The invention discloses a kit for the detection of hepatitis C virus genotype, characterized in that it comprises: (1) RNA extraction reagent, reverse transcriptase kit, real-time fluorescence quantitative PCR amplification reagent; (2) for amplification of samples cDNA 4 corresponding primers and probes. The invention discloses a kit for detecting hepatitis C virus (HCV) genotype, which can detect 1, 2, 3 and 6 type HCV viruses in China by virus RNA extraction, reverse transcription and real-time fluorescent quantitative PCR. The results obtained by this kit are highly accurate, more rapid, simple, sensitive and specific than Sanger sequencing, and reduce the risk and cost of contamination.
【技术实现步骤摘要】
本专利技术属生命科学和生物
,特别是一种用于检测丙肝病毒基因型的试剂盒。
技术介绍
丙型肝炎病毒(Ifepatitis C Virus,HCV)属黄病毒科,基因组全长9. 5 Kb,它是引发慢性肝炎,肝硬化和肝癌的主要病因之一,是世界范围内亟待解决的公共卫生难题。由于 HCV的RNA聚合酶缺乏校正功能,因而其基因组序列常表现出显著异源性和高度可变性,且已被分为6个主要基因型(1-6)和70多个亚型,而NS5B是常用的HCV分型区域。此外,国内外研究发现HCV基因型不但存在地域分布差异性,其不同基因型与肝病严重程度,干扰素应答也有一定相关性。因此,HCV基因分型检测对研究丙型肝炎传播,诊断,后期治疗及疫苗研制等均有重要意义。HCV基因型具有明显的地域差异性。欧美以I型为主;4型多分布于印度、中东地区;5型局限于南非;我国主要以I型为主,2型占次席,此外某些地区3型也有报道,而6型主要流行于香港和澳门及南方边境地区,总体来看1、2、3、6型为我国常见的HCV基因型。HCV基因型的地区分布为流行病学研究提供了帮助。通过研究基因型分布可以跟踪到人群中HCV爆发的来 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.用于检测丙肝病毒基因型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括 (1)RNA提取试剂、逆转录试剂、实时荧光定量PCR扩增反应试剂; (2)用于扩增样本cDNA的4对引物及相应的探针其中, 检测I型HCV病毒的引物及探针SEQl TTCACGGAGGCTATGACYAGG ;SEQ2 GGGTCACGGGTGAGATAGTASAC ;SEQ3 FAM- TCATGCTCCTCCAAYGTGTCRGTCG-TAMRA ; 检测2型HCV病毒的引物及探针 SEQ4 CTCGCTGACTGAGAGACTTTACG ;SEQ5 ATGGTGTTCCCCATGCTAGTAGT ;SEQ6 FAM- ACAGGCGTTGCCGCGCCA-TAMRA ; 检测3型HCV病毒的引物及探针SEQ7 TCACTCTGCCCGRTCGAART ;SEQ8 ACCTCGTTCTTCGCCATGAT ;SEQ9 FAM- AGGACGTTCGCTCCTTGTCCAGCA-TAMRA ; 检测6型HCV病毒的引物及探针SEQlO CCHATGGGCTTYTCTTACGACAC ;SEQll GGGGCYGAGTAYCTGGTCATGGC ;SEQI2 :FAM-TGACATGTTGGTSTGCGGAGAYGA-TAMARA。2.如权利要求I所述的试剂盒,其特征在于,所述RNA提取试剂包括Trizol,氯仿,异丙醇,无水乙醇和DEPC水;所述逆转录试剂包括5XRT-Buffer,IOOuM Primer Mix, 100U/ulReverTra Ace逆转录酶和DEPC水;所述实时荧光定量PCR试剂包括qPCR Mix,50XR0X,扩增弓I物及探针和灭菌水。3.如权利要求I或2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒的使用方法包括以下步骤 (1)用RNA提取试剂提取血清待检样本RNA; (2)用逆转录试剂将步骤(I)中得到的RNA进行反...
【专利技术属性】
技术研发人员:陈亦磊,方国伟,徐建成,王淑一,
申请(专利权)人:杭州艾迪康医学检验中心有限公司,
类型:发明
国别省市:
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。