一种模拟系统执行微观模拟，以对多个参与者的一个或多个早期癌症检测筛查的影响进行建模，以模拟随机对照试验(RCT)。在一个实例中，使用并行处理技术来执行微观模拟。微观模拟模拟早期检测筛查对参与者的个体轨迹的影响。特别地，虽然大多数筛查形态...

本申请涉及分析核酸片段的方法。本文提供了用于富集生物样品中的靶核酸并分析所述核酸的方法。在一些情况下，富集生物样品中与癌症或肿瘤相关的靶核酸。在一些情况下，富集生物样品中的靶核酸，并且所述靶核酸的长度不同。在一些情况下，使用一种或多种探...

本文公开了利用核酸样本定位疾病状态

提供了用于扩增核酸，包括无细胞核酸片段，以准备进行测序的组合物和方法。提供了制备具有[T]

公开了用于确认DNA样品来自测试受试者的系统和方法。测试受试者报告可以从DNA样品预测的一个或多个特征(生物学性别、种族和/或年龄)。将预测与所报告的特征进行比较以确认DNA样品。为了根据生物学性别进行确认，系统基于针对Y染色体具有特异...

检测用于确定受试者癌症的测试样本之间的交叉污染是有益的。为了检测交叉污染，使用基因组测序技术制备包括至少一个单核苷酸多态性的测试序列。可以对一些测试序列进行过滤以提高准确度和精确度。基于次要等位基因频率来确定每个测试序列的先验污染概率。...

提供了一种使用等位基因位置处的先验基因型概率的调用等位基因位置变体方法。使用链取向和映射至等位基因位置的每个相应核酸片段序列中等位基因位置处的相应碱基的同一性，获得等位基因位置的正向和反向上的链特异性碱基计数集合，其中等位基因位置处的碱...

公开了用于检测癌症和/或确定癌症起源组织的方法和系统。在一些实施例中，公开了一种多类癌症分类器，其用包含cfDNA片段的多个生物样本进行训练。分析系统得到每个样本的特征向量，并且多类分类器预测多个起源组织(TOO)类别中的每个起源组织的...

用于处理核酸数据集的噪声模型可以将已处理的序列读数分层到不同的读数层。每个读数层可以是基于潜在的变体位置是否在所述序列读数的重叠区域和/或互补区域来定义的。处理系统可以针对每个读数层确定在所述变体位置处的分层测序深度。所述处理系统可以针...