水稻抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记方法及其应用技术

本发明专利技术涉及水稻品种抗条纹叶枯病基因qSTV11‑i的分子标记方法，用分子标记RM26801引物或者用分子标记H02‑10引物或者用分子标记Hiri3引物或者用分子标记Hiri9引物扩增水稻或育种材料DNA，如果用分子标记RM26801引物能够扩增出166bp的扩增片段，或用分子标记H02‑10引物能够扩增出170bp的扩增片段，或用分子标记Hiri3引物能够扩增出193bp的扩增片段，或用分子标记H iri9引物能够扩增出167bp的扩增片段，则标志着水稻品种抗条纹叶枯病基因qSTV11‑i的存在。本发明专利技术所述方法可预测其对条纹叶枯病的抗性水平，大大提高抗条纹叶枯病的选择效率。

Molecular marker method for rice stripe resistance gene qSTV11-i and its application

The invention relates to the molecular marker method of rice variety qSTV11 I, which is used to mark RM26801 primers with molecular markers or to mark H02 10 primers with molecular markers or to amplify rice or breeding material DNA with molecular marker Hiri3 primers or molecular marker Hiri9 primers. If molecular marker RM26801 primers can be used to amplify 166bp The amplified fragment of 170bp can be amplified by the molecular marker H02 10 primers, or the amplified fragment of 193bp can be amplified by molecular marker Hiri3 primers, or the amplified fragment of 167bp can be amplified with the molecular marker H iri9 primers, which indicates the existence of the rice variety resistance to stripe leaf blight gene qSTV11 I. The method can predict its resistance level to stripe leaf disease and greatly improve the selection efficiency of resistance to stripe disease.

【技术实现步骤摘要】
水稻抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记方法及其应用
本专利技术属于分子遗传学领域，具体涉及一种水稻抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记及其应用。
技术介绍
水稻是我国重要粮食作物。RSV侵染水稻后，水稻心叶沿叶脉呈现断续的黄绿色或黄白色短条斑，以后合并成大片，病叶的一半或大半变成黄白色，但在其边缘部分仍呈现断续的褪绿短条斑。稻条纹叶枯病的病株率与有效穗关系密切，病株率越高，每亩有效穗数越少。据测定病株率在10％以下时，产量损失平均<4％，病株率>10％时，产量损失随病株率增加而上升，病株率>50％时，产量损失率平均达60％。因此，最为经济有效而不造成污染的防治措施是抗病品种的应用。Washio等在日本陆稻品种中发现了两个主效的抗条纹叶枯病显性互补基因，Stv-a，Stv-b，其中Stv-a位于第6染色体短臂上，与角质胚乳Wx基因和光敏感基因Se-1连锁。随后，在籼稻品种Modan中定位到一个不完全显性基因Stvb-i，其与Stv-b等位(Washioetal.1968a,1968b,1968c)，最终将该基因位于11染色体长臂约286kb的区间内(Hayano-Saitoetal.1998,2000)。在对一些抗性品种的QTL定位中，又陆续发现了数个抗RSV的主效QTL。丁秀兰等(2004，2005)利用重组自交系群体DV85/Kinmaze和回交重组自交系群体Nipponbare/Kasalath//NipponbareL将基因定位于第11染色体S2260-G257标记区间内。Maeda等(2004，2006)发现陆稻品种Kanto72携带了一个主效的抗RSV位点，其位于第11染色体的相同区间内。Wu等(2009)在品种Dular中检测到了3个抗性QTL，一个位于第3染色体，另两个位于第11染色体相邻的标记区间RM287-RM209和RM209-RM21。Zhang等(2010)利用窄叶青8号/京系17的加倍单倍体群体，定位到一个位于11染色体稳定表达的QTL，其位于区间CT533-CT224内。近几年，随着研究的不断深入，数个抗条纹叶枯病基因得到了进一步的精细定位。利用抗病品种特青和感病品种Lemont构建的染色体单片段代换系，将抗性QTLqSTV11TQ定位于11染色体标记CAPs3-CAPs2之间，55.7kb的区间内(Wuetal.2010)。Zhang等(2011)将来源于Kasalath的抗性基因qSTV11KAS定位在同一染色体标记C1-R53，39.2kb的区间内。Zhang等(2012)又将来源于抗性品种Habataki的两个QTL(qSTV11HAB-1andqSTV11HAB-2)分别定位于11染色体R15-RM209和R69-R73两个相邻的区间内，区间大小分别为333kb和203kb。其中，qSTV11HAB-1包含qSTV11KAS区间。利用构建的近等基因系群体，将来自品种Shingwang的抗性基因qSTV11SG定位于11染色体标记InDel11-InDel5之间，约150kb的区间内(Kwonetal.2012)，该区间包含qSTV11-i和qSTV11TQ的定位区间，与qSTV11HAB-1定位区间存在部分重叠。综上，利用不同的定位群体，均在第11染色体长臂检测到一个稳定表达的主效QTL，相信这些抗性基因在条纹叶枯病抗性遗传中起到了至关重要的作用。由于抗病性鉴定的复杂性，利用常规育种手段往往难以有效地聚合不同的抗病基因。而在找到与抗病基因紧密连锁或共分离的分子标记的基础上，借助分子标记辅助选择(Marker-assistedselection,MAS)技术则可以有目的地进行抗病基因或QTL的聚合，选育持久抗性品种，延缓抗病品种的退化年限。
技术实现思路
本专利技术的目的是：提供了水稻品种IR24抗条纹叶枯病中抗基因qSTV11-i的分子标记及其应用，通过检测与这些抗褐飞虱主基因连锁的分子标记，可以预测水稻植株的条纹叶枯病抗性，加快抗条纹叶枯病水稻的选择进度。为实现上述目的，本专利技术采用的技术方案如下：本专利技术提供一种水稻抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记方法，用分子标记RM26801引物：SEQIDNO.1/SEQIDNO.2或者用分子标记H02-10引物：SEQIDNO.3/SEQIDNO.4或者用分子标记Hiri3引物：SEQIDNO.5/SEQIDNO.6或者用分子标记Hiri9引物：SEQIDNO.7/SEQIDNO.8扩增水稻或育种材料DNA，如果用分子标记RM26801引物能够扩增出166bp的扩增片段，或用分子标记H02-10引物能够扩增出170bp的扩增片段，或用分子标记Hiri3引物能够扩增出193bp的扩增片段，或用分子标记Hiri9引物能够扩增出167bp的扩增片段，则标志着水稻品种抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的存在。本专利技术还提供一种抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记：RM26801引物：前引物序列GCCTTCATCCGTAAATCCATAAGC(如SEQIDNO.1所示)后引物序列GAGTACCACATGGCATTATGAGAGC(如SEQIDNO.2所示)。本专利技术还提供一种抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记H02-10引物：前引物序列TTTTGCCTGCCTTCCTTAT(如SEQIDNO.3所示)后引物序列TGTTTATTGGTTCTGTTATGCC(如SEQIDNO.4所示)。本专利技术还提供一种抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记Hiri3引物：前引物序列CGATTCTACGTTAACTTTCC(如SEQIDNO.5所示)后引物序列TGTTGACCAACTCAGCAA(如SEQIDNO.6所示)。本专利技术还提供一种抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记Hiri9引物：前引物序列ATACCTCCCAGAGTCCCAGT(如SEQIDNO.7所示)后引物序列GCACCCACCAATCCTTTT(如SEQIDNO.8所示)。本专利技术还提供所述抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记方法、所述分子标记RM26801、分子标记H02-10、分子标记Hiri3或分子标记Hiri9在水稻育种中的应用。本专利技术还提供所述抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记方法、所述分子标记RM26801、分子标记H02-10、分子标记Hiri3或分子标记Hiri9在鉴定抗条纹叶枯病植物品种或品系中的应用。本专利技术所述的鉴定抗条纹叶枯病植物品种或品系中的应用，具体为用分子标记RM26801引物：SEQIDNO.1/SEQIDNO.2或者用分子标记H02-10引物：SEQIDNO.3/SEQIDNO.4或者用分子标记Hiri3引物：SEQIDNO.5/SEQIDNO.6或者用分子标记Hiri9引物：SEQIDNO.7/SEQIDNO.8扩增待鉴定水稻或育种材料DNA，并检测扩增产物，如果用分子标记RM26801引物能够扩增出166bp的扩增片段，或用分子标记H02-10引物能够扩增出170bp的扩增片段，或用分子标记Hiri3引物能够扩增出193bp的扩增片段，或用分子标记Hiri本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种水稻抗条纹叶枯病基因qSTV11‑i的分子标记方法，其特征在于用分子标记RM26801引物：SEQ IDNO.1/SEQ ID NO.2或者用分子标记H02‑10引物：SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4或者用分子标记Hiri3引物：SEQ ID NO.5/SEQ ID NO.6或者用分子标记H iri9引物：SEQ ID NO.7/SEQ ID NO.8扩增水稻或育种材料DNA，如果用分子标记RM26801引物能够扩增出166bp的扩增片段，或用分子标记H02‑10引物能够扩增出170bp的扩增片段，或用分子标记Hiri3引物能够扩增出193bp的扩增片段，或用分子标记H iri9引物能够扩增出167bp的扩增片段，则标志着水稻品种抗条纹叶枯病基因qSTV11‑i的存在。

【技术特征摘要】
1.一种水稻抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记方法，其特征在于用分子标记RM26801引物：SEQIDNO.1/SEQIDNO.2或者用分子标记H02-10引物：SEQIDNO.3/SEQIDNO.4或者用分子标记Hiri3引物：SEQIDNO.5/SEQIDNO.6或者用分子标记Hiri9引物：SEQIDNO.7/SEQIDNO.8扩增水稻或育种材料DNA，如果用分子标记RM26801引物能够扩增出166bp的扩增片段，或用分子标记H02-10引物能够扩增出170bp的扩增片段，或用分子标记Hiri3引物能够扩增出193bp的扩增片段，或用分子标记Hiri9引物能够扩增出167bp的扩增片段，则标志着水稻品种抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的存在。2.一种抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记RM26801引物：SEQIDNO.1/SEQIDNO.2。3.一种抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记H02-10引物：SEQIDNO.3/SEQIDNO.4。4.一种抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记Hiri3引物：SEQIDNO.5/SEQIDNO.6。5.一种抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记Hiri9引物：SEQIDNO.7/SEQIDNO.8。6.权利要求1所述抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记方法、权利要求2所述分子标记RM26801、权利要求3所述分子标记H02-10、权利要求4所述分子标记Hiri3或权利要求5所述分子标记Hiri9在水稻育种中的应用。7.权利要求1所述抗条纹叶枯病基因qSTV11-i的分子标记方法、权利要求2所述分子标记RM26801、权利要求3所述分子标记H02-10、权利要求4所述分子标记Hiri3或权利要求5所述分子标记Hiri9在鉴定抗条纹叶枯病植物品种或品系中的应...

【专利技术属性】
技术研发人员：万建民，刘裕强，胡金龙，江玲，何俊，陈亮明，刘世家，刘喜，田云录，赵志刚，张文伟，王益华，
申请(专利权)人：南京农业大学，
类型：发明
国别省市：江苏,32