The invention discloses a chip screening of avocado sunblotch viroid genus virus and its application. The invention provides a probe group identification or auxiliary identification of avocado sunblotch viroid genus virus, consisting of 5 probes, the nucleotide sequence of the 5 probes were sequence in 1-5. Also provides a gene chip screening of avocado sunblotch viroid genus virus, as the probe set is fixed on the base surfaces by gene chip. The experiment proves that the nucleotide sequence of the invention, the biological information virus of avocado sunblotch viroid methodology for analysis, design of the probe compatibility group, standard samples of the virus test showed that the probe has good effect. Screening for quarantine and identification of avocado sunblotch viroid genus virus of the invention of the chip can be used for avocado sunblotch viroid genus virus.
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物信息学及生物检疫鉴定
，尤其涉及筛查鳄梨日斑类病毒属类病毒的芯片及其应用。
技术介绍
鳄梨日斑类病毒属类病毒(AvsunviiOid)属于鳄梨日斑类病毒科(Avsunviroidae),目前只包括鳄梨日斑类病毒(Avocado sunblotch viroid, ASBVd) 一个种。该类病毒侵染鳄梨(Persea Americana)，在果实上引起黄色、白色或粉红色的斑纹，有时水果上能形成下陷的火山口状病斑，病斑可为黄色、绿色和深红色，受害果实不能上市，造成经济损失。该类病毒是2007年发布的《中华人民共和国进境植物检疫性有害生物名 录》中的检疫性有害生物，需要依法对其寄主植物及其产品进行检疫。随着国内外植物及其产品贸易的增加，该属出现“新”类病毒的频率越来越高，这种“新”主要表现在(1)发现该属内新的类病毒种；(2)发现鳄梨日斑类病毒新的寄主植物；(3)类病毒种间可能的变异；这3种情况都会导致该属内出现新的具有检疫风险性的类病毒。对于这些潜在的新类病毒需要建立广谱性筛查技术，以便达到快速(一次反应可检测同一样品中该属的所有类病毒)、广...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种鉴定或辅助鉴定鳄梨日斑类病毒属类病毒的探针组，由探针I-探针5共5条探针组成，所述探针I-探针5的核苷酸序列依次分别为序列表中的序列1-5。2.根据权利要求I所述的探针组，其特征在于所述鳄梨日斑类病毒属类病毒为鳄梨日斑类病毒。3.—种筛查鳄梨日斑类病毒属类病毒的基因芯片，为将权利要求I或2所述的探针组固定在片基表面得到的基因芯片。4.根据权利要求3所述的基因芯片，其特征在于所述片基为醛基化玻璃片基；所述鳄梨日斑类病毒属类病毒为鳄梨日斑类病毒。5.一种筛查鳄梨日斑类病毒的试剂盒，包括权利要求3或4所述的基因芯片。6.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于所述试剂盒还包括用于扩增所述鳄梨 日斑类病毒属类病毒的cDNA的引物对，所述引物对具体由序列表中序列6和序列表中序列7所示的DNA分子组成；所述鳄梨日斑类病毒属类病毒为鳄梨日斑类病毒。7.权利要求I或2所述探针组、权利要求3或4所述的基因芯片、权利要求5或6所述的试剂盒在如下I) -4)中的应用 O鉴定或辅助鉴定鳄梨日斑类病毒属类病毒； 2)制备鉴定或辅助鉴定鳄梨日斑类病毒属类病毒产品； 3)鉴定或辅助鉴定待测植物感染鳄梨日斑类病毒属类病毒； 4 )制备鉴定或辅助鉴定...
【专利技术属性】
技术研发人员：张永江，朱水芳，辛言言，李桂芬，赵文军，李明福，魏梅生，
申请(专利权)人：中国检验检疫科学研究院，
类型：发明
国别省市：
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