猪圆环病毒2型实时荧光定量PCR MGB-TaqMan探针检测方法技术

技术编号:11117124 阅读:63 留言:0更新日期:2015-03-06 16:07
本发明专利技术涉及一种猪圆环病毒2型实时荧光定量PCRMGB-TaqMan探针检测方法,该方法利用荧光定量PCR技术,采用MGB探针,建立了猪圆环病毒2型(PCV2)检测方法。本发明专利技术具有灵敏度高,特异性强,重复性好,操作简单易被广泛应用的优势,MGB探针的淬灭基团采用非荧光淬灭基团,本身不产生荧光,可以大大的降低本底信号的强度,使检测结果更准确。达到猪圆环病毒2型快速、准确检测的目的。

【技术实现步骤摘要】
猪圆环病毒2型实时荧光定量^68-7301^3^探针检测方法
本专利技术涉及一种猪圆环病毒2型实时荧光定量?(?探针检测方法,属于生物
,适用于?”2的快速准确检测。
技术介绍
猪圆环病毒2型现被认为是引起断奶仔猪多系统衰竭综合症的主要因素,同时还发现?”2与其它疾病相关,这些疾病包括肾病皮炎综合症、繁殖障碍、出生前心肌炎和弥散坏死性肺炎。近年来该病在我国和世界各地迅速传播,感染范围日趋广泛,给养猪业造成巨大的经济损失。 ?^2是猪圆环病毒…⑶两种基因型中的一种,为小颗粒、无包膜、环状单股0嫩病毒。目前?”2常用的检测方法主要有病毒分离与鉴定、间接免疫荧光(^…、此^^免疫组织化学法(1110、原位核酸杂交等,但操作程序、检测时间、特异性检测等方面尚不理想,常规检测技术可对特定基因进行扩增,但不能进行定量分析,对低拷贝数的靶片段0嫩的有效扩增不理想,而且因交叉污染容易出现假阳性。实时荧光定量检测技术是近年来发展起来的一种新的0嫩/?嫩定量检测技术,已经越来越多的应用于人类和畜禽等动物传染病的诊断中。 实时荧光定量分为染料法和探针法,探针法较染料法又有着更高的灵敏度和特异性,检测结果更为可靠。矶荧光探针是一种寡核苷酸探针,报告荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭突光基团则在3’末端。扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收扩增时,丁叫酶的5’ 一 3’外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条0嫩链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与产物形成完全同步。 本专利技术采用的1⑶探针与普通的探针相比,又具有实验结果更精确,分辨率更高的优势,168探针提高配对与非配对模板间的II值差异,并且探针3’端的淬灭基团采用非荧光淬灭基团,本身不产生荧光,可以大大的降低本底信号的强度,使检测结果更准确。
技术实现思路
本专利技术目的在于,提供一种猪圆环病毒2型实时荧光定量?(?探针检测方法,该方法利用荧光定量?⑶技术,采用服迅探针,建立了猪圆环病毒2型0(^2)检测方法。本专利技术具有灵敏度高,特异性强,重复性好,操作简单易被广泛应用的优势,168探针的淬灭基团采用非荧光淬灭基团,本身不产生荧光,可以大大的降低本底信号的强度,使检测结果更准确。达到猪圆环病毒2型快速、准确检测的目的。 本专利技术所述的一种猪圆环病毒2型实时荧光定量?(? 1(^8-1^(112111探针检测方法,按下列步骤进行: 1设计与合成实时荧光定量?⑶检测的引物对,其序列为:上游引物?:5’ ^ 和下游引物尺:5’ -66^61^10^1^6166^10-3^ ; 以设计与合成实时荧光定量?⑶检测的探针,其序列为:5’ -^1)^00^X^000^60001X0X00 (168) -3,; 0,阳性对照标准品的制备:阳性对照标准品为实验室构建的含有?^20即2序列的克隆质粒9(^201^2序列来源于在保守序列区设计一对特异性引物,克隆载体1)1018-1,将制备的质粒进行定量,使最终浓度为1,温度-201保存; 配制反应体系,按照反应程序进行反应得到目的片段,所述反应体系为:2父?0? 188^61- 12.59 1,上下游引物各0.59 1,基因组0嫩29 1,去离子水补加至总体积 25 9 1 ;?邙反应程序为:9500 5111111,9500 308,58.6。。308,72。。2111111, 7200 10111111,35循环; 配制连接反应液,转化并提取质粒模板,所述连接反应液为快速连接混合液5 4 1,1)1018-1载体1 9 1,产物3 ^ 1,补加去离子水至总体积10 1 ; 测定质粒浓度,使最终浓度为1^10101)168/ ^ 1 ; 么定量?(?检测:将梯度稀释的标准质粒作为模板进行定量?(?检测,配制定量?⑶反应体系为:?1~6!11匕2乂 1叫12.5^ 1,上下游引物各0.5^ 1,探针0.25^ 1,基因组0嫩2 9 1,去离子水补加至总体积25111,反应程序为:温度951 308,温度951 58,温度57.400 308,40个循环,绘制标准曲线,然后以待测样品0嫩和标准品为模板做定量?⑶检测。 本专利技术所述的一种猪圆环病毒2型实时荧光定量?(? 1(^8-1^(112111探针检测方法,该方法是通过以下技术方案实现的: 特异性引物和探针的设计和合成: 参照收录的?(^2基因组全序列选择保守区,采用美国八81 ?1~111161~2x1)1-688 3.0实时突光定量?(?引物设计软件,设计合成了 1对I叫探针及其引物,探针的荧光标记选择…1作为报告发光基团,1⑶为淬灭基团,探针和引物由公司合成。其序列为:引物?(上游):5 ’ -0001^161^01^010010-3 ’和引物I?(下游):5’ '魈I探针:5’ -(?^00^X^000^60001X0X00(168)-3^ ; 阳性对照标准品的制备: 阳性对照标准品为实验室构建的含有?^201^2序列的克隆质粒 ?^20即2序列来源于,在保守序列区设计一对特异性引物,克隆载体?1018-1,制备一批质粒,测定浓度、纯度均合格的质粒进行定量,使最终浓度为1,温度-201保存,具体方法如下: 配制?⑶反应体系:2父?0?12.5 9 1,上下游引物各0.5 9 1,基因组0嫩2^ 1,去离子水补加至总体积25^ 1 ;?邙反应程序为:9500 5^111,95^ 308,58.6。。308,7212-11,721 10111111,35循环。回收并纯化?⑶产物,即为目的片段; 配制连接反应体系:快速连接混合液5 9 1,1)1018-1载体1 9 1,产物3 ^ 1,补加去离子水至总体积10^ 1,温度161孵育过夜; 转化并提取质粒模板:将连接产物转化至0册0感受态细胞中,涂板,选出阳性质粒克隆,测序,测定质粒浓度,使最终浓度为1,所提取的质粒即可作为后续试验的模板; 定量?邙检测: 将梯度稀释的标准质粒作为模板进行定量?(?检测,绘制标准曲线,然后以待测样品0嫩和标准品为模板做定量检测。 本专利技术所述的一种猪圆环病毒2型实时荧光定量?(? 1(^8-1^(112111探针检测方法,该方法简单、快速、灵敏度高、特异性强、重复性好。本专利技术设计的特异性引物和探针,使实时荧光定量检测的定量极限和检测极限极低,大大提高了实时荧光定量检测方法的灵敏度,可实现大通量样品的检测,可对动物及动物源性样品中的猪圆环病毒2型进行实时荧光定量?⑶检测。 【附图说明】 图1为本专利技术的标准曲线图,其中横坐标为质粒模板拷贝数的对数,纵坐标为循环阈值; 图2为本专利技术标准曲线的熔解曲线图,其中熔解曲线的峰值出现在一个位置,结果成立; 图3为本专利技术不同稀释度标准样品的反应曲线图; 图4为本专利技术特异性检测的反应曲线图:其中检测样品分别为猪伪狂犬病毒,猪瘟病毒,猪细小病毒,猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒,口蹄疫病毒,猪流感病毒所抽提的0嫩或⑶嫩为模板,结果显示除?^2之外其本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种猪圆环病毒2型实时荧光定量PCR MGB‑TaqMan探针检测方法,其特征在于,按下列步骤进行:a、设计与合成实时荧光定量PCR检测的引物对,其序列为:上游引物F:5’‑CCCTATGTAAACTACTCCTC‑3’和下游引物R:5’‑GGAAGTAATCAATAGTGGAATC‑3’;b、设计与合成实时荧光定量PCR检测的MGB‑TaqMan探针,其序列为:5’‑(FAM) ACCATAACCCAGCCCTTCTCC (MGB)‑3’;c、阳性对照标准品的制备:阳性对照标准品为实验室构建的含有PCV2ORF2序列的克隆质粒pMD18T‑PCV2,PCV2ORF2序列来源于GeneBank,在保守序列区设计一对特异性引物,克隆载体pMD18‑T,将制备的质粒进行定量,使最终浓度为1×1010copies/µl,温度‑20℃保存;配制PCR反应体系,按照PCR反应程序进行反应得到目的片段,所述PCR反应体系为:2×PCR Master Mix 12.5µl,上下游引物各0.5µl,基因组DNA2µl,去离子水补加至总体积25µl;PCR反应程序为:95℃ 5min,95℃ 30s,58.6℃30s,72℃2min,72℃ 10min,35循环;配制连接反应液,转化并提取质粒模板,所述连接反应液为快速连接混合液5µl,pMD18‑T载体1µl,PCR产物3µl,补加去离子水至总体积10µl;测定质粒浓度,使最终浓度为1×1010copies/µl;d、定量PCR检测:将梯度稀释的标准质粒作为模板进行定量PCR检测,配制定量PCR反应体系为:Premix EX Taq 12.5µl,上下游引物各0.5µl,探针0.25µl,基因组DNA2µl,去离子水补加至总体积25ul,反应程序为:温度95℃ 30s,温度95℃ 5s,温度57.4℃ 30s,40个循环,绘制标准曲线,然后以待测样品DNA和标准品为模板做定量PCR检测。...

【技术特征摘要】
1.一种猪圆环病毒2型实时荧光定量PCR MGB-TaqMan探针检测方法,其特征在于,按下列步骤进行: a、设计与合成实时荧光定量PCR检测的引物对,其序列为:上游引物F:5’ -CCCTATGTAAACTACTCCTC-3’ 和下游引物 R:5’ -GGAAGTAATCAATAGTGGAATC-3’ ; b、设计与合成实时荧光定量PCR检测的MGB-TaqMan探针,其序列为:5’-(FAM)ACCATAACCCAGCCCTTCTCC (MGB)-3’ ; C、阳性对照标准品的制备:阳性对照标准品为实验室构建的含有PCV20RF2序列的克隆质粒pMD18T-PCV2,PCV20RF2序列来源于GeneBank,在保守序列区设计一对特异性引物,克隆载体PMD18-T,将制备的质粒进行定量,使最终浓度为IX KTcopies/^l,温度_20°C保存; 配制PCR反应体系,按照PCR反应程序进行反应得到目的片段,所述PCR反应体系为:2 XPCR...

【专利技术属性】
技术研发人员:师小潇贺笋潘晓梅张伟李延涛
申请(专利权)人:新疆天康畜牧生物技术股份有限公司
类型:发明
国别省市:新疆;65

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