基于PTO切割以及延伸-依赖性切割的靶核酸序列的检测制造技术

技术编号:9600827 阅读:161 留言:0更新日期:2014-01-23 05:22
本发明专利技术涉及基于PTO切割以及延伸-依赖性切割(PTO?Cleavage?and?Extension-Dependent?Cleavage:PCEC)试验的靶核酸序列的检测。本发明专利技术的特征在于,在随着靶核酸序列的存在与否而形成的延伸二聚物上,生成被核酸切割酶切割的切割位点。本发明专利技术检测延伸二聚物是否发生切割,由此决定靶核酸序列存在与否。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

【技术保护点】
一种基于PCEC(PTO切割及延伸?依赖性切割)试验来从DNA或者核酸混合物中检测靶核酸序列的方法,其特征在于,包括:步骤(a),将上述靶核酸序列与上游寡核苷酸以及PTO进行杂交;上述上游寡核苷酸包含与上述靶核酸序列互补的杂交核苷酸序列;上述PTO包含:(i)3’?靶向部位,其包含与上述靶核酸序列互补的杂交核苷酸序列;以及(ii)5’?标记部位,其包含与上述靶核酸序列非?互补的核苷酸序列;上述3’?靶向部位与上述靶核酸序列杂交,上述5’?标记部位不与上述靶核酸序列杂交;上述上游寡核苷酸位于上述PTO的上游;步骤(b),在用于切割上述PTO的条件下,将上述步骤(a)的结果物与具有5’核酸酶活性的酶相接触;上述上游寡核苷酸或者其延伸链诱导基于具有上述5’核酸酶活性的酶的上述PTO的切割,这种上述切割放出包含上述PTO的5’?标记部位或者5’?标记部位的一部分的片段;步骤(c),将从上述PTO放出的上述片段与CTO进行杂交;上述CTO沿着3’→5’方向包含:(i)捕捉部位,其包含与上述PTO的5’?标记部位或者5’?标记部位的一部分互补的核苷酸序列,以及(ii)模板化部位,其包含与上述PTO的5’?标记部位以及3’?靶向部位非?互补的核苷酸序列;从上述PTO放出的上述片段与上述CTO的捕捉部位杂交;步骤(d),利用步骤(c)的结果物以及模板?依赖性核酸聚合酶来实施延伸反应;杂交于上述CTO的捕捉部位的上述片段,通过被延伸来形成延伸二聚物,并生成被核酸切割酶切割的切割位点;步骤(e),利用上述核酸切割酶来切割上述延伸二聚物,用于生成切割的片段;以及步骤(f),检测上述延伸二聚物是否发生切割,上述延伸二聚物发生切割表示上述靶核酸序列存在。...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员:千钟润李劳祚
申请(专利权)人:SEEGENE株式会社
类型:
国别省市:

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