一种呼吸道合胞病毒A/B亚型多重荧光定量PCR检测引物组和探针组及其试剂盒和制备方法技术

技术编号:13158835 阅读:79 留言:0更新日期:2016-05-09 20:43
本发明专利技术提供了一种呼吸道合胞病毒A/B亚型多重荧光定量PCR检测引物组和探针组及其试剂盒和制备方法。所述引物组序列如SEQ ID NO:1-4所示,所述探针组序列如SEQ ID NO:5-6所示。本发明专利技术还提供了一种呼吸道合胞病毒A/B亚型多重荧光定量PCR检测试剂盒,包括反应管、酶混合物、引物组和探针组,所述引物组的序列如SEQ ID NO:1-4所示,所述探针组的序列如SEQ ID NO:5-6所示。该引物组和探针组及其试剂盒能实现呼吸道合胞病毒A/B亚型的简便分型,具有特异性高、灵敏度高、快速、操作简单方便、成本低廉等多种优点。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学检测
,具体设及一种呼吸道合胞病毒A/B亚型多 重巧光定量PCR检测引物组和探针组及其试剂盒和制备方法。
技术介绍
呼吸道感染一直是困扰人类最常见、发生率最高的疾病,是引起老人和儿童因病 死亡最多病因,也是新发和突发传染病的最主要病源因素。每年急性呼吸道感染在发展中 国家导致四至五百万的儿童死亡,死亡的主要病因是肺炎。其中呼吸道合胞病毒(RSV, respirato巧syn巧tial virus)是最常见的致儿童肺炎的病原体之一。 RSV是属于副粘病毒科的负链RNA病毒,可表达11种蛋白。它可W感染有纤毛的气 道上皮细胞并快速的导致细胞损伤,是儿童中最重要的导致毛细支气管炎和肺炎的病原 体。在北京,48%的病毒性肺炎和58%的毛细支气管炎系由RSV引起(1980~1984),在美国, 20%~25%的婴幼儿肺炎和50%~75%的毛细支气管炎由RSV引起。根据我们呼吸疾病国 家重点实验室对广州地区2009年7月至2012年6月Ξ年的监测结果发现在14岁W下儿童急 性呼吸道疾病患者中RSV阳性率最高,占病原阳性患者的32.5%。 RSV根据其抗原性的差异分为A(RSV-A)和B(RSV-B)两个主要的抗原亚型,两种亚 型独立传播。对于两种亚型RSV感染患者的临床特征的研究一直是RSV感染研究的重要的方 向,对其的研究将为RSV感染的治疗及疫苗的开发提供路径,具有极为重要的意义。 鉴于RSV感染的严重性,急需对其进行有效的防控与治疗。而在进行防控和治疗的 过程中,首先最关键瓶颈就是准确、实用的快速检测鉴定技术。 就目前情况,对RSV-A/B亚型分型检测主要W下几种方法:病毒分离;抗原-抗体反 应;普通RT-PCR/巢式PCR;单重巧光定量PCR。相比较几种方法,前两种方法为经典方法,但 存在要求条件高、周期长、灵敏度不高的问题;PCR方法是近些年来所开发的针对病原体核 酸的检测方法,克服了前面两种方法中存在的周期长、灵敏度不高的问题,特别是巧光定量 PCR方法的引进,解决了 PCR方法容易产生假阳性的问题,使其得到了快速的发展,该方法具 有高特异性、高灵敏度、周期短等多种优点。但目前开发的RSV-A/B检测试剂基本都为单重 巧光定量PCR检测试剂,操作繁琐、费时耗力,同时由于单重试剂无法对样品采集与样品核 酸提取成功与否进行有效监控,具有一定的局限性。
技术实现思路
为克服上述技术缺陷,本专利技术提供了一种呼吸道合胞病毒A/B亚型多重巧光定量 PCR检测引物组和探针组及其试剂盒和制备方法。该引物组和探针组及其试剂盒能实现呼 吸道合胞病毒A/B亚型的简便分型,具有特异性高、灵敏度高、快速、操作简单方便、成本低 廉等多种优点。[000引本专利技术所述引物组序列如569 10^:1-4所示,所述探针组序列如569 10^:5-6 所示。 本专利技术还提供了一种呼吸道合胞病毒A/B亚型多重巧光定量PCR检测试剂盒,包括 反应管、酶混合物、引物组和探针组,所述引物组的序列如SEQ ID NO: 1-4所示,所述探针组 的序列如沈Q ID NO:5-6所示。 本专利技术还提供了一种呼吸道合胞病毒A/B亚型多重巧光定量PCR检测试剂盒的制 备方法,其制备方法包括: (1)步骤一:制备引物[001引制备RSV-A、RSV-B的特异性引物及阳性对照beta-actin的特异性引物; [001引35¥-4、1?5¥-8的特异性引物序列如沈9 10^):1-4所示; 阳性对照beta-actin的特异性引物序列如沈Q ID N0:7-8所示; (2)步骤二:制备探针审恪RSV-A、RSV-B的特异性探针及阳性对照beta-actin的特异性探针,其中探针 分别采用FAM-B册1、Texas red-B册2、J0E-B册1标记; 35¥-4、1?5¥-8的特异性探针序列如沈9 10備:5-6所示; 阳性对照be化-actin的特异性探针序列如沈Q ID NO:9所示; (3)步骤制备RT-PCR反应体系 RT-PCR缓冲液:Pr imeScr ipt-步法RT-PCR试剂盒中的RT-PCR缓冲液;引物使用量:7-15pmol; 探针使用量:〇.5-5pmol; 上述引物探针缓冲液混合物的配制:1祉1/反应 酶混合物:2μ1;模板:化1; 反应总体积:2化1。 与现有技术相比,本方法采用多重巧光PCR的方法对RSV-A/B亚型进行同时检测, 通过加入beta-actin内对照检测监测样品采集及提取情况,具有特异性高、灵敏度高、快 速、操作简单方便、成本低廉等多种优点,可作为RSV-A/B亚型病毒检测的试剂,用于科研及 临床应用。【附图说明】[002引图1 RSV-A/B多重检测试剂中RSV-A灵敏度图谱; 图2 RSV-A/B多重检测试剂中RSV-B灵敏度图谱; 图3 RSV-A/B多重检测试剂中Be化-actin灵敏度图谱; 图4 RSV-A/B多重检测试剂标准曲线。【具体实施方式】 为使本专利技术更加容易理解,下面结合具体实施例,进一步阐述本专利技术。应理解,运 些实施例仅用于说明本专利技术而不用于限制本专利技术的范围,下列实施例中未提及的具体实验 方法,通常按照常规实验方法进行。 实施例1 :RSV-A、RSV-B及内参be化-actin引物探针设计及特异性实验 1、引物探针 本方法采用taqman探针技术。通过Genebank中RSV-A、RSV-B的基因序列及beta- actin基因序列资料,分别对RSV-A、RSV-B及beta-actin进行引物探针设计,其中探针分别 采用FAM-B册UTexas red-B册2、1〇6-册91标记。表1为1?5¥-4、1?5¥-8及66化-日。1111引物及探 针序列表。 表 1[003引 2、对照样品 实验采用培养分离的阳性株或临床株进行,阳性株来源于广州呼吸疾病研究所、 呼吸疾病国家重点实验。RSV-A、RSV-B作为阳性对照,同时使用流感A、流感B、副流感1、副流 感2、副流感3、腺病毒ADV、鼻病毒HRV、偏肺病毒HMP、冠状病毒229E、0C43、肺炎支原体MP、肺 炎衣原体CP作为阴性对照,使用E. coli作为be化-actin阴性对照。 3、制备模板实验分别取10化1培养物标本,通过常规RNA/DNA提取方法提取,得到50μ1核酸产 物,使用DEPC水对核酸提取产物100倍稀释后作为模板(其中冠状病毒及偏肺病毒产物稀释 10倍)。 4、反应体系 使用'PrimeScript-步法 RT-PCR 试剂盒(Ver.2)'(TAKARA'PrimeScript One Step RT-PCR Kit Ver.2')中的RT-PCR缓冲液进行试剂配制,其中 引物使用量为7-15pmol [004引探针使用量为0.5-5pmol 反应总体积为25μ1; 配制试剂体积1祉1/反应(预留化1用于添加酶混合物;预留化1用于添加模板)。 [004 引 5、RSV-A、RSV-B 和 be 化-actin 单重巧光 PCR 反应 为验证所设计的引物和探针的特异性,首先设计单重巧光PCR反应,对引物和探针 进行评估,即分别检测RSV-A、RSV-B和be化-act本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种呼吸道合胞病毒A/B亚型多重荧光定量PCR检测引物组和探针组,其特征在于,所述引物组序列如SEQ ID NO:1‑4所示,所述探针组序列如SEQ ID NO:5‑6所示。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:刘文宽周荣许多邱淑燕
申请(专利权)人:广州医科大学附属第一医院
类型:发明
国别省市:广东;44

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