草莓属植物的炭疽病抵抗性相关标志物及其利用制造技术

对于草莓属植物开发多种DNA标志物，通过使用这些多种DNA标志物来高精度地判定炭疽病抵抗性。草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物，包含草莓属植物的染色体中的由序列号1所示的碱基序列和序列号10所示的碱基序列所夹的连续的核酸区域。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及能够筛选对草莓炭疽病显示抵抗性的草莓属植物系统的炭疽病抵抗性相关标志物及其利用方法。
技术介绍
通过开发DNA标志物(也称为遗传标志物、基因标志物)，能够在植物的品种改良中迅速且有效地辨别有用性状、不良性状的有无。DNA标志物的开发不仅在拟南芥、稻等模型植物、而且在各种各样的实用植物中进展，对于品种改良发挥了巨大作用。非专利文献1中有在栽培草莓中开发综合型高密度连锁图谱的报告。根据非专利文献1，虽然以前有包含约300个扩增片段长度多态性(amplifiedfragmentlengthpolymorphism，AFLP)标志物的连锁图谱的报告，但由于具有8倍体和复杂的基因组，因而对于栽培草莓要求开发更高密度的连锁图谱。另外，在非专利文献1中，对于野草莓(F.vessca)和草莓(F.×ananassa)开发了简单重复序列(simplesequencerepeat)标志物，构建了综合型高密度连锁图谱。具体地，使用02-19、Sachinoka(幸香)、Kaorino、Akihime(章姬)和0212921的5个品种·系统制作连锁图谱，将他们综合起来制成1个综合型高密度连锁图谱。在非专利文献1中，对于02-19开发了575个标志物、对于Sachinoka(幸香)开发了556个标志物，对于Kaorino开发了294个标志物，对于Akihime(章姬)开发了318个标志物，以及对于0212921开发了822个标志物。但是，在非专利文献1所公开的综合型高密度连锁图谱中，存在无座上的标志物数的连锁群，特别是在标志物数少的Kaorino、Akihime(章姬)中该倾向显著。进而，考察到非专利文献1所公开的综合型高密度连锁图谱并未覆盖全部的连锁图谱。另外，非专利文献2中记载为了有效地开发草莓炭疽病抵抗性品种，开发了与草莓炭疽耐病性连锁的DNA标志物。非专利文献2中通过随机扩增多态性DNA法(RandomAmplifiedPolymorphicDNA法，RAPD法)、AFLP法和SSR法使用标志物制作连锁图谱，分析耐病性连锁标志物。其结果根据非专利文献2，通过在将草莓中间母本农2号杂交而得的集团中利用，能够将育种集团减少到1/8，能够开发能以约70％的概率辨别耐病性系统的标志物。此外，关于草莓炭疽病，如非专利文献3所记载的那样，已知苹果炭疽病菌(Glomerellacingulate)和辣椒炭疽病菌(Colletotrichumacutatum)是其病原菌。另一方面，例如，专利文献1中公开开发了甜菜黑根病抵抗性品种筛选标志物，专利文献2中对于玉米公开了利用与目的性状连锁的标志物的筛选技术。现有技术文献非专利文献非专利文献1：DNAResearch20,79-92,(2013)非专利文献2：枥木县农业试验场研究成果集第29号，第51～52页非专利文献3：Microbiol.Cult.Coll.,25(1):27-32,2009专利文献专利文献1：WO2007/125958专利文献2：日本特开2010-516236号公报
技术实现思路
专利技术所要解决的课题但是，现状是上述的在甜菜、玉米中开发出的DNA标志物技术在草莓属植物中几乎没有进行。非专利文献1虽然记载了开发了SSR标志物、构建了综合型高密度连锁图谱，但是对于在多倍体且复杂的基因组结构的草莓属植物中筛选与目的性状连锁的DNA标志物来说不能说是充分的。另外，非专利文献2中虽然记载开发了与草莓炭疽病耐病性连锁的DNA标志物，但作为QTL分析的结果不能说LOD(优势对数，logarithymofodds)值、贡献率高，不能评价为优异的标志物。于是，本专利技术鉴于上述事实，目的在于对于多倍体且复杂的基因组结构的草莓属植物开发多种DNA标志物，提供通过使用这些多种DNA标志物而能够高精度地判定炭疽病抵抗性的炭疽病抵抗性相关标志物及其利用方法。用于解决课题的技术方案本专利技术者们为了解决上述课题而反复进行了深入研究，结果通过准备草莓属植物中的多种标志物，通过杂交后代系统中的量的性状与标志物的连锁分析，发现了与炭疽病抵抗性这样的量的性状连锁的标志物，从而完成了本专利技术。本专利技术包含以下(1)～(7)。(1)草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物，包含草莓属植物的染色体中的由序列号1所示的碱基序列和序列号10所示的碱基序列所夹的连续的核酸区域。(2)根据(1)所述的草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物，其特征在于，所述核酸区域包含选自由序列号1～10组成的群组中的任一碱基序列或该碱基序列的一部分。(3)根据(1)所述的草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物，其特征在于，所述核酸区域位于草莓属植物的染色体中的由序列号4所示的碱基序列和序列号8所示的碱基序列所夹入的区域。(4)炭疽病抵抗性提高了的草莓属植物系统的制造方法，包括以下工序，提取工序：提取至少一方亲本是草莓属植物的后代植物的染色体和/或该亲本草莓属植物的染色体，和测定工序：测定上述(1)～(3)的任一项所述的草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物在上述所得的染色体中存在还是不存在。(5)根据(4)所述的草莓属植物系统的制造方法，其特征在于，在所述测定工序中，使用特异性地扩增所述草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物的引物，通过核酸扩增反应，来测定该草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物存在还是不存在。(6)根据(4)所述的草莓属植物系统的制造方法，其特征在于，在所述测定工序中，使用具备与所述草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物对应的探针的DNA芯片。(7)根据(4)所述的草莓属植物系统的制造方法，其特征在于，所述后代植物是种子或幼苗，由该种子或幼苗提取染色体。本说明书包含作为本申请的优先权基础的日本专利申请2013-186688号、2014-165405号的说明书和/或附图所记载的内容。专利技术的效果根据本专利技术，能够提供在草莓属植物中的量的性状中与炭疽病抵抗性连锁的新的草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物。通过利用本专利技术所涉及的草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物，能够检验草莓属植物的杂交系统中的炭疽病抵抗性。由此，能够以非常低的成本识别具有炭疽病抵抗性提高了的特性的草莓属植物系统。附图说明图1是显示获得草莓属植物染色体的标志物时使用的DNA微阵列的制造流程的模式图。图本文档来自技高网...

【技术保护点】
草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物，包含草莓属植物的染色体中的由序列号1所示的碱基序列和序列号10所示的碱基序列所夹的连续的核酸区域。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2013.09.09 JP 2013-186688;2014.08.15 JP 2014-165401.草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物，包含草莓属植物的染色体中
的由序列号1所示的碱基序列和序列号10所示的碱基序列所夹的连续的核
酸区域。
2.根据权利要求1所述的草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物，其特
征在于，所述核酸区域包含选自由序列号1～10组成的群组中的任一碱基
序列或该碱基序列的一部分。
3.根据权利要求1所述的草莓属植物炭疽病抵抗性相关标志物，其特
征在于，所述核酸区域位于草莓属植物的染色体中的由序列号4所示的碱
基序列和序列号8所示的碱基序列所夹入的区域。
4.炭疽病抵抗性提高了的草莓属植物系统的制造方法，包括以下工序，...

【专利技术属性】
技术研发人员：榎宏征，西村哲，水藤百江，布目司，野口裕司，
申请(专利权)人：丰田自动车株式会社，
类型：发明
国别省市：日本;JP