用于图像数据处理的方法和系统技术方案

技术编号:10267467 阅读:106 留言:0更新日期:2014-07-30 16:28
计算机实现的方法、存储介质和系统的实施例可被配置成确定微粒在第一微粒图像中的位置。微粒可具有与之关联的荧光材料。这些实施例可包括计算变换参数,并且变换参数可定义微粒位置在第一微粒图像和第二微粒图像之间的估计移动。实施例可进一步包括将该变换参数施加至微粒在第一图像中的位置以确定微粒在第二图像中的移动位置。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】【专利摘要】计算机实现的方法、存储介质和系统的实施例可被配置成确定微粒在第一微粒图像中的位置。微粒可具有与之关联的荧光材料。这些实施例可包括计算变换参数,并且变换参数可定义微粒位置在第一微粒图像和第二微粒图像之间的估计移动。实施例可进一步包括将该变换参数施加至微粒在第一图像中的位置以确定微粒在第二图像中的移动位置。【专利说明】用于图像数据处理的方法和系统 专利技术背景 优先权要求本申请要求2011 年 10 月 18 日提交的题为 “Methods and Systems for ImageData Processing(用于图像数据处理的方法和系统)”的美国临时专利申请61/627,851的优先权。
本专利技术总地涉及用于图像数据处理的方法和系统。某些实施例涉及用于执行处理微粒的多个图像的一个或多个步骤以说明图像间的微粒移动的方法和系统。 关联技术的描述以下的描述和示例不因为包括在本节中而被认为是现有技术。使用诸如电荷耦合器件(CCD)检测器的检测器的成像在生物技术应用中被应用于若干种当前可用的仪器。这些应用可能需要对微粒进行多次成像。在这些微粒的多个图像中,微粒可能表现为移动。在时间上靠在一起拍摄的微粒图像(或在同一时间拍摄的)中,微粒可能表现出平移或移动。因此,需要研发出用于微粒图像的数据处理以说明微粒在图像之间的移动的方法和系统。
技术实现思路
前面列出的问题可大部分地通过用于执行与微粒的数据图像处理关联的一个或多个步骤的计算机实现方法、存储介质和系统来解决。下面给出的仅仅是无论如何不被解释成对权利要求书的主题构成限制的计算机实现方法、存储介质和系统的示例性实施例。计算机实现方法、存储介质和系统的实施例可被配置成:确定微粒在第一微粒图像中的位置,其中微粒具有与之关联的荧光材料;计算变换参数,其中该变换参数定义在第一微粒图像和第二微粒图像之间微粒位置的估计移动;以及将变换参数作用至微粒在第一图像中的位置以确定微粒在第二图像中的移动位置。在这些方法、存储介质和系统的一些实施例中,变换参数包括径向分量和恒定分量。径向分量可与微粒在第一图像中的位置和第一图像的中心之间的距离成正比。在这些方法、存储介质和系统的一些实施例中,计算变换参数可包括估计微粒在第二图像中的估计位置并基于微粒在第一图像中的位置和微粒在第二图像中的估计位置来计算潜在的变换参数。在一些实施例中,计算变换参数可进一步包括基于潜在的变换参数确定最佳变换参数。在这些方法、存储介质和系统的一些实施例中,估计微粒在第二图像中的估计位置可包括基于第二图像以及微粒在第一图像中的位置确定最大积分位置。另外,在一些实施例中,确定最佳变换参数包括使用霍夫(Hough)变换。在这些方法、存储介质和系统的一些实施例中,可进一步包括基于微粒之间的力来计算误差分量。术语“一”和“一个”被定义为一个或多个,除非本公开中另有明确要求。术语“基本上”及其变化形式被定义为很大程度但不一定全部地,它被规定为由本领域内技术人员理解的那样,并且在一个非限定性实施例中,“基本上”指在规定内容的10 %之内的范围,优选地在5 %之内,更优选地在I %之内,并且最优选地在0.5 %之内。术语“包容”(以及任何形式的包容,例如“包涵”和“由……构成”)、“具有”(以及任何形式的具有,例如“具备”和“有包括”(以及任何形式的包括,例如“包含”和“涵盖”)以及包含(以及任何形式的包含,例如“含有”和“含”)是开放式的动词。结果,“包容”、“具有”、“包括”或“包含”一个或多个步骤或要素的方法或设备拥有这些一个或多个步骤或要素,但不限于仅拥有这些一个或多个要素。同样,“包容”、“具有”、“包括”或“包含”一个或多个特征的方法步骤或设备要素拥有这些一个或多个特征,但不限于仅拥有这些一个或多个特征。此外,以某种方式配置的设备或结构至少以这种方式配置,但也可以未列出的方式配置。其它特征和关联的优势通过结合附图参照下面对具体实施例的详细描述而变得明显。 附图简述下面的附图构成本说明书的一部分并被包括以进一步阐述本专利技术的某些方面。本专利技术可通过结合对本文给出的具体实施例的详细描述参照这些附图中的一张或多张附图而得到更好的理解。图1是示出被配置成获取或处理微粒图像的系统的一个实施例的横截面图的示意图; 图2是列出处理微粒图像的方法的流程图;图3示出在第一微粒图像和第二微粒图像之间的潜在栅格变形;图4示出微粒的自由体图;图5示出确定最大积分位置的具体实施例;图6示出用于确定最佳变换参数的投票空间;以及图7示出微粒的另一自由体图;【具体实施方式】尽管本文已针对微粒对诸实施例进行了描述,然而要理解本文描述的系统和方法也可与微球体、聚苯乙烯珠、微观微粒、金纳米微粒、量子点、纳米点、纳米微粒、纳米壳、小珠、微珠、乳胶颗粒、乳胶珠、荧光珠、荧光微粒、染色微粒、染色珠、组织、细胞、微观有机物、有机物质、无机物质或业内已知的任何其它离散物质一起使用。这些微粒可用作分子反应的载体。合适的微粒的例子在Fulton的美国专利5,736,330,Chandler等人的5,981,180、Fulton 的 6,057, 107、Chandler 等人的 6,268,222、Chandler 等人的 6,449,562、Chandler等人的6,514,295,Chandler等人的6,524,793以及Chandler的6,528,165中被示出和描述,这些文献被全篇地援引包含于此。本文描述的系统和方法可与这些专利描述的任何微粒一起使用。另外,用于本文描述的方法和系统实施例的微粒可从例如德克萨斯州奥斯汀的Luminex公司的制造商那里获得。术语“微粒”和“微球体”和“珠”在本文中可互换地使用。另外,可与本文描述的系统和方法兼容的微粒类型包括具有附于或关联于微粒表面的荧光材料的微粒。这些类型的微粒——其中荧光染料或荧光微粒被直接耦合至微粒表面以提供分类荧光(即测量荧光发射并将其用来确定微粒或微粒所属子集的身份)——在Chandler等人的美国专利6,268,222和Chandler等人的6,649,414中示出和描述,这些文献被全篇地援引包含于此。可在本文描述的方法和系统中使用的微粒类型也包括具有纳入到微粒芯内的一种或多种荧光色素或荧光染料的微粒。可用于本文描述的方法和系统的微粒进一步包括本身一旦暴露于一种或多种合适的光源即表现出一种或多种荧光信号的微粒。此外,可制造微粒,由此一旦激励,这些微粒表现出多个荧光信号,其每一个信号可单独或结合地使用以确定微粒的身份。如下文描述的,图像数据处理可包括微粒的分类(尤其是对多分析物流体)以及束缚于微粒的分析物的量的确定。由于表征束缚于微粒的分析物的量的报告信号在操作期间一般是未知的,因此可结合本文描述的系统使用特别染色的微粒,这种特别染色的微粒不仅发出分类波长或波带下的荧光也发出报告波长或波带下的荧光。本文描述的方法一般包括分析微粒图像并处理从该图像测得的数据以确定微粒在图像中的位置。接下去对微粒的一个或多个特征的处理可根据Fulton的美国专利5,736, 330、Chandler 等人的 5,981, 180、Chandler 等人的 6,449, 562、Chan本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种计算机实现的方法,包括:确定微粒在第一微粒图像中的位置,其中所述微粒具有与之关联的荧光材料;计算变换参数,其中所述变换参数定义微粒位置在第一微粒图像和第二微粒图像之间的估计的平移;将所述变换参数施加至微粒在第一图像中的位置以确定微粒在第二图像中的移动位置。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:M·费希尔
申请(专利权)人:卢米尼克斯股份有限公司
类型:发明
国别省市:美国;US

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