一种茶树DNA的提取方法技术

技术编号:12731441 阅读:93 留言:0更新日期:2016-01-20 15:06
本发明专利技术涉及茶树DNA的提取方法,具体步骤如下:(1)取茶树嫩叶、成熟叶或茶树嫩根放研磨成粉末状;(2)取粉末放入离心管,依次加入水浴的提取液,β-巯基乙醇,60℃-70℃,水浴15-25min,得粗样品;(3)加入RNase-A混匀后,40℃水浴5min,得粗样品;(4)取出离心管先后加入Tris平衡酚和氯仿/异戊醇,混匀后离心得上清液;(5)将上清液用-20℃预冷无水乙醇,清洗两次;(6)将步骤(5)得到的沉淀物中加入45℃预热去离子水,放入45℃水浴锅中溶解,重复步骤(5)的操作一至两次,蒸发剩余乙醇,在加入200µL去离子水后获得DNA。本发明专利技术提取的茶树叶片的基因组DNA浓度高、提取时间短。

【技术实现步骤摘要】
【专利说明】一种茶树DNA的提取方法
本专利技术属于生物
,具体涉及一种茶树DNA的提取方法。
技术介绍
茶树(Camellia sinensis (L.) 0.Kuntze)属山茶科山茶属茶亚属茶种植物,起源于我国西南地区,经长期的引种、传播,我国茶树生长区域从N 18° 30' -35° 13',E94° -122°,南至热带边缘,北至暖温带。我国是茶树的主要原产地,至今已有3000多年的人工栽培历史,经过几千年的人工或自然育种,形成了非常丰富的茶树种质资源。DNA分子标记技术是研究茶树起源、分子演化、遗传多样性、品种鉴定的一个重要工具。目前常见的茶树DNA提取方法主要是CTAB法和SDS法,这两种方法已有很多研究,也有很多优化方案。由于茶树组织中含有大量的多糖多酚,而多糖多酚又容易与DNA结合,所以茶树DNA的提取一直没有理想的方法。而通过对已有的优化方法进行重复发现:若要提取高纯度的DNA则单样提取周期长,反之,若缩短提取时间,所提的DNA纯度较低。试剂盒法提取茶树DNA,虽然提取纯度高,但因膜过滤使提取量降低。所以,如何提供一种获取的DNA浓度高、提取时间短的茶树DNA的提取方法是目前急需解决的一个难题。
技术实现思路
本专利技术的目的在于:提供一种获取的DNA浓度高、提取时间短的茶树DNA的提取方法。为了实现上述专利技术目的,本专利技术提供如下技术方案: 一种茶树DNA的提取方法,具体步骤如下: (O取茶树嫩叶、成熟叶或茶树嫩根放置于液氮中研磨成粉末状; (2)将步骤(I)的粉末中取出0.2克放入2mL的离心管后,加入650 μ L水浴的提取液,所述的提取液由 ΡΗ8.0 ; 10mmoI/L 的 Tris-盐酸、ρΗ8.0 ;20mmol/L 的 EDTA、1.0moI/L 的氯化钠、w/v比例为4%的PVP、w/v比例为2%的CTAB/SDS组成,漩涡震荡充分混匀后,再加入15 μ L的β -巯基乙醇,60°C -70°C,水浴15-25min,每隔5min混匀一次,得到粗样品;(3)水浴结束后加入ΙΟμ?,10mg/mL的RNase-A混匀后,40°C水浴5min,得到粗样品; (4)取出离心管先后加入PH8.0 ;400μ?的Tris平衡酚和400μ?氯仿/异戊醇,漩涡震荡充分混匀后10000 rpm离心lOmin,获得上清液; (5)将步骤(4)的上清液移至一个新的2mL的离心管中,加入3倍上清液体积的-20°C预冷无水乙醇,混匀,此时有DNA析出,倒去上清液,后再用lml-20°C预冷无水乙醇清洗一次,倒去上清液; (6)将步骤(5)得到的沉淀物中加入45°C预热的去离子水,再放入45°C水浴锅中溶解,重复步骤(5)的操作一至两次,1000rpm离心Imin后,去上清后再次空转1000rpm离心30s后放在常温真空干燥器中蒸发剩余乙醇,待沉淀微白时取出,加入200μ?去离子水后获得DNA,后将提取的DNA放置_20°C冰箱中备用。优选地,步骤(2)中CTAB/SDS的体积比为1:6。优选地,步骤(4)中氯仿/异戊醇的体积比为24:1。本专利技术的有益效果在于: 1、提取的茶树叶片的基因组DNA浓度高。2、提取时间短,在1-2小时内可以完成,且所用试剂价格便宜,降低了成本。通过反复实验验证,在提取试剂中加入可以结合多酚的试剂,同时简化操作步骤。使提取的DNA的质量与含量都较高的同时将提取单个样品的时间控制在lOOmin以内,大大节省了操作的时间,由于提取试剂可以自行配制降低实验的成本。【附图说明】 图1是本专利技术提取的茶树DNA的电泳图; 图2是本专利技术提取的茶树DNA进行PCR扩增的电泳图。【具体实施方式】 茶树DNA的提取方法,具体步骤如下: (1)取茶树嫩叶、成熟叶或茶树嫩根放置于液氮中研磨成粉末状; (2)将步骤(1)的粉末中取出0.2克放入2mL的离心管后,加入650 μ L水浴的提取液,所述的提取液由 ΡΗ8.0 ;100mmol/L 的 Tris-盐酸、pH8.0 ;20mmol/L 的 EDTA、1.0mol/L 的氯化钠、w/v比例为4%的PVP、w/v比例为2%的CTAB/SDS组成,漩涡震荡充分混匀后,再加入15 μ L的β -巯基乙醇,60°C -70°C,水浴15-25min,每隔5min混匀一次,得到粗样品; (3)水浴结束后加入ΙΟμ?,10mg/mL的RNase_A混匀后,40°C水浴5min,得到粗样品; (4)取出离心管先后加入PH8.0 ;400μ?的Tris平衡酚和400μ?氯仿/异戊醇,漩涡震荡充分混匀后10000 rpm离心lOmin,获得上清液; (5)将步骤(4)的上清液移至一个新的2mL的离心管中,加入3倍上清液体积的-20°C预冷无水乙醇,混匀,此时有DNA析出,倒去上清液,后再用lml-20°C预冷无水乙醇清洗一次,倒去上清液; (6)将步骤(5)得到的沉淀物中加入45°C预热的去离子水,再放入45°C水浴锅中溶解,重复步骤(5)的操作一至两次,lOOOOrpm离心lmin后,去上清后再次空转lOOOOrpm离心30s后放在常温真空干燥器中蒸发剩余乙醇,待沉淀微白时取出,加入200μ?去离子水后获得DNA,后将提取的DNA放置_20°C冰箱中备用。其中,步骤(2 )中CTAB/SDS的体积比为1:6 ;步骤(4)中氯仿/异戊醇的体积比为24:1。1、DNA核酸定量 测定上述方法提取的茶树DNA在230nm,260nm、280nm的光密度值,通过计算得到以下数据:A260/A280=2.00,A260/A230=l.98,DNA 浓度=577.7ng/^L。以上数据可以看出:本专利技术的方法提取的DNA浓度高,纯度高,受RNA、碳水化合物和盐类的污染较少。2、琼脂糖凝胶电泳分析 称取2g琼脂糖粉末于锥形瓶中,加入0.5 X TBE电泳缓冲液20ml ;随即用微波炉加热至粉末完全溶化,稍摇匀,待溶液完全透明,冷却至60°C左右,倒入已经在一端插好梳子的有机玻璃胶槽中。当胶凝固后,拔起梳子,将加样孔端放进电泳槽阴极段。在电泳槽内加0.5XTBE缓冲液至液面覆盖过胶面。用移液枪取2 μ I本专利技术提取的DNA原液和I μ Iloadingbuffer,充分混匀后加进点样孔;在0.5 X TBE缓冲液中用100 V电压,电泳40 min,最后将凝胶置于紫外光与凝胶成像系统上观察,并保存图像,如图1所示。从图1中可以看出:使用本专利技术的方法提取的基因组DNA电泳呈现一条较粗且明亮的条带,点样孔有一点微微的发亮,表明提取的DNA样品浓度较高。3、PCR扩增及电泳分析 PCR的扩增检测,所用引物是上海生工公司生产引物Ss2,反应仪器S1000? PCR仪。PCR 反应总体积为 11 μ 1,其中模板 DNA 2.0 μ 1,PCR buffer 1.0 μ I, MgCl2 1.0 μ I, dNTP0.9 μ 1,引物 0.5 μ 1,taqDNA 聚合酶 0.1 μ I。PCR循环程序:95°C预变性I分钟,98°C变性15秒,57°C退火25秒;然后72°C延伸20秒,一共35个循环,最后延伸10分钟,4°C本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种茶树DNA的提取方法,其特征在于,具体步骤如下:(1)取茶树嫩叶、成熟叶或茶树嫩根放置于液氮中研磨成粉末状;(2)将步骤(1)的粉末中取出0.2克放入2mL的离心管后,加入650μL水浴的提取液,所述的提取液由pH8.0;100mmol/L的Tris‑盐酸、pH8.0;20mmol/L的EDTA、1.0mol/L的氯化钠、w/v比例为4%的PVP、w/v比例为2%的CTAB/SDS组成,漩涡震荡充分混匀后,再加入15μL的β‑巯基乙醇,60℃‑70℃ ,水浴15‑25min,每隔5min混匀一次,得到粗样品;(3)水浴结束后加入10µL,10mg/mL 的RNase‑A混匀后,40℃水浴5min,得到粗样品;(4)取出离心管先后加入PH8.0;400µL的Tris平衡酚和400µL氯仿/异戊醇,漩涡震荡充分混匀后10000 rpm离心10min,获得上清液;(5)将步骤(4)的上清液移至一个新的2mL的离心管中,加入3倍上清液体积的‑20℃预冷无水乙醇,混匀,此时有DNA析出,倒去上清液,后再用1ml‑20℃预冷无水乙醇清洗一次,倒去上清液;(6)将步骤(5)得到的沉淀物中加入45℃预热的去离子水,再放入45℃水浴锅中溶解,重复步骤(5)的操作一至两次,10000rpm离心1min后,去上清液后再次空转10000rpm离心30s后放在常温真空干燥器中蒸发剩余乙醇,待沉淀微白时取出,加入200µL去离子水后获得DNA,后将提取的DNA放置‑20℃冰箱中备用。...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:丁洲李烨昕江昌俊刘学诗
申请(专利权)人:安徽农业大学
类型:发明
国别省市:安徽;34

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