用于评价临床不育的方法和系统技术方案

提供了用于便于评价临床不育的方法和基于计算机的系统。可实施所述方法和系统，例如，便于为体外受精治疗周期评价受治疗者，包括确定活产事件概率。可实施所述方法和系统，例如，便于确定胚胎的成功植入、选择将移植的胚胎的最佳数目、确定在不成功的治疗周期之后随后体外受精治疗周期的成功。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于评价临床不育的方法和系统交叉引用本申请要求2008年7月1日提交的美国临时专利申请号61/077，439和2008年7 月17日提交的美国临时专利申请号61/081，596的权益，这些申请通过引用全文并入本文。政府权益本专利技术在美国国家卫生研究院给予的联邦政府拨款第ROl GM067250和ROl HD057970号的政府支持下进行。美国政府对本专利技术有某些权利。
技术介绍
生殖失败是严重的问题，临床上已通过各种辅助的生殖技术包括体外受精(IVF) 和胚胎移植(ET)来解决。由于体外受精提供了在形态学水平表现正常的胚胎用于移植到 完全易感的接受者，可能预料这些程序产生极其高的受孕率。尽管有这些努力，IVF/ET的成 功率低于理想。在1994年美国和加拿大公布的IVF/ET数据中，开始了 26，961个标准IVF 周期。其中，86. 2%达到采集，其中的90. 2%达到移植。然而，在临床妊娠方面，总成功率是 每个开始的周期22. 7%，每次移植29. 的妊娠率。另外，在体外受精之后似乎有早期妊娠丢失的高发生率，生化妊娠率是18%，自然 流产率是27%。因此，看起来IVF技术已被充分优化，但植入失败可能是进行ET的大量丢 失的原因，这种围植入丢失是可能改进的领域。各种辅助的生殖技术的成功率的关键因素 是子宫内膜容受性，这是一种必须与胚胎发育至植入_感受态的胚泡协调的过渡态。IVF是一种昂贵的程序，对于患者来说在心理学上可能是创伤性的。需要外科手 术来从IVF的女性收集卵子，在受精之后，需要进一步的外科手术来在子宫中植入受精卵。 然后接受者必须等待一段时间才能确定是否已建立起妊娠。在一些病例，可能尽管重复多 次努力而不能实现妊娠，这些病例可能对患者和社会在财务和人力两方面造成相当大的花 费。因此，尽管可改进IVF的成功率，可能期望的是能够在治疗前鉴定IVF不太可能成 功的接受者，从而使这些患者能够避免以上提到的IVF程序的花费和创伤。本专利技术解决了这些需要。专利技术概述提供了用于便于评价临床不育的方法和基于计算机的系统。可实施所述方法和系 统以，例如，便于为体外受精治疗周期评价受治疗者，包括确定活产事件概率。可实施所述 方法和系统以，例如，便于确定胚胎的成功植入、选择将移植的胚胎的最佳数目、确定在不 成功的治疗周期之后随后体外受精治疗周期的成功。本领域技术人员阅读以下更完全地描述的本专利技术细节之后，本专利技术的这些和其它 目标、益处和特征将变得明显。附图简述当结合附图阅读时，最佳地从以下详述理解本专利技术。需要强调的是，根据一般实 践，图的各个特征不是按比例的。相反，为了清楚，各个特征的大小是任意放大或缩小的。附 图中包括以下各图。附图说明图1显示数据的来源。图A显示在2005年进行的IVF周期。图B显示在665个 新的、非供体IVF周期中卵母细胞和胚胎的利用。图A中的所有数目表示周期的数目，图B 中的数目表示卵母细胞或胚胎的数目。新的周期由在同一周期中进行的促性腺素卵巢刺激 和胚胎移植来界定；冷藏周期利用从之前的周期获得和冷藏的胚胎；“全冷冻”是其中由于 医学或非医学原因，在同一周期中进行卵巢刺激，但胚胎被冷藏而不是被移植回的周期。由 于多种医学和非医学原因未达到新鲜胚胎移植，从分析中去除157个周期。图2显示根据在第3天的细胞数目，来自665个新的、非供体IVF病例的所有胚胎 的分布。图3显示变量和其在确定A)8细胞胚胎数(图A)、第3天FSH(图B)和胚胎总数 (图C)时的相对重要性。图4显示细胞周期蛋白A2被CCna2-M0翻译阻滞，导致胚胎在2-细胞期停滞。图A 显示通过RT-PCR在1-至2-细胞胚胎中的CCna2表达。图B显示核细胞周期蛋白A2定位 在83. 4士6. 0% CCna2-M0-注射的胚胎中不存在，但在所有未注射胚胎中存在；ρ < 0. 01)。 图C显示 50kD细胞周期蛋白A2蛋白在CCna2-M0-注射的胚胎中未检测到。图5，图A显示与对照相比，CCna2-M0诱导更高比率的2-细胞期停滞(ρ < 0. 01)。 图B显示只有1. 8士 1. 8% Ccna2-M0-注射的胚胎达到胚泡期(与Ccna2-MM相比ρ = 0. 06)。 图C显示2-细胞期停滞比率随着Ccna2-M0浓度减少(0. 5mM的ρ = 0. 05 ；0. 25mM Wp = 0.01)。图D显示在0. 25mM比在0. 75mM胚泡发育比率更高(ρ < 0. 001)。所有的柱和误差 棒代表分别来自至少3个独立实验组的平均值士 s. e.m.。比例尺是40 μ m。参见表1使用 的所有MO的靶向序列，表7是在每组实验中检验的胚胎总数。图6显示在最早阶段调节哺乳动物胚胎发育的机制。在野生型(+/_)胚胎中，在 胚胎基因组激活(EGA)之前存在母体转录物，而在母体-胚胎过渡阶段存在母体转录物和 胚胎转录物，这二者导致产生正常基因产物(图A)。在从对无效突变杂合(+/_)的母体产 生的纯合无效突变(-/_)胚胎中，持续的母体转录物和/或蛋白可能“拯救”或延迟表型出 现(图B)。相反，在从纯合突变女性或带有卵母细胞_特异性基因缺失的女性产生的纯合 无效突变胚胎中，观察到的缺陷可能反映卵母细胞缺陷，而不是早期胚胎中的特异性基因 需求(图C)。因此，当母体和早期胚胎转录物二者可能同时存在时，这些策略不解决特异 性基因在EGA尖点或在EGA期间的精确作用。在EGA时或EGA之前细胞质微注射反义吗啉 代寡核苷酸(MO)到野生型胚胎中导致母体和胚胎基因转录物二者的特异性翻译阻滞(图 D)。因为MO持续至少数个细胞分裂周期，基因_特异性翻译阻滞可能直到桑葚胚_胚泡期 都有效。在这些发育阶段期间基因产物的不存在将揭示关键的基因功能和暴露早期表型， 这是在常规基因-靶向策略中通过同源重组和基因转置可能不可检测的。尽管在其它物种 中已充分建立此模型，其将示例从考察胚胎基因的功能转化为考察基因产物的功能而不论 其母体或胚胎来源。图7显示实验策略。从野生型交配收集在2前核(2PN)或1_细胞期的胚胎，并注 射设计为靶向特定基因的反义吗啉代寡聚物(MO)。MO结合于5’ UTR或转录起始位点并通 过空间位阻阻滞翻译。体外培养微注射的胚胎和未注射的对照胚胎，观察发育表型诸如在 2-细胞、4-细胞、多细胞或桑葚胚阶段碎裂或停滞。如果基因-特异性MO —致地产生相同 表型，而错配对照MO允许正常发育，则目标基因的敲低由免疫细胞化学和/或免疫印迹法验证。基因功能的机制通过从在mid-2-细胞期(HCG后43小时)的注射和对照胚胎获得 全体基因表达谱而进一步研究。检验候选下游基因在早期胚胎中的差异表达和基因功能。图8显示通过单胚胎RT-PCR在小鼠合子中的0ct4表达。图9显示在形成胚泡之前早期胚胎发育需要0ct4。图A显示0ct4-M0_注射的胚胎 在多细胞期停滞，而对照达到胚泡期。图B显示0ct4敲低诱导在1-至多细胞期更高的停滞 比率；P <0.01。图C显示0ct4-M0-注射的胚胎都不发育为胚泡。图D显示随着0ct4-M0 浓度，在1-至多细胞期停滞比率减少(P < 0. 01)。图E显示随着减少浓度的0本文档来自技高网...

【技术保护点】
１．一种为体外受精程序评价女性受治疗者的方法，包括：从女性受治疗者获得信息项以提供所述女性受治疗者的谱，其中每个信息项与预选的患者变量有关；利用基于所述预选的患者变量的算法比较所述女性受治疗者的所述谱与已知指示对体外受精程序的响应度的已知谱图的文库，其中所述比较提供为体外受精程序对所述女性受治疗者的评价。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...

【专利技术属性】
技术研发人员：玛莲·W·M·姚，
申请(专利权)人：利兰·斯坦福青年大学托管委员会，
类型：发明
国别省市：US