检测癌症的存在风险的方法技术

本发明专利技术提供一种检测癌症的存在风险的方法，该方法包括提供一个体以及非癌症控制组的血液样本，并量测其癌症基因标记的表达量，并利用计算非癌症控制组个别基因的基础表达量，再分别将该个体以及非癌症控制组的个别基因表达量除以该个别基因的基础表达量以计算出每个基因的表达倍率；将倍率取自然对数使上升倍数或下降倍数有相同的权重；最后加总自然对数的倍率即为癌症风险指数，该癌症风险指数用以评估一个体癌症的存在风险及一患者在接受癌症治疗后的反应及预后情形。

A method of detecting the risk of cancer

The present invention provides a method for detecting cancer risk, the method includes providing a non cancer control group and individual blood samples, and the expression levels of the cancer marker, and by calculating the basic expression level of non cancer control group of individual genes, then the individual and individual genes in non cancer control group the expression of basic volume divided by the individual gene expression to calculate the expression ratio of each gene respectively; the ratio of natural logarithm to rise or fall in multiples of multiples of the same weight; finally adding natural logarithm of the ratio is the cancer risk index, to evaluate the risk and patients in response and prognosis of case acceptance an individual cancer after cancer treatment using the cancer risk index.

【技术实现步骤摘要】
检测癌症的存在风险的方法
本专利技术是关于一种检测癌症的存在风险的方法；特别是一种利用18个癌症基因标记检测癌症的存在风险的方法。
技术介绍
近年来，分子医学科技逐渐发展出用于血液样本的癌症风险诊断及预测的癌症基因标记，该些标记可用于早期检测可改善患者的存活率，包括在症状为临床上可检测之前、接受治疗时以及在复原时。该些技术大多选择与癌症相关基因组，观察癌症患者与一般人在此基因组上的差异，通常利用皮尔森相关性系数(Pearson'scorrelationcoefficient)建立机率转换机制或判断机制，再将受试者的基因表现导入前述机率转换机制或判断机制进行检验。然而，上述方法仅透过皮尔森相关性系数，其是一种线性相关系数，用来反映两个变量线性相关程度的统计量。该方法具有以下几个缺点：(1)该方法需考虑该些基因表现图形(pattern)是否相似，容易出现误判于基因表现皆在正常波动范围但基因表现图形相近，而并未考虑基因表现量高低是否合理；(2)该方法为考虑单一基因于群体中表线分布情况而忽略个体间差异；以及(3)单一基因效力不足。因此，目前用于血液样本的癌症风险诊断及预测的癌症基因标记，缺乏一种使用群体的基因表现量做为基础值以减少个体影响，以及对基因进行加权的方法。
技术实现思路
有鉴于此，本专利技术提供一种检测癌症的存在风险的方法，其步骤包含：(a)从一受试者取得一包含核酸的体液的检体样本；(b)测量一癌症基因标记组的mRNA表达量，该癌症基因标记组是由β-球蛋白(hemoglobinbetagene，HBB)、糖化血红蛋白(hemoglobinA1，HBA1)、细胞激素讯息抑制物-3(suppressorofcytokinesignalling3，SOCS3)、肾上腺髓质素(adrenomedullin，ADM)、分泌型白细胞蛋白酶抑制蛋白(secretoryleukocyteproteaseinhibitor-1，SLP1)、表面抗原分化簇68(clusterofdifferentiation68，CD68)、S100钙结合蛋白P(S100calciumbindingproteinP，S100P)、DNA损伤诱导转移因子3(DNAdamageinducibletranscript3,DDIT3)、组织蛋白酶Z(cathepsinZ，CTSZ)、Bcl-2相关X蛋白(Bcl-2-associatedproteinx，Bax)、淀粉样蛋白前驱蛋白(amyloidprecursorprotein，APP)、转酮醇酵酶(transketolase，TKT)、G蛋白偶联雌激素受体(Gprotein-coupledestrogenreceptor，GPER)、血红素结合蛋白以及血红素结合蛋白相关蛋白(haptoglobinandhaptoglobin-related，HPR|HP)、FK506结合蛋白3(FK506BindingProtein3，FKBP3)、酸性磷酸酶5(acidphosphatase5，ACP5)、溶酶体关联蛋白跨膜4alpha(lysosomalproteintransmembrane4alpha，LAPTM4A)以及趋化因子受体4(chemokinereceptor，CXCR4)所组成；(c)计算该受试者的癌症风险指数，其公式为sum[LN(个别基因表现量/个别基因的基础表达量)]，包含：(i)取个别基因表现量除以一个别基因的基础表达量以计算出每个基因的表达倍率；(ii)再将倍率取自然对数使上升倍数或下降倍数有相同的权重；(iii)基因表达量上升者确认有癌症的存在风险，基因表达量下降者不予考虑；以及(iv)加总个体基因表达上升者所属权重即为受试者的癌症风险指数；(d)该个别基因的基础表达量是取自一非癌症控制组的含核酸的体液的检体样本的相对应癌症基因的表达量的几何平均数；以及(e)以步骤(c)计算非癌症控制组的癌症风险指数；其中基于该受试者的癌症风险指数低于该非癌症控制组的癌症风险指数的中位数者，是代表该受试者具有形成癌症的低风险；基于该受试者的癌症风险指数高于该非癌症控制组的癌症风险指数99％可信区间(C.I.)者，代表该受试者具有形成癌症的高风险。本专利技术另提供一种评估一患者对癌症治疗的预后复发风险的方法，其步骤包含：(a)从一受试者取得一包含核酸的体液的检体样本；(b)测量一癌症基因标记组的mRNA表达量，该癌症基因标记组是由HBB、HBA1、SOCS3、ADM、SLPl、CD68、S100P、DDIT4、CTSZ、BAX、APP、TKT、GPER、HPR|HP、FKBP3、ACP5、LAPTM4A以及CXCR4所组成；(c)计算该受试者的癌症风险指数，其公式为sum[LN(个别基因表现量/个别基因的基础达量)]，包含：(i)取个别基因表达量除以一个别基因的基础表达量以计算出每个基因的表达倍率；(ii)再将倍率取自然对数使上升倍数或下降倍数有相同的权重；(iii)基因表达量上升者确认有癌症的存在风险，基因表达量下降者不予考虑；以及(iv)加总个体所属权重即为受试者的癌症风险指数；(d)该个别基因的基础表达量是为取自一非癌症控制组的含核酸的体液的检体样本的相对应癌症基因的表达量的几何平均数；以及(e)以步骤(c)计算非癌症控制组的癌症风险指数；其中基于该患者的癌症风险指数低于该非癌症控制组的癌症风险指数的中位数者，是代表该患者具有癌症复发的低风险；基于该患者的癌症风险指数高于该非癌症控制组的癌症风险指数99％可信区间(C.I.)者，代表该患者具有癌症复发的高风险；且该非癌症控制组的人数需在20人以上。在本专利技术的一实施例中，其中步骤(b)是经由微数组芯片、实时聚合酶链锁反应(real-timePCR)、Northern印迹杂交或原位杂交量测。在本专利技术的一实施例中，其中该癌症为乳癌、胃癌、膀胱癌或肝癌。在本专利技术的一实施例中，其中该检体样本是一外周血单核细胞(Peripheralbloodmononuclearcell，PBMC)样本。因此，本专利技术提供一种检测癌症的存在风险的方法，该方法包括提供一个体以及非癌症控制组的血液样本，并量测18个癌症基因标记的表达量，其中该18个癌症基因标记包含由HBB、HBA1、SOCS3、ADM、SLPl、CD68、S100P、DDIT4、CTSZ、BAX、APP、TKT、GPER、HPR|HP、FKBP3、ACP5、LAPTM4A以及CXCR4所组成的群组，先利用计算非癌症控制组个别基因的基础表达量，再分别将该个体以及非癌症控制组的个别基因表达量除以该个别基因的基础表达量以计算出每个基因的表达倍率；将倍率取自然对数使上升倍数或下降倍数有相同的权重；最后加总自然对数的倍率即为癌症风险指数，该癌症风险指数用以评估一个体癌症的存在风险及一患者在接受癌症治疗后的反应及预后情形。以下将进一步说明本专利技术的实施方式，以下所列举的实施例是用以阐明本专利技术，并非用以限定本专利技术的范围，任何熟习此技艺者，在不脱离本专利技术的精神和范围内，当可做些许更动与润饰，因此本专利技术的保护范围当视后附的申请专利范围所界定者为准。附图说明图1是本专利技术的检测癌症的存在风险的方法单一个体单次检测的癌症风险指数本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种检测癌症的存在风险的方法，其步骤包含：从受试者取得包含核酸的体液的检体样本；测量癌症基因标记组的mRNA表达量，该癌症基因标记组是由β‑球蛋白、糖化血红蛋白、细胞激素讯息抑制物‑3、肾上腺髓质素、分泌型白细胞蛋白酶抑制蛋白、表面抗原分化簇68、S100钙结合蛋白P、DNA损伤诱导转移因子3、组织蛋白酶Z、Bcl‑2相关X蛋白、淀粉样蛋白前驱蛋白、转酮醇酵酶、G蛋白偶联雌激素受体、血红素结合蛋白以及血红素结合蛋白相关蛋白、FK506结合蛋白3、酸性磷酸酶5、溶酶体关联蛋白跨膜4alpha以及趋化因子受体4所组成；计算该受试者的癌症风险指数，其公式为sum[LN(个别基因表现量/个别基因的基础表达量)]，包含：(i)取一个别基因表达量除以一个别基因的基础表达量以计算出每个基因的表达倍率；(ii)再将倍率取自然对数使上升倍数或下降倍数有相同的权重；(iii)基因表达量上升者确认有癌症的存在风险，基因表达量下降者不予考虑；以及(iv)加总个体基因表达上升者所属权重即为受试者的癌症风险指数；该个别基因的基础表达量是取自非癌症控制组的含核酸的体液的检体样本的相对应癌症基因的表达量的几何平均数；以及以步骤(c)计算非癌症控制组的癌症风险指数；其中基于该受试者的癌症风险指数低于该非癌症控制组的癌症风险指数的中位数者，是代表该受试者具有形成癌症的低风险；基于该受试者的癌症风险指数高于该非癌症控制组的癌症风险指数99％可信区间者，代表该受试者具有形成癌症的高风险。...

【技术特征摘要】
2016.07.12 TW 1051219361.一种检测癌症的存在风险的方法，其步骤包含：从受试者取得包含核酸的体液的检体样本；测量癌症基因标记组的mRNA表达量，该癌症基因标记组是由β-球蛋白、糖化血红蛋白、细胞激素讯息抑制物-3、肾上腺髓质素、分泌型白细胞蛋白酶抑制蛋白、表面抗原分化簇68、S100钙结合蛋白P、DNA损伤诱导转移因子3、组织蛋白酶Z、Bcl-2相关X蛋白、淀粉样蛋白前驱蛋白、转酮醇酵酶、G蛋白偶联雌激素受体、血红素结合蛋白以及血红素结合蛋白相关蛋白、FK506结合蛋白3、酸性磷酸酶5、溶酶体关联蛋白跨膜4alpha以及趋化因子受体4所组成；计算该受试者的癌症风险指数，其公式为sum[LN(个别基因表现量/个别基因的基础表达量)]，包含：(i)取一个别基因表达量除以一个别基因的基础表达量以计算出每个基因的表达倍率；(ii)再将倍率取自然对数使上升倍数或下降倍数有相同的权重；(iii)基因表达量上升者确认有癌症的存在风险，基因表达量下降者不予考虑；以及(iv)加总个体基因表达上升者所属权重即为受试者的癌症风险指数；该个别基因的基础表达量是取自非癌症控制组的含核酸的体液的检体样本的相对应癌症基因的表达量的几何平均数；以及以步骤(c)计算非癌症控制组的癌症风险指数；其中基于该受试者的癌症风险指数低于该非癌症控制组的癌症风险指数的中位数者，是代表该受试者具有形成癌症的低风险；基于该受试者的癌症风险指数高于该非癌症控制组的癌症风险指数99％可信区间者，代表该受试者具有形成癌症的高风险。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述步骤(b)是经由微数组芯片、实时聚合酶链锁反应、Northern印记杂交法或原位杂交量测。3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述癌症是为乳癌、胃癌、膀胱癌或肝癌。4.根据权利要求1所述的方法...

【专利技术属性】
技术研发人员：林咏翔，李季颕，白平辉，
申请(专利权)人：百岳特生物科技上海有限公司，百岳特生物技术上海有限公司，百岳特化妆品上海有限公司，百岳特国际贸易上海有限公司，
类型：发明
国别省市：上海,31