用于确定微生物分布谱的方法、系统、试剂盒、用途和组合物技术方案

本公开内容提供了一种确定包含多种微生物的生物样品中的微生物分布谱的方法、系统、试剂盒、用途和组合物。

Methods, systems, kits, uses and compositions for determining the distribution spectrum of microbes

The present disclosure provides a method, system, kit, usage and composition for determining the distribution spectrum of microorganisms in biological samples containing multiple microorganisms.

【技术实现步骤摘要】
用于确定微生物分布谱的方法、系统、试剂盒、用途和组合物交叉引用本申请要求2016年6月27日提交的中国专利申请201610481965.6的权益，该申请通过引用将其全部内容并入本文。
技术介绍
微生物，包括细菌、真菌、原生生物、古菌和病毒，遍布于几乎一切环境中。微生物个体微小，种类繁多，与人类日常生活关系密切，并在产业中得到广泛利用，例如，食品、健康和环保产业。许多微生物与人体的健康状态以及疾病发生密切相关。另外，对微生物的研究对现代生物学技术和理论的进步起到了非常关键的作用。大肠癌(亦称作结肠癌、直肠癌、或结肠直肠癌)是发生于大肠(包括结肠和直肠)的恶性肿瘤。大肠癌的发病与许多因素相关，包括年龄、生活习惯、以及家族病史等等。一些大肠癌的风险因素包括饮食、肥胖、抽烟、缺乏体育锻炼、炎性肠病、结肠直肠息肉等等。仅2012年，全球即有一百四十万人诊断出患有大肠癌，并且有六十九万四千人死于该病。对于该病的早期诊断和预后对经济和健康方面均具有重大影响。然而，目前通常用于早期诊断该病的技术，如指检、结肠镜、X-光灌肠等，无论从金钱和时间成本，还是患者的顺应性方面均较差，成为了制约早期诊断大肠癌的重要因素。
技术实现思路
在上述背景下，需要能够迅速、非侵入地鉴定来自受试者样品，判断受试者罹患大肠癌的风险，或罹患大肠癌的受试者的预后的技术。在一个方面，本专利技术提供了一种确定包含多种微生物的生物样品中的微生物分布谱的方法，其包括：1)对所述生物样品进行核酸扩增反应和/或测序，以确定所述多种微生物中一种或多种微生物的数量或浓度，从而获得所述生物样品的微生物分布谱；2)将所述生物样品的微生物分布谱与多个参考微生物分布谱相比较，确定与所述生物样品的微生物分布谱差异在预定的阈值之内的所有候选参考微生物分布谱；以及3)根据2)中的比较结果，将所述生物样品的微生物分布谱与一个或多个候选参考微生物分布谱相关联。在一些实施方案中，3)中的关联包括确定所述生物样品的微生物分布谱与所述一个或多个候选参考微生物分布谱中的每一个相关联的置信水平。在一些实施方案中，还包括根据上述置信水平，确定与所述生物样品的微生物分布谱关联度最高的候选参考微生物分布谱。在一些实施方案中，当2)中未能确定任何候选参考微生物分布谱时，确定所述生物样品的微生物分布谱不与任何参考生物分布谱相关联。在一些实施方案中，所述多个参考微生物分布谱中的每一个均用特定参数值组成的集合进行标记。在一些实施方案中，还包括当确定了与所述生物样品的微生物分布谱关联度最高的候选参考微生物分布谱时，将所述生物样品用标记所述候选参考微生物分布谱的所述特定参数值组成的集合进行标记。在一些实施方案中，所述生物样品来自受试者。在一些实施方案中，所述受试者是人。在一些实施方案中，所述生物样品包括活体组织、全血、血清、血浆、粘膜、唾液、拭子、尿、粪便、细胞、组织、淋巴液、CNS液和病变渗出物或其组合。在一些实施方案中，所述粘膜是胃粘膜。在一些实施方案中，所述拭子是直肠拭子。在一些实施方案中，所述参考微生物分布谱来自受试者自身。在一些实施方案中，所述参考微生物分布谱来自处于健康或认为处于健康状态的个体。在一些实施方案中，所述参考微生物分布谱来自处于健康或认为处于健康状态的受试者自身。在一些实施方案中，所述参数选自下组：年龄、性别、地域、种族、民族、病史、家族病史、饮食、吸烟、饮酒、遗传特征、肥胖、血压、体育锻炼、肠部疾病、结肠直肠息肉、用药史、疾病诊断结果、疾病预后结果，或其组合。在一些实施方案中，所述疾病诊断为对于癌症的诊断。在一些实施方案中，所述病史为癌症病史。在一些实施方案中，所述癌症为肠癌。在一些实施方案中，所述肠癌为大肠癌。在一些实施方案中，所述大肠癌为结肠癌和/或直肠癌。在一些实施方案中，所述大肠癌的分期选自下组：0、I、IIA、IIB、IIC、IIIA、IIIB、IIIC、IVA、和IVB。在一些实施方案中，所述大肠癌的原发肿瘤分期(T)选自下组：TX、T0、Tis、T1、T2、T3、T4a、和T4b。在一些实施方案中，所述大肠癌的淋巴结肿瘤分期(N)选自下组：NX、N0、N1a、N1b、N1c、N2a、和N2b。在一些实施方案中，所述大肠癌的远处转移分期(M)选自下组：M0、M1a和M1b。在一些实施方案中，所述大肠癌是复发的大肠癌。在一些实施方案中，所述大肠癌是难治的大肠癌。在一些实施方案中，其进一步包括获得对所述癌症的诊断或预后。在一些实施方案中，所述诊断包括诊断所述受试者是否罹患所述癌症，提供所述受试者罹患癌症的风险，或对于罹患癌症的受试者确定预后。在一些实施方案中，所述癌症为大肠癌。在一些实施方案中，所述大肠癌为结肠癌和/或直肠癌。在一些实施方案中，还包括将关联结果、标记结果、和/或诊断结果发送给用户。在另一个方面，本专利技术提供了一种确定受试者健康状况的方法，其包括：1)从所述受试者获得生物样品，所述生物样品包含多种微生物；2)对所述生物样品进行核酸扩增反应和/或测序，以确定所述多种微生物中一种或多种微生物的数量或浓度，从而获得所述上到样品的微生物分布谱；3)将所述生物样品的微生物分布谱与正常生物样品的参考微生物分布谱进行比较，以确定受试者的健康状况。在一些实施方案中，所述正常生物样品来自健康状况正常或被认为正常的个体。在一些实施方案中，所述正常生物样品来自当处于正常的或被认为正常的健康状况的所述受试者自身。在一些实施方案中，所述正常生物样品的参考微生物分布谱是根据来自多个健康状况正常或被认为正常的个体的生物样品的微生物分布谱通过统计方法获得的。在一些实施方案中，当所述生物样品的微生物分布谱与正常生物样品的参考微生物分布谱不存在统计学上显著差异时，确定所述受试者的健康状况为正常。在一些实施方案中，当所述生物样品的微生物分布谱与正常生物样品的参考微生物分布谱存在统计学上显著差异时，确定所述受试者的健康状况为异常。在一些实施方案中，所述生物样品为胃肠道样品。在一些实施方案中，所述胃肠道样品选自下组：粪便、活体组织、胃粘膜、直肠拭子，或其组合。在一些实施方案中，当所述胃肠道样品的微生物分布谱与正常胃肠道样品的参考微生物分布谱不存在统计学上显著差异时，确定所述受试者的胃肠道健康状况为正常。在一些实施方案中，当所述胃肠道样品的微生物分布谱与正常胃肠道样品的参考微生物分布谱存在统计学上显著差异时，确定所述受试者的胃肠道健康状况为异常。在一些实施方案中，所述异常的胃肠道健康状况为罹患大肠癌的风险。在一些实施方案中，所述异常的胃肠道健康状况为罹患大肠癌。在另一个方面，本专利技术提供了一种确定受试者健康状况的方法，其包括：1)从所述受试者获得生物样品，所述生物样品包含多种微生物；2)对所述生物样品进行核酸扩增反应和/或测序，以确定所述多种微生物中一种或多种微生物的数量或浓度，从而获得所述上到样品的微生物分布谱；3)将所述生物样品的微生物分布谱与多个参考生物样品的参考微生物分布谱进行比较。4)根据3)中的比较结果，将所述生物样品的微生物分布谱与一个或多个候选参考微生物分布谱相关联。在一些实施方案中，所述多个参考微生物分布谱中的每一个均用特定参数值组成的集合进行标记。在一些实施方案中，所述参数值的集合包括本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种确定包含多种微生物的生物样品中的微生物分布谱的方法，其包括：1)对所述生物样品进行核酸扩增反应和/或测序，以确定所述多种微生物中一种或多种微生物的数量或浓度，从而获得所述生物样品的微生物分布谱；2)将所述生物样品的微生物分布谱与多个参考微生物分布谱相比较，确定与所述生物样品的微生物分布谱差异在预定的阈值之内的所有候选参考微生物分布谱；以及3)根据2)中的比较结果，将所述生物样品的微生物分布谱与一个或多个候选参考微生物分布谱相关联。

【技术特征摘要】
2016.06.27 CN 20161048196561.一种确定包含多种微生物的生物样品中的微生物分布谱的方法，其包括：1)对所述生物样品进行核酸扩增反应和/或测序，以确定所述多种微生物中一种或多种微生物的数量或浓度，从而获得所述生物样品的微生物分布谱；2)将所述生物样品的微生物分布谱与多个参考微生物分布谱相比较，确定与所述生物样品的微生物分布谱差异在预定的阈值之内的所有候选参考微生物分布谱；以及3)根据2)中的比较结果，将所述生物样品的微生物分布谱与一个或多个候选参考微生物分布谱相关联。2.前述任一项权利要求的方法，其中3)中的关联包括确定所述生物样品的微生物分布谱与所述一个或多个候选参考微生物分布谱中的每一个相关联的置信水平。3.前述任一项权利要求的方法，还包括根据上述置信水平，确定与所述生物样品的微生物分布谱关联度最高的候选参考微生物分布谱。4.前述任一项权利要求的方法，其中当2)中未能确定任何候选参考微生物分布谱时，确定所述生物样品的微生物分布谱不与任何参考生物分布谱相关联。5.前述任一项权利要求的方法，其中所述多个参考微生物分布谱中的每一个均用特定参数值组成的集合进行标记。6.前述任一项权利要求的方法，还包括当确定了与所述生物样品的微生物分布谱关联度最高的候选参考微生物分布谱时，将所述生物样品用标记所述候选参考微生物分布谱的所述特定参数值组成的集合进行标记。7.前述任一项权利要求的方法，其中所述生物样品来自受试者。8.前述任一项权利要求的方法，其中所述受试者是人。9.前述任一项权利要求的方法，其中所述生物样品包括活体组织、全血、血清、血浆、粘膜、唾液、拭子、尿、粪便、细胞、组织、淋巴液、CNS液和病变渗出物或其组合。10.前述任一项权利要求的方法，其中所述粘膜是胃粘膜。11.前述任一项权利要求的方法，其中所述拭子是直肠拭子。12.前述任一项权利要求的方法，其中所述参考微生物分布谱来自受试者自身。13.前述任一项权利要求的方法，其中所述参考微生物分布谱来自处于健康或认为处于健康状态的个体。14.前述任一项权利要求的方法，其中所述参考微生物分布谱来自处于健康或认为处于健康状态的受试者自身。15.前述任一项权利要求的方法，其中所述参数选自下组：年龄、性别、地域、种族、民族、病史、家族病史、饮食、吸烟、饮酒、遗传特征、肥胖、血压、体育锻炼、肠部疾病、结肠直肠息肉、用药史、疾病诊断结果、疾病预后结果，或其组合。16.前述任一项权利要求的方法，其中所述疾病诊断为对于癌症的诊断。17.前述任一项权利要求的方法，其中所述病史为癌症病史。18.前述任一项权利要求的方法，其中所述癌症为肠癌。19.前述任一项权利要求的方法，其中所述肠癌为大肠癌。20.前述任一项权利要求的方法，其中所述大肠癌为结肠癌和/或直肠癌。21.前述任一项权利要求的方法，其中所述大肠癌的分期选自下组：0、I、IIA、IIB、IIC、IIIA、IIIB、IIIC、IVA、和IVB。22.前述任一项权利要求的方法，其中所述大肠癌的原发肿瘤分期(T)选自下组：TX、T0、Tis、T1、T2、T3、T4a、和T4b。23.前述任一项权利要求的方法，其中所述大肠癌的淋巴结肿瘤分期(N)选自下组：NX、N0、N1a、N1b、N1c、N2a、和N2b。24.前述任一项权利要求的方法，其中所述大肠癌的远处转移分期(M)选自下组：M0、M1a和M1b。25.前述任一项权利要求的方法，其中所述大肠癌是复发的大肠癌。26.前述任一项权利要求的方法，其中所述大肠癌是难治的大肠癌。27.前述任一项权利要求的方法，其进一步包括获得对所述癌症的诊断或预后。28.前述任一项权利要求的方法，其中所述诊断包括诊断所述受试者是否罹患所述癌症，提供所述受试者罹患癌症的风险，或对于罹患癌症的受试者确定预后。29.前述任一项权利要求的方法，其中所述癌症为大肠癌。30.前述任一项权利要求的方法，其中所述大肠癌为结肠癌和/或直肠癌。31.前述任一项权利要求的方法，还包括将关联结果、标记结果、和/或诊断结果发送给用户。32.一种确定受试者健康状况的方法，其包括：1)从所述受试者获得生物样品，所述生物样品包含多种微生物；2)对所述生物样品进行核酸扩增反应和/或测序，以确定所述多种微生物中一种或多种微生物的数量或浓度，从而获得所述上到样品的微生物分布谱；3)将所述生物样品的微生物分布谱与正常生物样品的参考微生物分布谱进行比较，以确定受试者的健康状况。33.权利要求32的方法，其中所述正常生物样品来自健康状况正常或被认为正常的个体。34.权利要求32或33的方法，其中所述正常生物样品来自当处于正常的或被认为正常的健康状况的所述受试者自身。35.权利要求32-34任一项所述的方法，其中所述正常生物样品的参考微生物分布谱是根据来自多个健康状况正常或被认为正常的个体的生物样品的微生物分布谱通过统计方法获得的。36.权利要求32-35任一项所述的方法，其中当所述生物样品的微生物分布谱与正常生物样品的参考微生物分布谱不存在统计学上显著差异时，确定所述受试者的健康状况为正常。37.权利要求32-36任一项所述的方法，其中当所述生物样品的微生物分布谱与正常生物样品的参考微生物分布谱存在统计学上显著差异时，确定所述受试者的健康状况为异常。38.权利要求32-37任一项所述的方法，其中所述生物样品为胃肠道样品。39.权利要求32-38任一项所述的方法，其中所述胃肠道样品选自下组：粪便、活体组织、胃粘膜、直肠拭子，或其组合。40.权利要求32-39任一项所述的方法，其中当所述胃肠道样品的微生物分布谱与正常胃肠道样品的参考微生物分布谱不存在统计学上显著差异时，确定所述受试者的胃肠道健康状况为正常。41.权利要求32-40任一项所述的方法，其中当所述胃肠道样品的微生物分布谱与正常胃肠道样品的参考微生物分布谱存在统计学上显著差异时，确定所述受试者的胃肠道健康状况为异常。42.权利要求32-41任一项所述的方法，其中所述异常的胃肠道健康状况为罹患大肠癌的风险。43.权利要求32-42任一项所述的方法，其中所述异常的胃肠道健康状况为罹患大肠癌。44.一种确定受试者健康状况的方法，其包括：1)从所述受试者获得生物样品，所述生物样品包含多种微生物；2)对所述生物样品进行核酸扩增反应和/或测序，以确定所述多种微生物中一种或多种微生物的数量或浓度，从而获得所述上到样品的微生物分布谱；3)将所述生物样品的微生物分布谱与多个参考生物样品的参考微生物分布谱进行比较；以及4)根据3)中的比较结果，将所述生物样品的微生物分布谱与一个或多个候选参考微生物分布谱相关联。45.权利要求44的方法，其中所述多个参考微生物分布谱中的每一个均用特定参数值组成的集合进行标记。46.权利要求44或45的方法，其中所述参数值的集合包括一个或多个特征参数值和一个或多个诊断参数值，所述特征参数值描述个体或群体的特征，所述诊断参数值描述相对于所述个体或群体的诊断。47.权利要求44-46任一项所述的方法，其中在4)之前根据受试者的特征，确定具有与受试者的特征相对应的特征参数值的候选参考微生物分布谱。48.权利要求44-47任一项所述的方法，其中4)中的关联包括确定所述生物样品的微生物分布谱与所述一个或多个候选参考微生物分布谱中的每一个相关联的置信水平。49.权利要求44-48任一项所述的方法，还包括根据上述置信水平，确定与所述生物样品的微生物分布谱关联度最高的候选参考微生物分布谱。50.权利要求44-49任一项所述的方法，其中当4)之前未能确定任何候选参考微生物分布谱时，确定所述生物样品的微生物分布谱不与任何参考生物分布谱相关联。51.权利要求44-50任一项所述的方法，还包括当确定了与所述生物样品的微生物分布谱关联度最高的候选参考微生物分布谱时，将所述生物样品用标记所述候选参考微生物分布谱的所述特定参数值组成的集合进行标记。52.权利要求44-51任一项所述的方法，其中根据标记所述生物样品的上述特定参数值组成的集合中的诊断参数值，对所述受试者进行诊断。53.权利要求44-52任一项所述的方法，其中所述特征性参数选自下组：年龄、性别、地域、种族、民族、病史、家族病史、饮食、吸烟、饮酒、遗传特征、肥胖、血压、体育锻炼、肠部疾病、结肠直肠息肉、用药史，或其组合。54.权利要求44-53任一项所述的方法，其中所述诊断性参数选自下组：疾病诊断结果、疾病预后结果，或其组合。55.权利要求44-54任一项所述的方法，其中所述疾病诊断结果为对于癌症的诊断。56.权利要求44-55任一项所述的方法，其中所述参考微生物分布谱来自受试者自身。57.权利要求44-56任一项所述的方法，其中所述参考微生物分布谱来自处于健康或认为处于健康状态的个体。58.权利要求44-57任一项所述的方法，其中所述参考微生物分布谱来自处于健康或认为处于健康状态的受试者自身。59.权利要求44-58任一项所述的方法，其中所述癌症为肠癌。60.权利要求44-59任一项所述的方法，其中所述肠癌为大肠癌。61.权利要求44-60任一项所述的方法，其中所述大肠癌为结肠癌和/或直肠癌。62.权利要求44-61任一项所述的方法，其中所述大肠癌的分期选自下组：0、I、IIA、IIB、IIC、IIIA、IIIB、IIIC、IVA、和IVB。63.权利要求44-62任一项所述的方法，其中所述大肠癌的原发肿瘤分期(T)选自下组：TX、T0、Tis、T1、T2、T3、T4a、和T4b。64.权利要求44-63任一项所述的方法，其中所述大肠癌的淋巴结肿瘤分期(N)选自下组：NX、N0、N1a、N1b、N1c、N2a、和N2b。65.权利要求44-64任一项所述的方法，其中所述大肠癌的远处转移分期(M)选自下组：M0、M1a和M1b。66.权利要求44-65任一项所述的方法，其中所述大肠癌是复发的大肠癌。67.权利要求44-66任一项所述的方法，其中所述大肠癌是难治的大肠癌。68.权利要求44-67任一项所述的方法，其中所述对受试者进行诊断包括诊断所述受试者是否罹患癌症，提供所述受试者罹患癌症的风险，或对于罹患癌症的受试者确定预后。69.权利要求44-68任一项所述的方法，其中所述癌症为大肠癌。70.权利要求44-69任一项所述的方法，其中所述大肠癌为结肠癌和/或直肠癌。71.一种用于确定包含多种微生物的生物样品中的微生物分布谱的计算机辅助的方法，其包括：1)用于输入关于所述多种微生物中一种或多种微生物的数量或浓度的信息的输入步骤，其中所述数量或浓度是通过对所述生物样品进行核酸扩增反应和/或测序而获得的；2)用于根据关于所述多种微生物中一种或多种微生物的数量或浓度的信息，获得所述生物样品的微生物分布谱的获得步骤；3)用于将多个参考微生物分布谱存储到存储装置中的存储步骤；4)用于将所述生物样品的微生物分布谱与所述存储装置中存储的多个参考微生物分布谱相比较，确定与所述生物样品的微生物分布谱差异在预定的阈值之内的所有候选参考微生物分布谱的比较步骤；5)用于根据比较步骤中的比较结果，将所述生物样品的微生物分布谱与一个或多个候选参考微生物分布谱相关联的关联步骤。72.权利要求71的方法，其中5)中的关联包括确定所述生物样品的微生物分布谱与所述一个或多个候选参考微生物分布谱中的每一个相关联的置信水平。73.权利要求71或72的方法，还包括根据上述置信水平，确定与所述生物样品的微生物分布谱关联度最高的候选参考微生物分布谱的确定步骤。74.权利要求71-73任一项所述的方法，还包括当4)中未能确定任何候选参考微生物分布谱时，确定所述生物样品的微生物分布谱不与任何参考生物分布谱相关联的确定步骤。75.权利要求71-74任一项所述的方法，还包括将多个参考微生物分布谱中的每一个均用特定参数值组成的集合进行标记的标记步骤。76.权利要求71-75任一项所述的方法，还包括当确定了与所述生物样品的微生物分布谱关联度最高的候选参考微生物分布谱时，将所述生物样品用标记所述候选参考微生物分布谱的所述特定参数值组成的集合进行标记的标记步骤。77.权利要求71-76任一项所述的方法，其中所述生物样品来自受试者。78.权利要求71-77任一项所述的方法，其中所述受试者是人。79.权利要求71-78任一项所述的方法，其中所述生物样品包括活体组织、全血、血清、血浆、粘膜、唾液、拭子、尿、粪便、细胞、组织、淋巴液、CNS液和病变渗出物或其组合。80.权利要求71-79任一项所述的方法，其中所述粘膜是胃粘膜。81.权利要求71-80任一项所述的方法，其中所述拭子是直肠拭子。82.权利要求71-81任一项所述的方法，其中所述参考微生物分布谱来自受试者自身。83.权利要求71-82任一项所述的方法，其中所述参考微生物分布谱来自处于健康或认为处于健康状态的个体。84.权利要求71-83任一项所述的方法，其中所述参考微生物分布谱来自处于健康或认为处于健康状态的受试者自身。85.权利要求71-84任一项所述的方法，其中所述参数选自下组：年龄、性别、地域、种族、民族、病史、家族病史、饮食、吸烟、饮酒、遗传特征、肥胖、血压、体育锻炼、肠部疾病、结肠直肠息肉、用药史、疾病诊断结果、疾病预后结果，或其组合。86.权利要求71-85任一项所述的方法，其中所述疾病诊断为对于癌症的诊断。87.权利要求71-86任一项所述的方法，其中所述病史为癌症病史。88.权利要求71-87任一项所述的方法，其中所述癌症为肠癌。89.权利要求71-88任一项所述的方法，其中所述肠癌为大肠癌。90.权利要求71-89任一项所述的方法，其中所述大肠癌为结肠癌和/或直肠癌。91.权利要求71-90任一项所述的方法，其中所述大肠癌的分期选自下组：0、I、IIA、IIB、IIC、IIIA、IIIB、IIIC、IVA、和IVB。92.权利要求71-91任一项所述的方法，其中所述大肠癌的原发肿瘤分期(T)选自下组：TX、T0、Tis、T1、T2、T3、T4a、和T4b。93.权利要求71-92任一项所述的方法，其中所述大肠癌的淋巴结肿瘤分期(N)选自下组：NX、N0、N1a、N1b、N1c、N2a、和N2b。94.权利要求71-93任一项所述的方法，其中所述大肠癌的远处转移分期(M)选自下组：M0、M1a和M1b。95.权利要求71-94任一项所述的方法，其中所述大肠癌是复发的大肠癌。96.权利要求71-95任一项所述的方法，其中所述大肠癌是难治的大肠癌。97.权利要求71-96任一项所述的方法，其进一步包括获得对所述癌症的诊断或预后的获得步骤。98.权利要求71-97任一项所述的方法，其中所述诊断包括诊断所述受试者是否罹患所述癌症，提供所述受试者罹患癌症的风险，或对于罹患癌症的受试者确定预后。99.权利要求71-98任一项所述的方法，其中所述癌症为大肠癌。100.权利要求71-99任一项所述的方法，其中所述大肠癌为结肠癌和/或直肠癌。101.权利要求71-100任一项所述的方法，还包括将关联结果、标记结果、和/或诊断结果发送给用户的发送步骤。102.一种用于通过包含多种微生物的、来自受试者的生物样品确定受试者健康状况的计算机辅助的方法，其包括：1)用于输入关于所述多种微生物中一种或多种微生物的数量或浓度的信息的输入步骤，其中所述数量或浓度是通过对所述生物样品进行核酸扩增反应和/或测序而获得的；2)用于根据关于所述多种微生物中一种或多种微生物的数量或浓度的信息，获得所述生物样品的微生物分布谱的获得步骤；3)用于将正常生物样品的参考微生物分布谱存储到存储装置中的存储步骤；以及4)用于将所述生物样品的微生物分布谱与所述存储装置中存储的正常生物样品的参考微生物分布谱进行比较，以确定受试者的健康状况的比较步骤。103.权利要求102的方法，其中所述正常生物样品来自健康状况正常或被认为正常的个体。104.权利要求102或103的方法，其中所述正常生物样品来自当处于正常的或被认为正常的健康状况的所述受试者自身。105.权利要求102-104任一项所述的方法，其中所述正常生物样品的参考微生物分布谱是根据来自多个健康状况正常或被认为正常的个体的生物样品的微生物分布谱通过统计方法获得的。106.权利要求102-105任一项所述的方法，还包括当所述生物样品的微生物分布谱与正常生物样品的参考微生物分布谱不存在统计学上显著差异时，确定所述受试者的健康状况为正常的确定步骤。107.权利要求102-106任一项所述的方法，还包括当所述生物样品的微生物分布谱与正常生物样品的参考微生物分布谱存在统计学上显著差异时，确定所述受试者的健康状况为异常的确定步骤。108.权利要求102-107任一项所述的方法，其中所述生物样品为胃肠道样品。109.权利要求102-108任一项所述的方法，其中所述胃肠道样品选自下组：粪便、活体组织、胃粘膜、直肠拭子，或其组合。110.权利要求102-109任一项所述的方法，还包括当所述胃肠道样品的微生物分布谱与正常胃肠道样品的参考微生物分布谱不存在统计学上显著差异时，确定所述受试者的胃肠道健康状况为正常的确定步骤。111.权利要求102-110任一项所述的方法，还包括当所述胃肠道样品的微生物分布谱与正常胃肠道样品的参考微生物分布谱存在统计学上显著差异时，确定所述受试者的胃肠道健康状况为异常的确定步骤。112.权利要求102-111任一项所述的方法，其中所述异常的胃肠道健康状况为罹患大肠癌的风险。113.权利要求102-112任一项所述的方法，其中所述异常的胃肠道健康状况为罹患大肠癌。114.权利要求102-113任一项所述的方法，还包括将确定所述受试者的健康状况的结果发送给用户的发送步骤。115.一种用于通过包含多种微生物的、来自受试者的生物样品确定受试者健康状况的计算机辅助的方法，其包括：1)用于输入关于所述多种微生物中一种或多种微生物的数量或浓度的信息的输入步骤，其中所述数量或浓度是通过对所述生物样品进行核酸扩增反应和/或测序而获得的；2)用于根据关于所述多种微生物中一种或多种微生物的数量或浓度的信息，获得所述生物样品的微生物分布谱的获得步骤；3)用于将多个参考微生物分布谱存储到存储装置中的存储步骤；4)用于将所述生物样品的微生物分布谱与多个参考生物样品的参考微生物分布谱进行比较的比较步骤；以及5)用于根据比较步骤中的比较结果，将所述生物样品的微生物分布谱与一个或多个候选参考微生物分布谱相关联的关联步骤。116.权利要求115的方法，还包括将所述多个参考微生物分布谱中的每一个均用特定参数值组成的集合进行标记的标记步骤。117.权利要求115或116的方法，其中所述参数值的集合包括一个或多个特征参数值和一个或多个诊断参数值，所述特征参数值描述个体或群体的特征，所述诊断参数值描述相对于所述个体或群体的诊断。118.权利要求115-117任一项所述的方法，还包括在关联步骤之前根据受试者的特征，确定具有与受试者的特征相对应的特征参数值的候选参考微生物分布谱的确定步骤。119.权利要求115-118任一项所述的方法，其中所述关联步骤包括确定所述生物样品的微生物分布谱与所述一个或多个候选参考微生物分布谱中的每一个相关联的置信水平的确定步骤。120.权利要求115-119任一项所述的方法，还包括根据上述置信水平，确定与所述生物样品的微生物分布谱关联度最高的候选参考微生物分布谱的确定步骤。121.权利要求115-120任一项所述的方法，还包括当5)之前未能确定任何候选参考微生物分布谱时，确定所述生物样品的微生物分布谱不与任何参考生物分布谱相关联的确定步骤。122.权利要求115-121任一项所述的方法，还包括当确定了与所述生物样品的微生物分布谱关联度最高的候选参考微生物分布谱时，将所述生物样品用标记所述候选参考微生物分布谱的所述特定参数值组成的集合进行标记的标记步骤。123.权利要求115-122任一项所述的方法，还包括根据标记所述生物样品的上述特定参数值组成的集合中的诊断参数值，对所述受试者进行诊断的诊断步骤。124.权利要求115-123任一项所述的方法，其中所述特征性参数选自下组：年龄、性别、地域、种族、民族、病史、家族病史、饮食、吸烟、饮酒、遗传特征、肥胖、血压、体育锻炼、肠部疾病、结肠直肠息肉、用药史，或其组合。125.权利要求115-124任一项所述的方法，其中所述诊断性参数选自下组：疾病诊断结果、疾病预后结果，或其组合。126.权利要求115-125任一项所述的方法，其中所述疾病诊断结果为对于癌症的诊断。127.权利要求115-126任一项所述的方法，其中所述参考微生物分布谱来自受试者自身。128.权利要求115-127任一项所述的方法，其中所述参考微生物分布谱来自处于健康或认为处于健康状态的个体。129.权利要求115-128任一项所述的方法，其中所述参考微生物分布谱来自处于健康或认为处于健康状态的受试者自身。130.权利要求115-129任一项所述的方法，其中所述癌症为肠癌。131.权利要求115-130任一项所述的方法，其中所述肠癌为大肠癌。132.权利要求115-131任一项所述的方法，其中所述大肠癌为结肠癌和/或直肠癌。133.权利要求115-132任...

【专利技术属性】
技术研发人员：李响，刘晓东，
申请(专利权)人：卡尤迪生物科技北京有限公司，
类型：发明
国别省市：北京,11