确定患者是否倾向于患有重度牙周病和/或具有高风险的牙周病进展的改进方法和试剂盒，其包含以下步骤：(i)从所述患者采集生物样本；(ii)针对包含IL1B(rs16944)、IL1B(rs1143623)和IL1B(rs4848306)的遗传多态性模式将所述生物样本基因分型；和(iii)将所述遗传多态性模式与参照的复合基因型模式相比较；其中所述的遗传多态性模式与所述的参照模式的相似性显示所述患者患有重度牙周病和/或具有高风险的牙周病进展的倾向。
Improved methods and kits for determining the severity and progression of periodontal disease
To determine whether the patient suffers from severe tend to improved method and kit for periodontal disease and / or high risk of periodontal disease progression, which comprises the following steps: (I) from the biological samples were collected; (II) in IL1B (rs16944), IL1B (rs1143623) and IL1B (rs4848306). Genetic polymorphism patterns of the biological sample genotype; and (III) the genetic polymorphism patterns compared with the composite genotype reference model; the reference model of the genetic polymorphism pattern and the similarity to display the tendency of patients suffering from severe periodontal disease and / or with a high risk of periodontal disease progression.
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于确定牙周病的严重性和进展的改进方法和试剂盒相关申请本专利申请要求自美国临时专利申请号61/452,157(在2011年3月13日提交)和61/421,628(在2010年12月9日提交)的优先权，其中每个均通过引用其整体而结合于本文中。专利
本专利技术总体上涉及用于确定患者的重度牙周病风险和/或牙周病进展的风险的改进方法和在所述改进方法中使用的试剂盒。专利技术背景齿龈炎为牙周病的早期阶段，其中齿龈可变成红色、肿胀并容易出血。齿龈炎通常为不痛的，如果不治疗，可发展为牙周炎，其可根据组织破坏的强度分为轻度、中度或重度。牙周炎主要为成年人疾病，通常直到35岁以后才可发觉。通常存在于牙菌斑中的细菌引起牙周病。由菌斑中的细菌产生的毒素激活人体的发炎机制和其他免疫机制，其最终导致支持牙齿的骨和齿龈组织的破坏。随着疾病进展，齿龈从牙齿脱离并且形成牙周袋，其为细菌提供了保护环境，因此导致持续循环。然而，一些位点并不持续是活性的。美国专利号5,328,829公开了通过测定位点上的白介素IL-1.β.来确定口腔内活性的牙周病位点的方法。吸烟与牙周炎患病率和严重性增加相关联。然而，非常大量的患有牙周炎的个体从未吸烟。在过去15年中，已证明影响儿童和青少年的某些形式的牙周炎是遗传决定的。这些在人群中具有特别低的发病率的疾病，在青春期年龄之前的某些个体和在青春期和18岁之间的其他个体中产生重度牙周炎。在那些病例中确定的遗传因素涉及非常明显的生物学机制，其很可能使个体倾向于产生多种健康问题。迄今，还没有成功地在成人形式的牙周炎中发现同型的遗传因素。已可对与1-2种基因有关或由其引起的疾病进行疾病预测的遗传检测(参见美国专利号4,582,788和5,110,920)，一旦鉴定出基因，可确定携带给定基因的人的患疾病风险(参见例如美国专利号4,801,531、4,666,828和5,268,267)。已开发了遗传检测试剂盒来预测牙周病的风险，其使用人类基因组中的两处变异，一处位于IL1A基因(IL1A+4845)，另一处位于IL1B基因(IL1B+3954)。具有这些基因变异的每个中的至少一个拷贝的次要等位基因(minorallele)的携带者具有增加的对牙周病的易感性。参见美国专利号5,686,246。然而，这样的检测在某些人种群体中的应用有限，并且在那些群体中该检测只能鉴定出小部分具有牙周病风险的人。有必要找到在所有人种群体中确定牙周病风险的更灵敏的方法。专利技术简述本专利技术涉及确定患者是否倾向于患有重度牙周病和/或具有高风险的牙周病进展的方法，其包括以下步骤：(i)从所述患者采集生物样本；(ii)针对包括IL1B(rs16944)、IL1B(rs1143623)和IL1B(rs4848306)的遗传多态性模式对所述生物样本进行基因分型；和(iii)将所述遗传多态性模式与参照的复合基因型模式(compositegenotypepattern)相比较；其中所述的遗传多态性模式与所述的参照模式的相似性显示所述患者患重度牙周病和/或具有高风险的牙周病进展的倾向。本专利技术还涉及用于确定患者是否倾向于患重度牙周病和/或具有高风险的牙周病进展的检测试剂盒，其包含：(i)生物样本采集工具；(ii)确定遗传多态性模式的工具；和(iii)含有IL1B(rs16944)、IL1B(rs1143623)、IL1B(rs4848306)和IL1B(rs1143633)对照样本。本文引用的专利和出版物的内容和在这些专利和出版物中引用的文献的内容通过引用其许可的范围而结合于本文中。详述本专利技术涉及IL-1B基因中多态性的发现，其与牙周病的易感性有关联。因此，该多态性的基因型的确认为牙周病的易感性提供了有用的遗传学检测。如本文所用，“亚洲人”指其祖籍为亚洲国家之一的人，包括但不限于中国、印度、日本，与他们当前的居住地无关。“非洲人”指其祖籍为非洲国家之一的人，与他们当前的居住地无关。除非另外说明，涉及DNA技术的反应和操作按Sambrook等,1989,分子克隆：实验室手册(MolecularCloning:ALaboratoryManual),ColdSpringHarborLaboratoryPress中所述进行，其通过引用结合于本文。除非另外说明，还可使用如美国专利号4,666,828、4,801,531和5,272,057以及McDowell等,1995中所述的方法学。通过Taqman™测定或使用连续单碱基延伸的PCR进行基因分型。本文提供确定患者是否倾向于患重度牙周病和/或具有高风险的牙周病进展的方法，其包含以下步骤：(i)从所述患者采集生物样本；(ii)针对包含IL1B(rs16944)、IL1B(rs1143623)和IL1B(rs4848306)的遗传多态性模式对所述生物样本进行基因分型；和(iii)将所述遗传多态性模式与参照的复合基因型模式相比较；其中所述的遗传多态性模式与所述的参照模式的相似性显示所述患者患重度牙周病和/或具有高风险的牙周病进展的倾向。本文还提供确定患者是否倾向于患重度牙周病和/或具有高风险的牙周病进展的方法，其包含以下步骤：(i)从所述患者采集生物样本；(ii)针对包含IL1B(rs16944)、IL1B(rs1143623)和IL1B(rs4848306)的遗传多态性模式对所述生物样本进行基因分型，其中表4-6中所列的遗传多态性模式之一的存在显示所述患者患重度牙周病和/或具有高风险的牙周病进展的倾向。在一个优选的实施方案中，遗传多态性模式选自(B1B1和IL1B3877=1.1)、B2B3、B2B4、B3B3、B3B4、B4B4、(B1B4和IL1B3877=1.1)、(B2B4和IL1B3877=1.1)、(B3B4和IL1B3877=1.1)、(B4B4和IL1B3877=1.1)、(B2B3和IL1B3877=1.1)、(B3B3和IL1B3877=1.1)、B1B1、B1B4、(B2B4和IL1B3877=2.*)、(B4B4和IL1B3877=2.*)、(B3B4和IL1B3877=2.*)、(IL1B3737=1.1和IL1B3877=1.1)、B2B2、B1B3、(B1B3和3877=1.1)、(B2B2和3877=1.1)和IL1B3877=1.1。在一个优选的实施方案中，高加索人群中的遗传多态性模式选自(B1B1和IL1B3877=1.1)、B2B3、B2B4、B3B3、B3B4、B4B4、(B1B4和IL1B3877=1.1)、(B2B4和IL1B3877=1.1)、(B3B4和IL1B3877=1.1)、(B4B4和IL1B3877=1.1)、(B2B3和IL1B3877=1.1)、(B3B3和IL1B3877=1.1)、B1B1、B1B4、(B2B4和IL1B3877=2.*)、(B4B4和IL1B3877=2.*)、(B3B4和IL1B3877=2.*)和(IL1B3737=1.1和IL1B3877=1.1)。在另一优选的实施方案中，非洲人群中的遗传多态性模式选自(B1B1和IL1B3877=1.1)、B2B3、B2B4、B3B3、B3B4、B4B4、(B1B4和IL1B3877=1.1)、本文档来自技高网...
【技术保护点】
确定患者是否倾向于患重度牙周病和/或具有高风险的牙周病进展的方法，所述方法包括以下步骤：(i)?从所述患者采集生物学样本；(ii)?针对包含IL?1B?(rs16944)、IL?1B?(rs1143623)和IL?1B?(rs4848306)的遗传多态性模式对所述生物学样本进行基因分型；(iii)?将所述遗传多态性模式与参照复合基因型模式相比较，其中所述遗传多态性模式与所述参照模式的类似性显示所述患者患重度牙周病和/或具有高风险的牙周病进展的倾向。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2010.12.09 US 61/421628;2011.03.13 US 61/4521571.引物在制备用于确定患者是否倾向于患重度牙周病和/或具有高风险的牙周病进展的试剂盒中的用途，所述确定包括以下步骤：(i)从所述患者采集生物学样本；(ii)从所述生物学样本分离核酸样本；(iii)使所述核酸样品与引物接触，所述引物与包含单核苷酸多态性(SNP)IL1B(rs16944;C/T)、IL1B(rs1143623;G/C)、IL1B(rs4848306;C/T)和IL1B(rs1143633;G/A)的IL1B基因座单倍型的等位基因特异性杂交；(iv)检测每一个所述SNPIL1B(rs16944;C/T)、IL1B(rs1143623;G/C)、IL1B(rs4848306;C/T)和IL1B(rs1143633;G/A)的等位基因1和等位基因2的拷贝数，(v)基于步骤(i...
【专利技术属性】
技术研发人员：KS科恩曼，X吴，HY王，J罗古斯，
申请(专利权)人：白细胞介素遗传学公司，
类型：
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。