单核苷酸多态性rs2359536在检测垂体腺瘤中的应用制造技术

本发明专利技术公开了单核苷酸多态性rs2359536在检测垂体腺瘤中的应用。本发明专利技术所保护的一个技术方案是检测人基因组中rs2359536的多态性(等位基因)或基因型的物质在制备检测与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性的产品中的应用。可将检测rs2359536的多态性或基因型的物质与其它物质(如检测其它的与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备筛查垂体腺瘤患者的产品。

【技术实现步骤摘要】
单核苷酸多态性rs2359536在检测垂体腺瘤中的应用
本专利技术涉及生物医学领域中单核苷酸多态性rs2359536在检测垂体腺瘤中的应用。
技术介绍
垂体腺瘤(Pituitaryadenomas)是人体最常见的神经内分泌性肿瘤，也是最常见的脑肿瘤之一。功能性垂体腺瘤会异常分泌激素，导致患者出现不孕不育、肢端肥大、Cushing综合症、甲亢等显著的内分泌紊乱症状，进而严重损害心肝肾等重要脏器功能。垂体腺瘤发病隐匿，生长缓慢，当患者出现临床症状前往就诊时，肿瘤往往已体积巨大，或呈侵袭性生长，压迫邻近重要解剖结构，导致患者出现垂体功能低下、双眼视力下降和颅神经麻痹等神经功能缺失症状，甚至发展为不可逆神经功能损害，严重影响患者的生活质量，甚至危及生命。目前垂体腺瘤的临床治疗以手术切除为主，药物和立体定向放疗为辅。但该病并非是一种简单的神经外科疾病，而是一种牵涉内分泌科、妇产科、男性科、眼科、放疗科、影像医学科等多学科的复杂疾病，在临床诊疗中仍存在诸多的瓶颈难题。垂体腺瘤的发病机制不清，早期诊断困难，如能早期诊断出垂体腺瘤，并对其采取分层的二级预防及诊治，对于及时终止因肿瘤异常分泌激素对患者心肝肾等重要脏器产生的严重功能损害、防止因肿瘤持续隐匿生长压迫所致的不可逆神经功能损害以及降低治疗风险均有着非常重要的临床意义。目前临床上用于确诊垂体腺瘤的核磁共振检查(MRI)，不仅费用较昂贵，难以用于临床病例的大规模筛检，且由于受到分辨率的限制，难以发现直径<0.5cm的微腺瘤。故目前急需简便、价廉的垂体腺瘤早期诊断工具和方法。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题是如何筛查垂体腺瘤患者。为解决上述技术问题，本专利技术首先提供了下述A1)-A6)中的任一用途：A1)检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备筛查垂体腺瘤患者产品中的应用；A2)检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备检测垂体腺瘤易感性产品中的应用；A3)检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备检测与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性的产品中的应用；A4)检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性的产品中的应用；A5)人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型在制备筛查垂体腺瘤患者产品中的应用；A6)人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型在制备检测垂体腺瘤易感性产品中的应用。rs2359536是人染色体10p12.31上的一个二等位多态性的SNP位点，该变异是转换(A/G，在其互补链上则为T/C)。所述rs2359536基因型是AA、AG或GG。所述AA是rs2359536位点为A的纯合型，所述GG是rs2359536位点为G的纯合型，所述AG是rs2359536位点为A和G的杂合型。所述检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型具体可为检测rs2359536的核苷酸种类。上述用途中，所述产品包括扩增包括rs2359536在内的基因组DNA片段的PCR引物和/或单碱基延伸引物；和/或，所述检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质可为所述PCR引物和/或所述单碱基延伸引物。上述用途中，所述GG和所述AG基因型的个体在垂体腺瘤患者群体中的比例分别高于对应的基因型在正常健康人群体中的比例。上述用途中，所述垂体腺瘤具体为中国人群垂体腺瘤。为解决上述技术问题，本专利技术还提供了含有检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质的产品。本专利技术所提供的含有检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质的产品，为a)-d)中的任一种产品：a)检测与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性(即等位基因)或基因型的产品；b)鉴定或辅助鉴定与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性(即等位基因)或基因型的产品；c)筛查垂体腺瘤患者产品；d)检测垂体腺瘤易感性产品。上述产品中，所述产品包括扩增包括所述PCR引物和/或所述单碱基延伸引物；和/或，所述检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质可为所述PCR引物和/或所述单碱基延伸引物。上述产品中，所述GG和所述AG基因型的个体在垂体腺瘤患者群体中的比例分别高于对应的基因型在正常健康人群体中的比例。在本专利技术的实施例中，所述垂体腺瘤具体为中国人群垂体腺瘤。本专利技术中，所述扩增包括rs2359536在内的基因组DNA片段的PCR引物对可由序列表中SEQIDNo.1所示的单链DNA和序列表中SEQIDNo.2所示的单链DNA组成；所述单碱基延伸引物的核苷酸序列如序列表中SEQIDNo.7所示。实验证明，rs2359536的风险等位基因为G，该等位基因在病例组(由垂体腺瘤患者组成)中的比例比该等位基因在对照组(由正常健康人组成)中的比例高2.76％。rs2359536的P值是2.25×10-10，且rs2359536的相对危险度是1.44，说明rs2359536是与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性。rs2359536的三个基因型中，GG基因型和AG基因型的个体在病例组垂体腺瘤患者群体中的比例分别高于对应基因型的个体在对照组正常健康人群体中的比例；AA基因型的个体在病例组垂体腺瘤患者群体中的比例低于该基因型的个体在对照组正常健康人群体中的比例。在实际应用中，可将检测rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质与其它物质(如检测其它的与垂体腺瘤相关的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备筛查垂体腺瘤患者的产品。其中，检测人基因组中rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型的物质可为通过下述至少一种方法确定rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型所需的试剂和/或仪器：DNA测序、限制性酶切片段长度多态性、单链构象多态性、变性高效液相色谱、SNP芯片、TaqMan探针技术和SequenomMassArray技术。其中，利用SequenomMassArray技术确定rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型所需的试剂和/或仪器包括PCR引物对、基于单碱基延伸反应的延伸引物、磷酸酶(如虾碱性磷酸酶(shrimpalkalinephosphatase，SAP))、树脂、芯片、MALDI-TOF(matrix-assistedlaserdesorption/ionization–timeoffligh，基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱)和/或SequenomMassArray技术所需要的其他试剂和仪器；利用TaqMan探针技术确定rs2359536的多态性(即等位基因)或基因型所需的试剂和/或仪器包括TaqMan探针、PCR引物对、定量PCR仪、进行基因分型的模块(如7500SystemSDSsoftware)和/或TaqMan探针技术所需要的其他试剂；SNP芯片包括基于核酸杂交反应的芯片、基于单碱基延伸反应的芯片、基于等位基因特异性引物延伸反应的芯片、基于“一步法”反应的芯片、基于引物连接反应的芯片、基于限制性内切酶反应的芯本文档来自技高网...

【技术保护点】
检测人基因组中rs2359536的多态性或基因型的物质在制备筛查垂体腺瘤患者产品中的应用。

【技术特征摘要】
1.检测人基因组中rs2359536的多态性或基因型的物质在制备筛查垂体腺瘤患者产品中的应用；所述产品包括扩增包括rs2359536在内的基因组DNA片段的PCR引物和/或单碱基延伸引物；所述检测人基因组中rs2359536的多态性或基因型的物质为所述PCR引物和/或所述单碱基延伸引物。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述PCR引物为序列表中SEQIDNo.1所示的单链DNA和序列表中SEQIDNo.2所示的单链DNA；所述单碱基延伸引物为序列表中SEQIDNo.7所示的单链DNA。...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵曜，师咏勇，王镛斐，李士其，李志强，陈剑华，寿雪飞，沈明，叶钊，马增翼，张启麟，宋智健，王涛，何文强，季珏，温祖佳，周良辅，毛颖，
申请(专利权)人：复旦大学附属华山医院，上海交通大学，
类型：发明
国别省市：上海;31