result of probe branch combination is determined according to the coverage area information and probe branch information. The result of probe branch combination is the target probe branch needed to construct the probe branch combination. By establishing an optimization model of probe division combination of gene detection products, the method can quickly solve the minimum probe division combination result of the coverage area, reduce the cost of probe division combination, and improve the design efficiency of the whole gene detection product under the restriction of the coverage area required by the product.

【技术实现步骤摘要】
基因检测产品探针分管组合的优化方法、装置及系统
本专利技术涉及计算机
，尤其涉及一种基因检测产品探针分管组合的优化方法、装置及系统。
技术介绍
随着精准医疗在肿瘤诊断和治疗领域中的推广和为大众所接受，基因检测技术日趋从标准化的产品类型向以用户为导向的多形态产品转化。在从科研实验室走向产品化、商业化的过程中，基因检测产品设计中所面对的一个大的挑战是如何达到探针分管组合最优化，以降低基因检测产品的成本，从而实现该产品的市场竞争力。目前，基因检测的探针分管是探针订购的最小单位，其中包括了近200条的探针。而一个分管内包含的探针，订购后，就是相对固定的。因此一个分管隐含着一片固定的探测区域。分管内的探针可能覆盖单个或者多个基因的检测区域。一个基因检测产品包含的基因可能存在于多个分管中，同时一个分管也可能被多个基因检测产品征用，具体关系如图2中所示。在基因检测的产品设计中，探针分管组合的设计是一个核心环节。通常，基因检测的探针分管组合的设计由产品研发人员完成。目前，与本专利技术最相似的实现方案是针对产品的多种探针分管组合进行穷举试错法的方法，这种方法结合设计者的个人经验，对不同的组合进行本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种基因检测产品探针分管组合的优化方法，其特征在于，所述方法包括：获取基因检测产品对应基因组合的覆盖区域信息以及探针分管集合中各个探针分管的探针分管信息，所述探针分管信息包括探针分管所包含的探针和各个探针所对应的基因检测区域；利用预设的探针分管组合优化模型，根据所述覆盖区域信息和探针分管信息确定优化后的探针分管组合结果，所述探针分管组合结果为构建所述探针分管组合所需要的目标探针分管，其中，在所述探针分管组合优化模型中，覆盖区域作为约束条件，覆盖区域的最小值作为优化目标，探针分管是否应用在所述基因检测产品的探针分管组合作为所述探针分管组合优化模型的输出结果。

【技术特征摘要】
1.一种基因检测产品探针分管组合的优化方法，其特征在于，所述方法包括：获取基因检测产品对应基因组合的覆盖区域信息以及探针分管集合中各个探针分管的探针分管信息，所述探针分管信息包括探针分管所包含的探针和各个探针所对应的基因检测区域；利用预设的探针分管组合优化模型，根据所述覆盖区域信息和探针分管信息确定优化后的探针分管组合结果，所述探针分管组合结果为构建所述探针分管组合所需要的目标探针分管，其中，在所述探针分管组合优化模型中，覆盖区域作为约束条件，覆盖区域的最小值作为优化目标，探针分管是否应用在所述基因检测产品的探针分管组合作为所述探针分管组合优化模型的输出结果。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法还包括：将得到的所述探针分管组合结果发送给用户终端。3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于，所述方法还包括：若利用预设的探针分管组合优化模型，根据所述覆盖区域信息和探针分管信息，无法得到探针分管组合结果时，则在所述探针分管集合中添加探针分管；利用预设的探针分管组合优化模型，根据所述覆盖区域信息和更新后的探针分管集合中各个探针分管的探针分管信息，确定优化后的探针分管组合结果。4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述获取基因检测产品对应基因组合的覆盖区域信息以及探针分管集合中各个探针分管的探针分管信息，包括：从预先设置的数据库中获取所述覆盖区域信息和所述探针分管信息。5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述方法还包括:将添加到所述探针分管集合中的探针分管的探针分管信息加入所述预先设置的数据库。6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述探针分管组合优化模型采用0/1整数线性规划模型实现，其中，覆盖区域...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨韩雁，叶亦舟，李英丹，
申请(专利权)人：上海思路迪生物医学科技有限公司，
类型：发明
国别省市：上海,31