夏蜡梅EST‑SSR标记及其在遗传多样性分析中的应用制造技术

本发明专利技术提供了一种濒危植物夏蜡梅EST‑SSR分子标记开发方法，主要包括：夏蜡梅EST序列，SSR位点的鉴定与筛选，EST‑SSR分子标记引物序列。本发明专利技术从夏蜡梅转录组数据中搜索到200条含有不同重复单元的序列，结合软件分析及分子标记筛选得到23条多态性丰富的EST‑SSR标记。本发明专利技术可应用于濒危植物夏蜡梅不同种间以及种群间的遗传多样性分析，种质鉴定，变异与进化研究和分子标记辅助育种等。重复性好，可靠性高，是一种非常有效的分子标记。

Application of Sinocalycanthus EST SSR marker in genetic diversity analysis.

The present invention provides an endangered plant sinocalycanthuschinensis EST SSR molecular marker development methods, mainly including: Sinocalycanthus EST sequence, identification and screening of the SSR gene, EST SSR molecular marker primer sequence. The present invention from Sinocalycanthus transcriptome data to search 200 sequences containing different repeat units, combined with software analysis and molecular marker screened 23 polymorphic marker EST SSR rich. The invention can be applied to the endangered plant sinocalycanthuschinensis different species and among population genetic diversity analysis, germplasm identification, mutation and evolution and molecular marker assisted breeding. Good reproducibility and high reliability, it is a very effective molecular marker.

【技术实现步骤摘要】
夏蜡梅EST-SSR标记及其在遗传多样性分析中的应用
本专利技术涉及生物
，特别是涉及整个夏蜡梅属的一种基于转录组高通量测序的分子标记技术。
技术介绍
夏蜡梅Sinocalycanthuschinensis(ChengetS.Y.Chang)隶属于蜡梅科夏蜡梅属，为第三纪孑遗植物，主要分布于中国浙江省(临安市和天台县)，属于国家二级重点保护频危物种，在植物区系研究上有极大的科考价值。夏蜡梅是双子叶植物，灌木，茎丛生，花顶生，芽无鳞片等特征，具有较大的观赏价值和药用价值。夏蜡梅野生资源极少，由于其生存环境受到自然灾害和人为干扰的影响，分成许多小种群，使夏蜡梅不同种群间存在不同距离的隔离，种群间基因交流减少和内部近交率增加，导致种群内遗传多样性降低，种群间遗传分化增加。因此，急需对夏蜡梅种质资源进行有效地鉴定和就地保护。简单重复序列(simplesequencerepeat,SSR)广泛分布于真核生物和原核生物基因组中的1-6个核苷酸串联重复单元，如(GA)n，(AC)n，(GAA)n等，同一类SSR可分布于基因组的不同位置上，由于其重复次数和重复程度不同而形成每个座位的多态性。虽本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种夏蜡梅EST‑SSR标记，其特征在于：包括23个微卫星标记，其编号、核苷酸序列、引物序列和特征如下表所示：

【技术特征摘要】
1.一种夏蜡梅EST-SSR标记，其特征在于：包括23个微卫星标记，其编号、核苷酸序列、引物序列和特征如下表所示：所述核苷酸序列和引物序列的序列编号为序列表中的编号。2.一种夏蜡梅EST-SSR标记，其特征在于：包括如下步骤：(1)夏蜡梅转录组测序；(2)SSR序列的筛选与鉴定，筛选得到了2...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵宏波，董彬，张超，付建新，周莉花，黄耀辉，吴静，
申请(专利权)人：浙江农林大学，
类型：发明
国别省市：浙江,33