一种乌龙茶茶树液相芯片及其应用制造技术

本发明专利技术涉及全基因组基因芯片领域，具体涉及一种乌龙茶茶树液相芯片及其应用。该芯片的基因分型对象包括45477个SNP位点，这些SNP位点均来自于乌龙茶品种铁观音基因组，位点信息具体如表1所示。本发明专利技术从大规模重测序数据中挖掘乌龙茶茶树基因组为参考的SNP位点，发现及筛选出可用于芯片设计的SNP位点45477个(即40K左右)，利用设计的液相芯片可以实现基因分型，在乌龙茶种质资源保护、乌龙茶品种选育，及其他茶树资源育种的多个相关领域中均具有很高的应用价值。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及全基因组基因芯片领域，具体涉及一种乌龙茶茶树液相芯片及其应用。

技术介绍

1、自1997年rapd分子标记首次被用于茶树遗传多样性研究以来，之后近30年的时间内，rflp、issr、aflp、ssr等各种分子标记及其衍生技术被茶学研究广泛使用，其中不乏以表达序列标签来构建茶树芯片的报道(陈亮，马春雷，姚明哲，王新超，金基强.一种茶树表达序列标签构成的基因芯片[p].cn101942514a.2011，01，12)。但是，这个阶段茶树参考基因组还没有组装完成，所有的分型分析技术在解析通量、可扩展性、灵活性等方面都有欠缺。之后，随着云抗10号、铁观音、舒茶早、龙井43、黄旦等茶树基因组的组装完成，茶树分子标记的应用也正在逐渐向有参考基因组的snp等高通量技术转变。

2、目前，液相芯片已被广泛应用在物种进化分析、种质资源评价、dna指纹鉴定等领域，都取得了令人满意的结果。液相芯片是利用重测序技术，再根据dna互补原理设计生物素标记的探针，实现对每个目标位点的高深度检测。该技术具有高准确性和高通量的优点，已经成为基因型检测、种质资源评价、本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.乌龙茶茶树液相芯片，其特征在于：该芯片的基因分型对象包括45477个SNP位点，这些SNP位点均来自于乌龙茶品种铁观音基因组，位点信息具体如表1所示。

2.如权利要求1所述乌龙茶茶树液相芯片在乌龙茶茶树及其他类型茶树性状的关联基因定位、遗传多样性分析、全基因组关联分析、基因组选择、品种鉴定、亲缘关系鉴定、核心种质筛选、指纹图谱构建或辅助育种中的应用。

【技术特征摘要】

1.乌龙茶茶树液相芯片，其特征在于：该芯片的基因分型对象包括45477个snp位点，这些snp位点均来自于乌龙茶品种铁观音基因组，位点信息具体如表1所示。

2.如权利要求1...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈常颂，孔祥瑞，单睿阳，余文权，
申请(专利权)人：福建省农业科学院茶叶研究所，
类型：发明
国别省市：