从胸、腹水中提取游离mRNA的方法技术

技术编号:1754291 阅读:303 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
从胸、腹水中提取游离mRNA的方法,其步骤在于:    (1)将胸水或腹水注入有枸橼酸钠溶液的无RNA酶抗凝管中;    (2)上离心机离心,吸取上清至新管,再离心,吸取三分之二上清至新管;    (3)取上清加入到Trizol  LS溶液中,室温震荡;    (4)向其中加入氯仿,剧烈震荡后室温下放置;    (5)上离心机离心,吸取水相层至新管;    (6)加入异丙醇,沉淀RNA;    (7)上离心机离心,75%乙醇洗涤后晾干;    (8)加入无RNA酶水,溶解RNA,以其为模板,常规技术反转录为cDNA保存。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种生物技术提取方法,特别涉及一种。
技术介绍
在本专利技术之前,因为胸水、腹水常常是恶性肿瘤转移或首发临床表现,所以抽取一定容量的胸、腹水进行恶性肿瘤的检测是医疗实践中经常要做的。然而,由于肿瘤细胞病理检出率相对较低,且需要一定数量的胸水、腹水标本,临床上经常需要对于有胸腔、腹腔积液的患者反复进行送检,因而难于及时明确诊断或者因没有足够数量的标本,无法准确诊断从而耽误最佳治疗时机;同时,在胸腹水中肿瘤相关抗原的检测方面,传统的方式所检测的对象仅限于胸水、腹水中相关蛋白、细胞,灵敏度较低,不利于疾病的早期诊断和疗效判断。
技术实现思路
本专利技术的目的就在于克服上述缺陷,研制一种,从而有利于恶性胸水/腹水的诊断及病情监控。本专利技术的技术方案是,其主要技术步骤在于(1)将胸水或腹水注入有枸橼酸钠溶液的无RNA酶抗凝管中;(2)上离心机离心,吸取上清至新管,再离心,吸取三分之二上清至新管;(3)取上清加入到Trizol LS溶液中,室温震荡;(4)向其中加入氯仿,剧烈震荡后室温下放置;(5)上离心机离心,吸取水相层至新管;(6)加入异丙醇,沉淀RNA;(7)上离心机离心,75%乙醇洗涤后晾干;(8)加入无RNA酶水,溶解RNA,以其为模板,常规技术反转录为cDNA保存。本专利技术的优点和效果在于成功地从小量胸水/腹水中提取游离RNA,经实时定量荧光PCR扩增证实相关目的基因的表达。对于转移性恶性胸腔/腹腔积液而言,能从少量标本中监测某种肿瘤相关基因的表达丰度,实现对疾病的动态监测及疗效判断。具体而言1.突破了传统方法,成功地从胸腹水游离上清中提取RNA并扩增目的基因;2.可从小量(3-5ml)胸水/腹水标本中扩增肿瘤相关基因,有利于恶性胸水/腹水的早期分子水平诊断;3.从小量(3-5ml)恶性胸水/腹水标本中扩增相关基因如相关肿瘤标记物,有利于对疾病的实时监控、动态观察与疗效判断。与目前检测胸腹水中蛋白表达的方法相比,灵敏度高;与从胸腹水中的细胞RNA检测相关基因表达的方法相比,操作简便,无需细胞的收集、富集等步骤。4.本方法的建立也适用于从少量胸水/腹水中检测其它疾病相关基因,从而有利于早期诊断;5.操作方便,灵敏度高,可重复性强。附图说明图1——部分标本胸水/腹水游离上清中Tublin III mRNA的扩增图;图2——部分标本胸水/腹水游离上清中ERCC1 mRNA的扩增图;图3——部分标本胸水/腹水游离上清中TS mRNA的扩增图;图4——部分标本胸水/腹水游离上清中β-actin mRNA的扩增图;具体实施方式1.将所有实验用物品均经去RNA酶处理相关试剂用灭活的0.1%DEPC水配置;实验用玻璃器皿需经160℃烘烤6小时;2.将胸水或/腹水5ml注入事先加入了0.5ml 3.8%枸橼酸钠的无RNA酶管中;3.上4000g离心机,在4℃下,离心10分钟,将上清移至新管;4.再上4000g离心机,在4℃下,再次离心10分钟,吸取上2/3的上清,仍移至新管;5.取1ml上清,加入到3ml Trizol LS(invitrogen产品),室温震荡15分钟,至使蛋白颗粒充分裂解; 6.加入氯仿,剧烈震荡后室温放置15分钟;7.上12000g离心机,在4℃下,离心15分钟,吸取水相层至另一新管;8.在水相层新管中加入异丙醇沉淀RNA;9.上离开心机12000g,在4℃下,离心15分钟,用75%乙醇洗涤两遍后晾干;10.加入无RNA酶水,溶解RNA;11.以溶解RNA为模板,按TaKaRa反转录试剂盒说明操作反转录为cDNA,-20℃保存。采用Taqman-MGB探针技术实时荧光定量PCR检测胸水/腹水游离ERCCl、TS、Tublin III和BRCAlmRNA的表达(以β-actin为内参);所用探针及引物均为ABI产品(引物跨内含子设计,在扩增中避免了DNA污染的可能性),相关基因的扩增证实了胸水/腹水游离mRNA的成功提取,如图1、图2、图3、图4所示。说明附图横坐标为PCR循环数,纵坐标为荧光强度。所有样本均可检测到目的基因的阳性扩增;同时以相对应提取RNA为阴性对照未见扩增,排除了样本DNA污染的可能性。本专利技术请求保护的范围并不仅仅局限于本具体实施方式的描述。权利要求1.,其步骤在于(1)将胸水或腹水注入有枸橼酸钠溶液的无RNA酶抗凝管中;(2)上离心机离心,吸取上清至新管,再离心,吸取三分之二上清至新管;(3)取上清加入到Trizol LS溶液中,室温震荡;(4)向其中加入氯仿,剧烈震荡后室温下放置;(5)上离心机离心,吸取水相层至新管;(6)加入异丙醇,沉淀RNA;(7)上离心机离心,75%乙醇洗涤后晾干;(8)加入无RNA酶水,溶解RNA,以其为模板,常规技术反转录为cDNA保存。2.根据权利要求1所述的,其特征在于步骤(2)中离心机为4000g,离心机,在4℃下,分别离心10分钟。3.根据权利要求1所述的,其特征在于步骤(3)中震荡以使蛋白颗粒充分裂解。全文摘要本专利技术涉及一种。本专利技术将胸或腹水注入有枸橼酸钠溶液的无RNA酶抗凝管中,离心,吸取上清,再离心,再吸取上清,上清加入到Trizol LS溶液中,室温震荡,加入氯仿,剧烈震荡后室温下放置,离心,吸取水相层至新管,加入异丙醇,沉淀RNA,离心,75%乙醇洗涤后晾干,加入无RNA酶水,溶解RNA,以其为模板,常规技术反转录为cDNA保存。解决了过去无法从胸、腹水中抽提RNA的缺陷,可以对肿瘤及其他疾病进行早期诊治。操作方便,重复性强。文档编号C07H21/00GK1952176SQ20061009645公开日2007年4月25日 申请日期2006年9月27日 优先权日2006年9月27日专利技术者刘宝瑞, 王立峰, 钱晓萍 申请人:南京大学医学院附属鼓楼医院本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:刘宝瑞王立峰钱晓萍
申请(专利权)人:南京大学医学院附属鼓楼医院
类型:发明
国别省市:

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1
相关领域技术
  • 暂无相关专利