一种测序文库构建方法技术

技术编号:42805779 阅读:52 留言:0更新日期:2024-09-24 20:49
本发明专利技术提供了一种测序文库构建方法,所述方法包括以下步骤:1)打断待测DNA;2)对打断的DNA进行末端修复,3’端加“A”,其中末端修复缓冲液包含有标记的dNTP;3)连接接头,形成文库‑接头连接产物;4)利用步骤2)中的所述标记对所述文库‑接头连接产物进行纯化;5)对纯化的所述文库‑接头连接产物进行PCR扩增;6)纯化PCR产物。相比于传统建库方法,利用本发明专利技术的方法可以有效分离文库与接头二聚体,实现高质量建库。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于测序,具体涉及一种测序文库构建方法


技术介绍

1、随着基因测序技术的普及,尤其是大通量的二代测序(ngs)的普遍使用,对于费用成本和准确度的要求也越来越高。基因测序一般需要经过文库构建、然后将构建好的文库进行测序两个步骤。

2、在ngs文库构建中,接头连接是一个重要步骤。在被打断、末端修复的dna片段的两端分别加上接头,该过程是没有选择性的,因此连接过程中也会存在大量的接头之间直接连接,无插入片段。这样的接头二聚体在建库过程中很难完全去除。

3、尤其是对于低起始量或质量较差的样本,文库构建过程中接头二聚体的存在将影响文库的产量,这些接头二聚体并不是所需要了解的序列信息,且这些序列大量重复存在将严重影响目的序列的数据产出,浪费测序成本。同时这些大量的非目的序列片段将拉低整张芯片的数据质量。但如果通过降低接头使用量来降低二聚体的产出,则将造成文库的产量较低,受限于待测样本质量,仍不可避免接头二聚体的存在。

4、因此,本领域亟需一种可以去除接头二聚体的测序文库构建方法。


>技术实现思路本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种测序文库构建方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤2)中的所述末端修复缓冲液包含Tris-HCl、KCl或NaCl、MgCl2或MnCl2。

3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,步骤2)中的所述dNTP是dATP、dTTP、dCTP、dGTP或其任何组合。

4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法,其特征在于,步骤2)中的所述标记是生物素,步骤4)中利用连接有链霉亲和素的磁珠对所述文库-接头连接产物进行纯化。

5.根据权利要求1-3中任一项所述的方法,其特征在于,步骤2)中...

【技术特征摘要】

1.一种测序文库构建方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤2)中的所述末端修复缓冲液包含tris-hcl、kcl或nacl、mgcl2或mncl2。

3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,步骤2)中的所述dntp是datp、dttp、dctp、dgtp或其任何组合。

4.根据权利要求1-3中任一项所述的方法,其特征在于,步骤2)中的所述标记是生物素,步骤4)中利用连接有链霉亲和素的磁珠对所述文库-接头连接产物进行纯化。

5.根据权利要求1-3中任一项所述的方法,其特征在于,步骤2)中的所述标记是抗原,步骤4)中利用连接有抗体的磁珠对所述文库-接头连接产物进行纯化,所述抗...

【专利技术属性】
技术研发人员:王瑞超梁加龙孙永乐皮永硕任丽平蔡万世
申请(专利权)人:艾吉泰康生物科技北京有限公司
类型:发明
国别省市:

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