结肠直肠癌的预后方法和试剂盒技术

本发明专利技术涉及用于预测癌症患者复发风险的方法及基于不同基因的表达水平向所述患者提供个性化用药的方法，所述不同基因的表达是响应于TGF-β刺激而产生的。本发明专利技术还涉及用于实施诊断及预测医学方法的试剂盒。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】【专利摘要】本专利技术涉及用于预测癌症患者复发风险的方法及基于不同基因的表达水平向所述患者提供个性化用药的方法，所述不同基因的表达是响应于TGF-β刺激而产生的。本专利技术还涉及用于实施诊断及预测医学方法的试剂盒。【专利说明】结肠直肠癌的预后方法和试剂盒
本专利技术涉及诊断领域，并且更具体地，涉及预测癌症患者复发风险的方法及向所 述患者提供个性化用药的方法。本专利技术还涉及用于实施诊断及预测药物方法的试剂盒。
技术介绍
结肠直肠癌（CRC)是西方世界最常见的瘤形成之一，其是位于肺癌和前列腺癌之 后导致男性死亡的第三个原因，并且在女性中是位于乳腺癌之后第二常见的瘤形成。结肠 直肠癌是世界范围内男性中第三常见出63, 000病例，占总数的10. 0% )和女性中第二常见 (571，000病例，占总数的9. 4%)的癌症。据估计世界范围内有608, 000例由结肠直肠癌 导致的死亡，占全部癌症死亡的8%，使其成为第四常见的癌症死亡原因。（GL0B0CAN. iarc. fr) 结肠直肠癌的主要治疗选择是手术，根据个体患者的阶段及其他医学因素，伴随 或不伴随辅助性化疗和/或放疗。 无论对于病人来说还是出于经济原因，选择合适的治疗都很重要。对于患者存活， 知道何时立即使用强烈并具侵略性的治疗方法以防止恶性结肠直肠癌的扩散是很重要的。 否则，可能危及患者的生存。相反地，当不必要时进行强烈并具侵略性的治疗对于患者是极 其不利的。这种治疗使患者受到由不良毒性产生的一定程度的不适和不便从而可能严重影 响患者的生活质量。值得注意的是，每个患者有1/400的概率遭遇治疗导致致命的毒性。此 夕卜，强烈并具侵略性的治疗通常非常昂贵，因此其仅在必要时进行。 目前，治疗方案的选择基于肿瘤分期，通常使用美国癌症联合委员会（AJCC)的肿 瘤/节点/转移（TNM)测试进行选择。该了匪系统基于三个种类分配数字。"T"表示肠壁 的侵害程度，"N"表示淋巴结包含程度，"M"表示转移程度。癌症的更广泛阶段通常引用源 自通过预后分组的^^值的数字I、II、III、IV ;更大的数字表示更晚期的癌症及可能更坏 的结果。该系统的细节见下表1 : 【权利要求】1. 一种用于预测罹患结肠直肠癌患者的结果的方法，用于给罹患结肠直肠癌患者选 择合适的治疗或选择可能受益于结肠直肠癌手术切除后的辅助疗法的患者，所述方法包括 测定来自所述患者的样本中的NPR3/C5orf23、CDKN2B及FLT1基因的表达水平， 其中相对于所述基因的参照值，所述基因增加的表达水平表明患者消极结果的可能性 增加，即所述患者是接受手术治疗后的疗法的候选人或所述患者可能受益于手术治疗后的 疗法，或 其中相对于所述基因的参照值，所述基因降低的表达水平表明患者积极结果的可能性 增加，即所述患者不是接受手术治疗后的疗法的候选人或所述患者不大可能受益于手术治 疗后的疗法。2. 根据权利要求1所述的方法，还包括测定一种或多种选自由FRMD6、IGFBP3、ESM1、 FGF1、GEM、MEX3B、WNT2、NGF、MSC、SETBP1、FLJ10357、DACT、MURC 和 CollOAl 组成的组中的 基因的表达水平， 其中相对于所述基因的参照值，所述基因增加的表达水平表明患者消极结果的可能性 增加，即所述患者是接受手术治疗后的疗法的候选人或所述患者可能受益于手术治疗后的 疗法，或 其中相对于所述基因的参照值，所述基因降低的表达水平表明患者积极结果的可能性 增加，即所述患者不是接受手术治疗后的疗法的候选人或所述患者不大可能受益于手术治 疗后的疗法。3. 根据权利要求2所述的方法，其中测定了 CDKN2B、NPR3/C5orf23、FLT1、FRMD6、 IGFBP3和ESM1基因的表达水平，并且其中所述患者是罹患II期结肠直肠癌的患者。4. 根据权利要求2所述的方法，其中测定了 CDKN2B、NPR3/C5orf23、FLT1、FGF1、GEM 和MEX3B基因的表达水平，并且其中所述患者是罹患III期结肠直肠癌的患者。5. 根据权利要求2所述的方法，包括测定下列基因的表达水平：ANGPTL2、ANGPTL4、 APBB2、BMPR2、BPGM、C13orf33、C5orΠ 3、NPR/C5orf23、CACHD1、CALD1、CDH6、CDKN2B、ClLP、 CNTN1、C0L10A1、C0L12A1、C0L27A1、DACT1、DIXDC1、DNAJB5、DNAJC18、ELTD1、EPHA4、ESM1、 FAP、F⑶6、FGF1、FGF2、FLJ10357、FLT-1、FN1、FRMD4A、FRMD6、GAS1、GEM、GFPT2、GPR161、 HAS2、HEY1、HIC1、HS3ST3A1、IGFBP3、IGFBP7、IL11、INHBA、KAL1、KIAA1755、KLF7、LARP6、 LMCD1、LM04、L0C100128178、L0C644242、L0C728264、L0H3CR2A、LRRC8A、ME0X1、MEX3B、 MFAP2、MGC16121、MSC、MURC、NEDD9、NGF、N0X4、NPR2、NUAK1、OSGIN2、PALLD、PALM2、PDGFA、 PDGFC、PDLIM4、PDPN、PGM2L1、PKN0X2、PMEPA1、PODXL、PPM1E、PTHLH、RASD1、RASGRP3、 RASL12、RGS4、RNF150、RUNX1、S1PR5、SEMA6D、SERPINE1、SETBP1、SHISA2、SLC46A3、SNCAIP、 SN0RD114-3、S0X6、SPSB1、STK38L、SYNE1、SYTL4、TCF4、TGFB2、--ΜΡ3、TMEM88、TNC、TNS1、 TPM1、TSHZ3、TSPAN2、VEPH1、WNT2、WNT9A 和 ZEB1 基因，以及与具有 SEQ ID NO: 1 ?13 的序列 的探针特异性杂交的基因， 其中相对于所述基因的参照值，所述基因增加的表达水平表明患者消极结果的可能性 增加，即所述患者是接受手术治疗后的疗法的候选人或所述患者可能受益于手术治疗后的 疗法，或 其中相对于所述基因的参照值，所述基因降低的表达水平表明患者积极结果的可能性 增加，即所述患者不是接受手术治疗后的疗法的候选人或所述患者不大可能受益于手术治 疗后的疗法。6. 根据权利要求1-5中任一项所述的方法，其中额外的测定了患者的肿瘤阶段，并且 其中高肿瘤阶段是消极结果可能性增加的指标，即所述患者是接受手术治疗后的辅助 疗法的候选人或所述患者可能受益于手术治疗后的疗法， 其中低肿瘤阶段是积极结果可能性增加的指标，即所述患者不是接受手术治疗后的辅 助疗法的候选人或所述患者不大可能受益于手术治疗后的疗法。7. 根据权利要求1-6中任一项所述的方法，其中所述疗法选自由化疗、放疗和/或包 括TGF- β抑制剂的疗法组成的组。8. 根据权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述待预测的结果为复发或者转移的 发展。9. 根据权利要求8所述的方法，其中所述转移是肝转移。10. 根本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于预测罹患结肠直肠癌患者的结果的方法，用于给罹患结肠直肠癌患者选择合适的治疗或选择可能受益于结肠直肠癌手术切除后的辅助疗法的患者，所述方法包括测定来自所述患者的样本中的NPR3/C5orf23、CDKN2B及FLT1基因的表达水平，    其中相对于所述基因的参照值，所述基因增加的表达水平表明患者消极结果的可能性增加，即所述患者是接受手术治疗后的疗法的候选人或所述患者可能受益于手术治疗后的疗法，或其中相对于所述基因的参照值，所述基因降低的表达水平表明患者积极结果的可能性增加，即所述患者不是接受手术治疗后的疗法的候选人或所述患者不大可能受益于手术治疗后的疗法。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：爱德华·巴特列斯·戈麦斯，埃莱娜·桑乔·苏伊斯，大卫·罗塞尔·里韦拉，亚历山大·卡隆，埃莉萨·埃斯皮内特·埃尔南德斯，塞尔希奥·帕洛莫·庞塞，
申请(专利权)人：加泰罗尼亚调查和高级研究机构，生物医药研究基金会机构IRB巴塞罗那，
类型：发明
国别省市：西班牙;ES