A haplotype AAG/GGC derived from the CCKBR gene and its application. The invention discloses a pair of genes related to the susceptibility to adult glioma, primary hepatocellular carcinoma and non-small cell lung cancer, and the gene haplotype AAG and GGC (rs2929183 rs2941023 rs2947025), which are derived from the gene CCKBR mutation. The genotypes of three SNP loci rs2929183, rs2941023 and rs2947025 were specifically detected by the design of PCR amplification primers and fluorescence probes, and the genotype and haplotype and adult glioma, primary hepatocellular carcinoma and non small cell lung were calculated by using linkage disequilibrium software for genotype analysis and genetic mapping. The relationship between cancer susceptibility and susceptibility to these three tumors is assessed. The sequence of PCR amplification primers and fluorescent probes is in turn as shown in SEQ ID NO:4 ~ 15. The primer group and detection method of the invention are simple, fast, high throughput, Gao Min sense and strong specificity, and are suitable for large-scale screening of adult neuroglioma, primary hepatocellular carcinoma and non small cell lung cancer susceptible population, which is beneficial to guidance. The prevention of relative tumor has great application prospects.
【技术实现步骤摘要】
一种源于CCKBR基因的单体型AAG/GGC及其应用
本专利技术属于生物
更具体地,涉及一对与成人神经胶质瘤、原发性肝细胞癌和非小细胞肺癌易感性相关的基因单体型AAG/GGC及其应用。
技术介绍
神经胶质瘤(gliomas)亦称胶质细胞瘤,简称胶质瘤,是发生于神经外胚层的肿瘤,故亦称神经外胚层肿瘤或神经上皮肿瘤。神经胶质瘤在颅内各种肿瘤中最为多见(约占50%);在儿童恶性肿瘤中排第二位。近30年来,原发性恶性脑肿瘤发生率逐年递增,年增长率约为1.2%,中老年人群尤为明显。据文献报道,中国脑胶质瘤年发病率为3~6人/10万人,年死亡人数达3万人。在神经胶质瘤中以星形细胞瘤为最常见,其次为多形性胶质母细胞瘤,室管膜瘤占第三位。性别以男性多见,特别在多形性胶质母细胞瘤、髓母细胞瘤中,男性明显多于女性。年龄大多见于20~50岁间,以30~40岁为最高峰,另外在10岁左右儿童亦较多见,为另一个小高峰。作为中枢神经系统最常见的恶性肿瘤,具有恶性程度高和侵袭性强的特点。现有资料表明,保守治疗的胶质瘤患者,平均生存期为14周;单纯外科手术能将这一时间延长到20周;手术和放疗结合可达36周;手术、放疗、化疗综合治疗也仅达40周,预后仍然很差。原发性肝细胞癌起源于肝脏的上皮组织,是我国高发的、危害极大的恶性肿瘤。原发性肝癌的病因及确切分子机制尚不完全清楚,目前认为其发病是多因素、多步骤的复杂过程,受环境和因此双重因素影响。最新国际流行病学的调查显示,目前每年的肝癌发病率全世界是74.83万,大约55%都在中国。90%左右的中国肝癌患者是肝细胞肝癌,它的主要发病相关因素 ...
【技术保护点】
起源于CCKBR基因的SNP位点rs2929183,rs2941023和rs2947025,或rs2929183‑rs2941023‑rs2947025位点所构成的基因连锁不平衡单体型AAG和单体型GGC,其特征在于,所述单体型在rs2929183、rs2941023和rs2947025位点的单核苷酸分别为A、A、G或G、G、C。
【技术特征摘要】
1.起源于CCKBR基因的SNP位点rs2929183,rs2941023和rs2947025,或rs2929183-rs2941023-rs2947025位点所构成的基因连锁不平衡单体型AAG和单体型GGC,其特征在于,所述单体型在rs2929183、rs2941023和rs2947025位点的单核苷酸分别为A、A、G或G、G、C。2.权利要求1所述的SNP位点rs2929183,rs2941023和rs2947025,或单体型AAG和GGC在作为神经胶质瘤、原发性肝细胞癌和非小细胞肺癌易感性评估的标志物和/或在制备神经胶质瘤、原发性肝细胞癌和非小细胞肺癌易感性检测试剂盒中的应用。3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述应用为通过SNP基因分型技术测定个体样本rs2929183、rs2941023和rs2947025位点的基因型,并遗传作图,当此三位点的单体型为AAG,则该个体不是神经胶质瘤、原发性肝细胞癌和非小细胞肺癌的易感群体,当此三位点的单体型为GGC,则该个体可能为神经胶质瘤、原发性肝细胞癌和非小细胞肺癌的易感人群。4.一种检测rs2929183、rs2941023和rs2947025位点基因型的引物组,其特征在于,每个位点的检测引物组均包括一对PCR扩增引物及两条荧光探针,其序列依次如SEQI...
【专利技术属性】
技术研发人员:朱萧,罗辉,陈志红,罗海清,
申请(专利权)人:广东医科大学,
类型:发明
国别省市:广东,44
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