稻瘟病菌无毒基因的分子标记方法技术

本发明专利技术稻瘟病菌无毒基因的分子标记方法属于农业生物技术范畴。分子标记技术，对稻瘟病菌两亲本菌株及杂交后代群体鉴定获得的无毒基因进行分子标记。第１染色体端粒附近的ＳＳＲ标记ｍ３５５－３５６与无毒基因Ａｖｒ－Ｐｉｔ连锁，遗传距离为２．３ｃＭ；定位于第７染色体端粒附近的ＲＡＰＤ标记Ｓ４８７与无毒基因Ａｖｒ－Ｐｉａ连锁，遗传距离为３．５ｃＭ；第３染色体的中部的ＳＳＲ标记ｍ６７７－６７８、ＲＡＰＤ标记Ｓ３６１与稻瘟病菌种特异性无毒基因ＰＲＥ１连锁，遗传距离分别为５．９ｃＭ和６．４ｃＭ。本发明专利技术不仅可利用该无毒基因的标记作探针，而且为进一步通过物理作图法克隆该无毒基因奠定了基础。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
稻瘟病菌无毒基因的分子标记方法，其特征在于：用标记引物ｍｓ３５５－３５６，左端引物序列ＡＡＣＣＣＴＣＣＧＴＧＣＡＣＣＴＴＡＧ右端引物序列ＧＣＴＴＣＴＴＣＴＣＧＣＴＴＧＣＴＧＴＴ扩增稻瘟病菌ＤＮＡ，如果能扩增出 ２９２ｂｐ的扩增片段，则标志着稻瘟病菌无毒基因Ａｖｒ－Ｐｉｔ的存在，该无毒基因位于第１染色体端粒附近，利用软件Ｍａｐｍａｋｅｒ３．０，最小ＬＯＤ值设为３，获得与标记的遗传距离为２．３ｃＭ；或者用标记引物Ｓ４８７Ｆ／Ｒ，左端引 物序列ＴＧＧＴＡＴＴＧＴＴＣＧＣＧＴＴＧＡＴＡＴＧ右端引物序列ＣＣＣＣＧＡＴＧＧＴＣＴＡＡＴＡＴＡＣＧ扩增稻瘟病菌ＤＮＡ，如果能扩增出３０６ｂｐ的扩增片段，则标志着稻瘟病菌无毒基因Ａｖｒ－Ｐｉａ的存在，该无毒基因位于第７染色 体端粒附近，利用软件Ｍａｐｍａｋｅｒ３．０，最小ＬＯＤ值设为３，获得与标记的遗传距离为３．５ｃＭ；或者用标记引物ｍｓ３６３－３６４，左端引物序列ＴＣＴＣＧＧＧＡＡＧＣＴＧＡＴＴＧＡＧＴ右端引物序列ＣＴＡＡＣＧＧＣＣＧ ＧＣＴＡＡＣＡＡＡＣ扩增稻瘟病菌ＤＮＡ，如果能扩增出２８５ｂｐ的扩增片段，则标志着稻瘟病菌无毒基因Ａｖｒ－Ｐｉａ的存在，该无毒基因位于第７染色体端粒附近，利用软件Ｍａｐｍａｋｅｒ３．０，最小ＬＯＤ值设为３，获得与标记的遗传距离为４． ６ｃＭ；或者用标记引物ｍｓ６７７－６７８，左端引物序列ＴＣＧＴＧＡＧＧＧＴＴＣＣＴＡＴＣＴＧＣ右端引物序列ＧＡＣＣＴＴＴＡＴＣＧＧＡＴＧＣＧＴＧＴ扩增稻瘟病菌ＤＮＡ，如果能扩增出２５５ｂｐ的扩增片段，则标志着 稻瘟病菌种特异性无毒基因ＰＲＥ１的存在，该无毒基因位于第３染色体中部，利用软件Ｍａｐｍａｋｅｒ３．０，最小ＬＯＤ值设为３，获得与标记的遗传距离为５．９ｃＭ；。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员：郑小波，王源超，陈庆河，张正光，
申请(专利权)人：南京农业大学，
类型：发明
国别省市：84[中国|南京]