快速检测-α21.9缺失型地中海贫血等位基因的试剂盒制造技术

技术编号:12525029 阅读:87 留言:0更新日期:2015-12-17 14:02
本发明专利技术公开了一种快速检测-α21.9缺失型地中海贫血等位基因的试剂盒。该试剂盒包括扩增引物,扩增引物具体为一对可以扩增α-珠蛋白基因簇中-α21.9等位基因的特征序列的引物21.9-F和21.9-R,其中:21.9-F:5’-GGAGCTTTTCCTTCCCTGGAACG-3’;21.9-R:5’-TGTGGTTGGAGAATGGAGGTGG-3’。采用本发明专利技术所述试剂盒可以实现单管单次反应完成-α21.9缺失型地中海贫血等位基因的检测,具有高度的灵敏性、稳定性和准确性,以及较高的特异性。本发明专利技术试剂盒应用于溶解曲线法时,无需开管操作,降低PCR产物被污染的可能;成本更低也更易于推广。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术设及医学检测
,具体设及一种快速检测-a 缺失型地中海贫血 等位基因的试剂盒。
技术介绍
地中海贫血也称珠蛋白合成障碍性贫血,简称地贫。地中海贫血是广西地区最常 见的单基因遗传疾病之一,常见的地贫种类有a-地贫和0-地贫。中国人群中,a-地贫 的基因型常见的为缺失型一SE\-ai7和-a4^2。2013年,钦州市妇幼保健院检测出了一种 命名为'钦州型a地贫缺失型'的罕见地贫基因型,由于该基因型的分子生物学机制为a 珠蛋白基因簇(NG_000006. 1)中一段21. 9化的DNA序列的缺失,因此简写为-a3L9^ong J,YanS,LaoK,PangW,YeX,SunL.Thediagnosisandmolecularanalysisofanovel 21. 9kbdeletion(Qinzhoutypedeletion)causing曰+thalassemia.BloodCellsMol Dis. 2014 ;52 (4) :225-9.)。在日常工作中,申请人发现该基因型在广西有一定的分布几率, 为降低该基因型的漏诊,需建立一种可W快速-aU'9等位基因的检测试剂盒。
技术实现思路
[000引本专利技术要解决的技术问题是提供一种快速检测-Q2I^9缺失型地中海贫血等位基 因的试剂盒。采用该试剂盒可W实现单管单次反应完成-aU'9缺失型地中海贫血等位基因 的检测,具有高度的灵敏性、稳定性和准确性,W及较高的特异性。 本专利技术所述的快速检测-aU'9缺失型地中海贫血等位基因的试剂盒,包括扩增引 物,所述的所述的扩增引物为:一对可W扩增a-珠蛋白基因簇中-a21^9等位基因的特征 序列的引物21.9-F和21.9-R,其中: 阳005] 21. 9-F:5> -GGAGCTTTTCCTTCCCTGGAACG-3> ; 21.9-R: 5' -TGTGGTTGGAGAATGGAGGTGG-3'。 本专利技术所述试剂盒适用于溶解曲线法、琼脂糖凝胶电泳法等,尤其适用于溶解曲 线法。 本专利技术所述的快速检测-aU'9缺失型地中海贫血等位基因的试剂盒还包括一些 现有试剂盒中常规且必须的组分,如缓冲液、酶液、染料、MgClz和dNTP等。具体地,酶液为 Taq聚合酶体系,包括可用于溶解曲线法的热启动酶体系等;缓冲液为常规的PCR缓冲液; 当酶液选择采用康为世纪所生产的GoldStarTaqDNAPolymerase时,缓冲液则优选为与 GoldStarTaqDNAPolymerase配套的缓冲液。所述的染料为现有技术中的常规选择,如可 W是SYBRGreenI染料。 当本专利技术所述试剂盒应用于溶解曲线法(即基于溶解曲线法的快速检测-a21^9缺 失型地中海贫血等位基因的试剂盒)时,采用该试剂盒快速检测-a9缺失型地中海贫血 等位基因的方法包括W下步骤: 1)抽提样本基因组DNA,制备DNA模板; 2)配制反应体系,具体为: 阳01引将引物21. 9-F和21. 9-R;W及PCR缓冲液、酶液、染料、MgClz、dNTP、水和DNA模 板配制成反应体系; 3)样本检测:分别将配制的反应体系进行PCR扩增,实验结束后采用实时巧光定 量PCR仪自带分析软件读取溶解曲线数据; 4)数据分析及结果判定:根据实时巧光定量PCR仪自带的分析软件分析判读结 果,当样本的溶解曲线在82. 5~83. 5°C有峰时,则表示该样本携带-a21'9等位基因;若样 本的溶解曲线在82. 5~83. 5°C没有峰时,则表示该样本不携带-a21^9等位基因。 上述方法的步骤1)中,采用现有常规方法制备DNA模板。 上述方法的步骤2)中,反应体系中各组分的浓度优选为:待检测DNA:1~化g/ yL;各引物:0. 3 ~0. 5ymol/L;DNA模板:20 ~200ng;儀离子:1. 5 ~1. 9mmol/L;染料稀 释到1X;反应体系的终体积优选为20yL。 上述方法的步骤3)中,PCR扩增条件为:95°C预变性8~12分钟,然后95°C15~ 30秒,60°C退火50~70秒,39~49个循环,所有循环结束后进行溶解曲线分析。 与现有技术相比,本专利技术的特点在于: 1、本专利技术所述试剂盒可W实现单管单次反应完成-a2I'9缺失型地中海贫血等位 基因的检测,具有高度的灵敏性、稳定性和准确性,W及较高的特异性。 2、当本专利技术所述试剂盒应用于溶解曲线法中W检测-a2I'9缺失型地中海贫血等 位基因(即基于基于溶解曲线法的快速检测-a21^9缺失型地中海贫血等位基因的试剂盒) 时,无需开管操作,极大限度地降低实验室PCR产物污染的可能;另一方面,采用溶解曲线 分析法,该方法是目前使用实时巧光定量PCR仪中最廉价的实验体系构建方法,成本更低 也更易于推广。【附图说明】 图1为本专利技术实施例1中1#样本的溶解曲线; 阳022] 图2为本专利技术实施例1中2#样本的溶解曲线。【具体实施方式】下面结合具体实施例对本专利技术作进一步的详述,W更好地理解本专利技术的内容,但 本专利技术并不限于W下实施例。 实施例1 :采用本专利技术所述试剂盒在已知基因型样本中的检测结果 阳0巧]1、试剂盒的组成: 可W扩增a-珠蛋白基因簇中-Q2I'9等位基因的特征序列的引物对21.9-F和 21. 9-R: 21. 9-F:5,-GGAGCTTTTCCTTCCCTGGAACG-3,(SEQIDNO:1); 21. 9-R:5'-TGTGGTTGGAGAATGGAGGTGG-3'(沈QIDNO:2); 其它组成成分: SYBRGreenI染料、GoldStarTaqDNAPolymerase、与GoldStarTaqDNA Polymerase配套的缓冲液和dNTPs均购自康为世纪,MgClz购自LifeTechnology。 按下述表I配制PCR反应体系: 表 1 :(ml表示mmol/LJiM表示Jimol/L) 2、实施方法: PCR反应所用仪器为Bio-Rad实时热循环仪CFX96。PCR反应程序为:95°C预变性 10分钟,然后95°C15秒,60°C退火60秒,40个循环,所有循环结束后进行溶解曲线分析。 样本处理:采用L油-AidDNAminiextractionkid度i〇-V,Xiamen)试剂盒抽提 DM,W双蒸水稀释至20~20化g/yL备用。DNA样本也可采用其他常规DNA提取方法提 取。 样本检测:将1份用常规方法检测确定的已知基因型待检样本(简称1#样本), W及1份正常基因型(aa/aa,N/N)样本(简称2#样本),根据上述反应体系和反应程 序,于实时巧光定量PCR仪上进行扩增检测,所有循环结束后进行溶解曲线分析。 3、样本来源:所有样本均来源自经常规Gap-PCR技术确定基因型的DNA样本。 4、数据分析及结果判定:若待检样本的溶解曲线在82. 5~83. 5°C有峰,则表示 该样本携带-O21^9等位基因;若该溶解曲线在82. 5~83. 5°C没有峰,则表示该样本不携 带-Cl21'9等位基因。经过检测,1#样本的溶解曲线如图1所示,在83°C有峰出现(具体请见 表2),表示1#样本携带-a2L9等位基因;2#样本的溶解曲线本文档来自技高网...

【技术保护点】
快速检测‑α21.9缺失型地中海贫血等位基因的试剂盒,包括扩增引物,其特征在于:所述的所述的扩增引物为:一对可以扩增α‑珠蛋白基因簇中‑α21.9等位基因的特征序列的引物21.9‑F和21.9‑R,其中:21.9‑F:5’‑GGAGCTTTTCCTTCCCTGGAACG‑3’;21.9‑R:5’‑TGTGGTTGGAGAATGGAGGTGG‑3’。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:龙驹吴素萍孙雷
申请(专利权)人:钦州市妇幼保健院
类型:发明
国别省市:广西;45

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1