诊断儿童呼吸道病毒感染的生物标志物制造技术

本发明专利技术公开了诊断儿童呼吸道合胞病毒感染的生物标志物，所述生物标志物可以辅助诊断儿童呼吸道合胞病毒感染。本发明专利技术同时公开了至少两个与儿童呼吸道合胞病毒相关的生物标志物的组合，所述儿童呼吸道合胞病毒可与生物信息学方法结合使用，本发明专利技术还公开了与生物标志物相关的产品。

Biomarkers for the diagnosis of respiratory viral infections in children

The invention discloses a biomarker for diagnosis of respiratory syncytial virus infection in children, and the biomarker can assist in diagnosis of respiratory syncytial virus infection in children. The invention also discloses at least two combinations of biomarkers related to children's respiratory syncytial virus, which can be used in combination with bioinformatics methods, and the invention also discloses products related to biomarkers.

【技术实现步骤摘要】
诊断儿童呼吸道病毒感染的生物标志物
本专利技术属于生物医药领域，涉及诊断儿童呼吸道病毒感染的生物标志物。
技术介绍
呼吸道合胞病毒(Respiratorysyncytialvirus，RSV)是近年来临床上小儿呼吸道感染的重要病原之一，该病毒在全球范围内感染，并有明显的季节流行趋势，冬春季节高发。RSV可以引起上呼吸道感染症状(如感冒等)，也可以引起下呼吸道感染症状(如细支气管炎和肺炎等)。据美国疾病控制中心(CDC)的数据显示，超过一半的儿童在1岁前都感染过RSV，到2岁几乎所有的儿童都有至少一次RSV感染。25％～40％的儿童有细支气管炎和肺炎的症状，0.5％～2％的儿童因RSV感染需要住院治疗，而严重的RSV感染者可导致死亡。RSV感染能够调节宿主基因表达，影响宿主抗病毒应答和病毒复制，但是目前仍缺乏有效的基因来分析儿童呼吸道合胞病毒感染的发病机理。高通量测序技术的快速发展和应用，为儿童呼吸道合胞病毒感染发病机理的研究提供了更加全面和快速的分析手段，也为儿童呼吸道合胞病毒感染的进一步治疗方案提供崭新思路。RSV感染可引发全身性免疫应答。在RSV感染过程中，免疫细胞通过血液的运输在循环中发育，进入中央和周围淋巴结器官，最后迁移到感染灶。外周血作为储存免疫细胞的场所，提供了全部的反映免疫相关细胞和信号通路的素材。深入研究儿童呼吸道合胞病毒感染相关基因的调控机制，有助于了解儿童呼吸道合胞病毒感染的遗传分子机制，为呼吸道合胞病毒感染的诊断以及治疗提供理论依据和临床手段。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术的目的在于提供可用于诊断儿童呼吸道病毒感染的生物标志物，以期实现儿童呼吸道病毒感染的早期诊断。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术的第一方面提供了检测基因表达水平的试剂在制备诊断儿童呼吸道合胞病毒感染产品中的应用，所述基因包括GYG1、LMNB1的一种或两种。本专利技术的第二方面提供了检测基因表达水平的试剂在制备诊断儿童呼吸道合胞病毒感染产品中的应用，所述基因包括GYG1、LMNB1、GPR84或IFI27的两种或多种。进一步，检测基因表达水平的试剂选自：特异性识别所述基因的探针；或特异性扩增所述基因的引物；或特异性结合所述基因编码的蛋白的特异性结合剂；本专利技术的第三方面提供了一种产品，所述述产品包括检测基因表达水平的试剂，所述基因包括GYG1、LMNB1的一种或两种。本专利技术的第四方面提供了一种产品，所述述产品包括检测基因表达水平的试剂，所述基因包括GYG1、LMNB1、GPR84或IFI27中的两种或多种。进一步，所述产品包括芯片、试剂盒、核酸膜条。进一步，所述试剂选自：特异性识别所述基因的探针；或特异性扩增所述基因的引物；或特异性结合所述基因编码的蛋白的特异性结合剂。本专利技术的第五方面提供了本专利技术第三方面或本专利技术第四方面所述的产品在制备诊断儿童呼吸道合胞病毒感染的工具中的应用。本专利技术的第六方面提供了基因标志物在构建诊断儿童呼吸道合胞病毒感染的计算模型中的应用，所述基因标志物包括GYG1或LMNB1。本专利技术的第七方面提供了基因标志物在构建诊断儿童呼吸道合胞病毒感染的计算模型中的应用，所述基因标志物包括GYG1、LMNB1、GPR84或IFI27中的两种或多种。本专利技术的优点和有益效果：本专利技术首次发现了GYG1和LMNB1与儿童呼吸道合胞病毒感染相关，通过检测受试者外周血中上述基因的表达水平，可以实现儿童呼吸道病毒感染的准确诊断。本专利技术首次发现了GYG1、LMNB1、GPR84、IFI27中的几种进行联合诊断，具有较高的特异性和敏感性以及准确性。附图说明图1是生物标志物在呼吸道合胞病毒感染儿童中的表达情况图，其中，图A是GYG1，图B是LMNB1，图C是GPR84，图D是IFI27。具体的实施方式本专利技术经过广泛而深入的研究，通过大量筛选，首次发现了在儿童呼吸道合胞病毒感染患者中呈现差异表达的基因，为儿童呼吸道合胞病毒感染的早期检测寻找更好的途径和方法。基因标志物“基因标志物”也称为“分子标志物”、“生物标志物”，是在组织或细胞中的表达水平与正常或健康细胞或组织的表达水平相比发生改变的任何基因或蛋白。本文包含用于检测分子标志物表达的现有技术中任何可用方法。本专利技术分子标志物的表达可在核酸水平上被检测(如，RNA转录物)或蛋白质水平。通过“检测表达”旨在确定RNA转录物或其分子标志物基因的表达产物的数量或存在。因此，“检测表达”包含一分子标志物被确定不能被表达、不能被检测表达，表达在低水平、表达在正常水平或过表达的实例。为了确定过表达，被检测的所述身体样本能够与相应的来自健康人的身体样本比较。那就是说，所述表达的“正常”水平是分子标志物的表达水平。这个样本可以以标准化形式呈现。在一些实施例中，分子标志物过表达的确定需比较身体样本和相应来自健康人的身体样本。本领域技术人员将认识到，本专利技术的实用性并不局限于对本专利技术的标志物基因的任何特定变体的基因表达进行定量。作为非限制性的实例，一种代表性的人GYG1、LMNB1、GPR84、IFI27基因的核苷酸序列如目前国际公共核酸数据库GeneBank中NC_000003.12(148991408..149027669)、NC_000005.10(126776623..126837020)、NC_000012.12(54362445..54365224,complement)、NC_000014.9(94110733..94116699)中所示。本专利技术的多核苷酸可以是DNA形式或RNA形式。DNA形式包括cDNA、基因组DNA或人工合成的DNA。DNA可以是单链的或是双链的。DNA可以是编码链或非编码链。本专利技术的多肽可以是重组多肽、天然多肽、合成多肽，优选重组多肽。本专利技术的多肽还可包括或不包括起始的甲硫氨酸残基。编码本专利技术所述蛋白的成熟多肽的多核苷酸包括：只编码成熟多肽的编码序列；成熟多肽的编码序列和各种附加编码序列；成熟多肽的编码序列(和任选的附加编码序列)以及非编码序列。术语“编码多肽的多核苷酸”可以是包括编码此多肽的多核苷酸，也可以是还包括附加编码和/或非编码序列的多核苷酸。本专利技术还涉及上述多核苷酸的变异体，其编码与本专利技术有相同的氨基酸序列的多肽或多肽的片段、类似物和衍生物。此多核苷酸的变异体可以是天然发生的等位变异体或非天然发生的变异体。这些核苷酸变异体包括取代变异体、缺失变异体和插入变异体。如本领域所知的，等位变异体是一个多核苷酸的替换形式，它可能是一个或多个核苷酸的取代、缺失或插入，但不会从实质上改变其编码多肽的功能。检测方法本专利技术可以使用本领域普通技术人员已知的多种核酸以及蛋白技术进行检测，这些技术包括但不限于：核酸测序、核酸杂交、核酸扩增技术、蛋白免疫技术。本专利技术所述核酸扩增技术选自聚合酶链式反应(PCR)、逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)、转录介导的扩增(TMA)、连接酶链式反应(LCR)、链置换扩增(SDA)和基于核酸序列的扩增(NASBA)。其中，PCR需要在扩增前将RNA逆转录成DNA(RT-PCR)，TMA和NASBA直接扩增RNA。通常，PCR使用变性、引物对与相反链的退火以及引物延伸的多个循环，以指数方式增加靶核酸序列的拷本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.检测基因表达水平的试剂在制备诊断儿童呼吸道合胞病毒感染产品中的应用，其特征在于，所述基因包括GYG1、LMNB1的一种或两种。

【技术特征摘要】
1.检测基因表达水平的试剂在制备诊断儿童呼吸道合胞病毒感染产品中的应用，其特征在于，所述基因包括GYG1、LMNB1的一种或两种。2.检测基因表达水平的试剂在制备诊断儿童呼吸道合胞病毒感染产品中的应用，其特征在于，所述基因包括GYG1、LMNB1、GPR84或IFI27的两种或多种。3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于，所述试剂选自：特异性识别所述基因的探针；或特异性扩增所述基因的引物；或特异性结合所述基因编码的蛋白的特异性结合剂。4.一种产品，其特征在于，所述述产品包括检测基因表达水平的试剂，所述基因包括GYG1、LMNB1的一种或两种。5.一种产品，其特征在于，所述述产品包括检测基因表达水平的试剂，所述基因包括GYG1、L...

【专利技术属性】
技术研发人员：李然然，
申请(专利权)人：李然然，
类型：发明
国别省市：山东,37