蛋白质设计方法、装置、设备、介质和程序产品制造方法及图纸

技术编号:44555964 阅读:26 留言:0更新日期:2025-03-11 14:17
本申请公开了一种蛋白质设计方法、装置、设备、介质和程序产品,应用于人工智能领域。该方法包括:获取蛋白质框架,以及提取蛋白质框架的蛋白质特征;获取靶点蛋白序列,以及提取靶点蛋白序列的靶点蛋白特征;融合蛋白质特征与靶点蛋白特征,得到融合特征;融合特征用于表征蛋白质框架指示的蛋白质与靶点蛋白序列指示的靶点蛋白之间的相互作用下的序列信息和结构信息;基于融合特征对蛋白质框架执行蛋白质序列恢复,恢复蛋白质框架对应的预测蛋白质序列,以及,对预测蛋白质序列执行蛋白质结构预测,得到预测蛋白质序列对应的预测蛋白质结构。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及人工智能领域,特别涉及一种蛋白质设计方法、装置、设备、介质和程序产品


技术介绍

1、蛋白质(protein)是生物体内重要的大分子有机化合物。蛋白质的设计包括序列设计和结构设计,广泛应用于医学和药物研发、生物技术和工业应用、材料科学、诊断与治疗等领域。

2、相关技术中,基于大量的蛋白质对应的序列信息来训练蛋白质设计模型,以及,基于特定种类的靶点蛋白执行蛋白质设计模型的微调,以根据特定种类的靶点蛋白,生成与之结合的蛋白质。例如,靶点蛋白为抗原(antigen,ag),是指能引起抗体生成的物质,比如,细菌、病毒、花粉等。蛋白质为(antibody,ab)抗体,是指由于抗原的刺激而产生的具有保护作用的蛋白质。

3、然而,相关技术的方式难以捕捉蛋白质与靶点蛋白之间的相互作用,导致蛋白质设计的不够准确。


技术实现思路

1、本申请提供了一种蛋白质设计方法、装置、设备、介质和程序产品。所述技术方案如下:

2、一方面,提供了一种蛋白质设计方法,所述方法包括:

3、获本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种蛋白质设计方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述蛋白质特征包括:蛋白质序列特征、蛋白质配对特征和蛋白质结构,所述靶点蛋白特征包括:靶点蛋白MSA特征、靶点蛋白配对特征和靶点蛋白结构,所述融合特征包括:融合序列特征和融合配对特征;

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述融合所述蛋白质序列特征和所述靶点蛋白MSA特征,得到所述融合序列特征,包括:

4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述基于所述蛋白质结构和靶点蛋白结构,融合所述蛋白质配对特征、所述靶点蛋白配对特征、所述蛋白质序列特征和所述靶点...

【技术特征摘要】

1.一种蛋白质设计方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述蛋白质特征包括:蛋白质序列特征、蛋白质配对特征和蛋白质结构,所述靶点蛋白特征包括:靶点蛋白msa特征、靶点蛋白配对特征和靶点蛋白结构,所述融合特征包括:融合序列特征和融合配对特征;

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述融合所述蛋白质序列特征和所述靶点蛋白msa特征,得到所述融合序列特征,包括:

4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述基于所述蛋白质结构和靶点蛋白结构,融合所述蛋白质配对特征、所述靶点蛋白配对特征、所述蛋白质序列特征和所述靶点蛋白msa特征,得到所述融合配对特征,包括:

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述基于所述蛋白质配对距离和所述靶点蛋白配对距离,融合所述蛋白质配对特征、所述靶点蛋白配对特征、所述蛋白质序列特征和所述靶点蛋白msa特征,得到所述融合配对特征,包括:

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述基于所述蛋白质配对特征和所述蛋白质配对距离执行映射,计算第一部分融合配对特征,包括:

7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述基于所述靶点蛋白配对特征和所述靶点蛋白配对距离执行映射,计算第二部分融合配对特征,包括:

8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述基于所述蛋白质序列特征和所述靶点蛋白msa特征计算外积平均值,得到第三部分融合配对特征,包括:

9.根据权利要求2至8任一所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:

10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述在存在链间特征或相互作用特征的情况下,基于所述链间特征或所述相互作用特征,以及所述蛋白质结构和所述靶点蛋白结构,得到更新序列特征和...

【专利技术属性】
技术研发人员:吴凡迪赵宇肖阳
申请(专利权)人:腾讯科技深圳有限公司
类型:发明
国别省市:

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