rs1042658在预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险中的应用制造技术

本发明专利技术公开了rs1042658在预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险中的应用。本发明专利技术所保护的技术方案是检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在制备筛查中国人新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征高死亡风险患者中的应用和在制备预测中国人新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患者死亡风险的产品中的应用。可将检测rs1042658的多态性或基因型的物质与其它物质(如检测其它的与中国人新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患者死亡风险相关的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起预测中国人新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患者死亡风险。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物
中rs1042658在预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险中的应用。
技术介绍
发热伴血小板减少综合征是在我国农村地区首次被发现的一种新发传染病。病原体是布尼亚病毒科白蛉病毒属中的一种新型病毒，名为新布尼亚病毒。被该病毒感染后，经过机体自身的免疫反应，仍然有大约12％的感染者发病且出现广泛的临床症状谱，甚至可能导致死亡，提示个体的遗传因素在该病的发生起重要作用。鉴定新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡的易感基因有助于预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患者死亡的个体风险和群体风险，且有助于阐明与此疾病相关的发病机制。粒细胞集落刺激因子(G-CSF)，是一种重要的造血生长因子，对人体外周血粒细胞数量和功能维持起着十分关键作用。目前已经有关于G-CSF与外周血粒细胞的关系及其与一些疾病的相关性已有较多的研究报导。单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)是存在于某一(些)群体、正常个体的基因组DNA中单碱基的序列差异，是继限制性酶切长度多态性和微卫星之后的第三代遗传标记。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题是如何预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险。为解决上述技术问题，本专利技术首先提供了下述任一用途：A1)检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在制备预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险产品中的应用；A2)检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在制备筛查新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征高死亡风险患者产品中的应用；A3)检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在制备检测与新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险相关的单核苷酸多态性的产品中的应用；A4)检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定与新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险相关的单核苷酸多态性的产品中的应用；B1)人基因组中rs1042658的多态性或基因型在制备预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患者死亡风险产品中的应用；B2)人基因组中rs1042658的多态性或基因型在制备筛查新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征高死亡风险患者产品中的应用；B3)检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险中的应用；B4)检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在筛查新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征高死亡风险患者中的应用；B5)检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在检测与新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险相关的单核苷酸多态性的中的应用；B6)检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定与新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险相关的单核苷酸多态性的中的应用；B7)人基因组中rs1042658的多态性或基因型在预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患者死亡风险中的应用；B8)人基因组中rs1042658的多态性或基因型在筛查新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征高死亡风险患者中的应用。rs1042658是人染色体上的一个二等位多态性的SNP位点，该变异是转换(C/T，在其互补链上则为G/A)。所述rs1042658基因型是CC、CT或TT。所述CC是rs1042658位点为C的纯合型，所述TT是rs1042658位点为T的纯合型，所述CT是rs1042658位点为C和T的杂合型。所述检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型具体可通过检测rs1042658的核苷酸种类确定。上述用途中，所述检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质可为扩增包括rs1042658在内的基因组DNA片段的PCR引物和/或单碱基延伸引物。上述用途中，所述C/T和T/T基因型的个体在新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患者死亡群体中的比例低于其在新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患者非死亡群体中的比例。上述用途中，所述新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征可为中国人群新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征。为解决上述技术问题，本专利技术还提供了含有检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质的产品。本专利技术所提供的含有检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质的产品，为a)-d)中的任一种产品：a)检测与新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；b)鉴定或辅助鉴定与新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患者死亡风险相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；c)筛查新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征高死亡风险患者产品；d)预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患者死亡风险产品。上述产品中，所述检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质可为扩增包括rs1042658在内的基因组DNA片段的PCR引物和/或单碱基延伸引物。上述产品中，所述新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征可为中国人群新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征。为解决上述技术问题，本专利技术还提供了下述M1)或M2)的方法：M1)预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险的方法，包括：检测待测对象基因组中rs1042658位点的基因型，rs1042658位点为CC基因型待测对象新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征的死亡风险分别高于或候选高于rs1042658位点为CT基因型和TT基因型的待测对象；M2)筛查新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征高死亡风险患者的方法，包括：检测待测对象基因组中rs1042658位点的基因型，rs1042658位点为CC基因型的待测对象为或候选为新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征高死亡风险患者；rs1042658位点为CT基因型的待测对象为或候选为新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征低死亡风险患者；rs1042658位点为TT基因型的待测对象为或候选为新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征低死亡风险患者。上述方法中，检测待测对象基因组中rs1042658位点的基因型可采用所述检测rs1042658的多态性或基因型的物质进行。上述方法中，所述新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征可为中国人群新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征。本专利技术中，所述PCR引物可为P1和P2；所述P1是如下a1)至a4)中的任一种单链DNA：a1)序列表中SEQ ID No.1所示的单链DNA；a2)在a1)的5′端和/或3′端添加一个或几个核苷酸得到的单链DNA；a3)与a1)或a2)限定的单链DNA具有85％以上的同一性的单链DNA；a4)在严格条件下与a1)或a2)限定的单链DNA杂交的单链DNA；所述P2可为如下b1)至b4)中的任一种单链DNA：b1)序列表中SEQ ID No.2所示的单链DNA；b2)在b1)的5′端和/或3′端添加一个或几个核苷本文档来自技高网...

【技术保护点】
检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在制备预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险产品中的应用。

【技术特征摘要】
1.检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在制备预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险产品中的应用。2.检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在制备筛查新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征高死亡风险患者产品中的应用。3.检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在制备检测与新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。4.检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定与新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。5.下述任一应用：B1)人基因组中rs1042658的多态性或基因型在制备预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患者死亡风险产品中的应用；B2)人基因组中rs1042658的多态性或基因型在制备筛查新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征高死亡风险患者产品中的应用；B3)检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险中的应用；B4)检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在筛查新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征高死亡风险患者中的应用；B5)检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在检测与新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险相关的单核苷酸多态性的中的应用；B6)检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定与新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险相关的单核苷酸多态性的中的应用；B7)人基因组中rs1042658的多态性或基因型在预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患者死亡风险中的应用；B8)人基因组中rs1042658的多态性或基因型在筛查新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征高死亡风险患者中的应用。6.含有检测人基因组中rs1042658的多态性或基因型的物质的产品，为a)-d)中的任一种产品：a)检测与新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征死亡风险相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；b)鉴定或辅助鉴定与新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患者死亡风险相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；c)筛查新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征高死亡风险患者产品；d)预测新布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征患...

【专利技术属性】
技术研发人员：张小爱，刘玮，曹务春，张泮河，
申请(专利权)人：中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究所，
类型：发明
国别省市：北京;11