作为癌症免疫疗法的表达突变KRAS、突变癌症驱动基因或肿瘤相关抗原的经修饰的沙粒病毒颗粒制造技术

技术编号:42416061 阅读:20 留言:0更新日期:2024-08-16 16:32
本发明专利技术涉及适合用于治疗赘生性疾病如癌症的经遗传修饰的沙粒病毒。本文所描述的沙粒病毒可适合用于治疗赘生性疾病和/或适用于免疫疗法。特别是,本文提供了通过施用经遗传修饰的沙粒病毒用于治疗赘生性疾病的方法和组合物,其中所述沙粒病毒已经工程化以单独包括编码突变KRAS的一个或多个抗原片段的核苷酸序列,或进一步包括编码突变癌症驱动基因(例如突变TP53)或肿瘤相关抗原的一个或多个抗原片段的核苷酸序列。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍


技术实现思路

【技术保护点】

1.一种沙粒病毒颗粒,其中

2.如权利要求1所述的沙粒病毒颗粒,其中KRAS中的所述突变在KRAS的氨基酸位置G12、G13、A18、A59、Q61、K117、A146或D119处。

3.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中KRAS中的所述突变为A18D、A59E、A59G、A59P、A59T、A59S、A59V、A146P、A146S、A146T、A146V、D119N、G12A、G12C、G12D、G12F、G12L、G12R、G12S、G12V、G13A、G13C、G13D、G13E、G13R、G13S、G13V、K117N、Q61E、Q61H、Q...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种沙粒病毒颗粒,其中

2.如权利要求1所述的沙粒病毒颗粒,其中kras中的所述突变在kras的氨基酸位置g12、g13、a18、a59、q61、k117、a146或d119处。

3.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中kras中的所述突变为a18d、a59e、a59g、a59p、a59t、a59s、a59v、a146p、a146s、a146t、a146v、d119n、g12a、g12c、g12d、g12f、g12l、g12r、g12s、g12v、g13a、g13c、g13d、g13e、g13r、g13s、g13v、k117n、q61e、q61h、q61k、q61l、q61p、q61r或其组合。

4.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中kras中的所述突变为g12a、g12c、g12d、g12r、g12s、g12v、g13d、q61h、q61r、a146t或其组合。

5.如权利要求1所述的沙粒病毒颗粒,其中kras中的所述突变为g13d、g12v、g12c、g12d和g12r中的一者、多者或全部。

6.如权利要求1-5中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述核苷酸序列编码分别包含突变g13d、g12v、g12c、g12d和g12r的突变kras的n末端至c末端片段。

7.如权利要求5所述的沙粒病毒颗粒,其中kras中的所述突变为以任何可能次序排列的g13d、g12v、g12c、g12d和g12r中的全部。

8.如权利要求1所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒基因组包含与seq id no:20的序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一的核苷酸序列。

9.如权利要求1所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒基因组包含编码表达产物的核苷酸序列,所述表达产物的氨基酸序列与seq id no:19的氨基酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一。

10.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述突变kras的片段为8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30个氨基酸长。

11.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述突变kras的片段为18个氨基酸长。

12.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中侧接所述抗原片段的n末端处的所述突变的区域为0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸长。

13.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中侧接所述抗原片段的n末端处的所述突变的区域为8或9个氨基酸长。

14.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中侧接所述抗原片段的c末端处的所述突变的区域为0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸长。

15.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中侧接所述抗原片段的c末端处的所述突变的区域为8或9个氨基酸长。

16.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述核苷酸序列编码突变kras的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个抗原片段,并且其中每个抗原片段包含突变kras蛋白中的一者的突变。

17.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述核苷酸序列编码突变kras的五个抗原片段,并且其中每个抗原片段包含所述突变kras蛋白中的一者的突变。

18.如权利要求17所述的沙粒病毒颗粒,其中突变kras的所述五个抗原片段包含突变g13d、g12v、g12c、g12d和g12r。

19.如权利要求16至17中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述抗原片段包含突变kras蛋白的相同或不同突变。

20.如权利要求16至18中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述抗原片段经由相同或不同接头彼此融合。

21.如权利要求16至18中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述抗原片段彼此之间没有间插序列即直接融合。

22.如权利要求20所述的沙粒病毒颗粒,其中所述接头为aay接头(aay)、aaa接头(aaa)、gs接头(ggsggggsgg)(seq id no:42),或经由计算机预测优化的aay、aaa和gs接头序列的变体。

23.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述核苷酸序列经工程化以减少或去除任何cpg和tpa岛。

24.如权利要求23所述的沙粒病毒颗粒,其中所述cpg和tpa岛的去除包括三个周期:

25.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒基因组包含:

26.如权利要求1至19、21和23至25中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒基因组包含:

27.如权利要求1至19、21和23至26中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒基因组包含:

28.如权利要求1至19、21和23至26中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒基因组包含:

29.如权利要求1至24中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒基因组包含:

30.如权利要求25和29所述的沙粒病毒颗粒,其中所述第一s区段上编码所述抗原片段的核苷酸序列与所述第二s区段上编码所述抗原片段的核苷酸序列不同。

31.如权利要求25和29所述的沙粒病毒颗粒,其中所述第一s区段上编码所述抗原片段的核苷酸序列与所述第二s区段上编码所述抗原片段的核苷酸序列相同。

32.如权利要求25和29所述的沙粒病毒颗粒,其中所述第一s区段上经编码的所述抗原片段与所述第二s区段上经编码的所述抗原片段不同。

33.如权利要求25和29所述的沙粒病毒颗粒,其中所述第一s区段上经编码的所述抗原片段与所述第二s区段上经编码的所述抗原片段相同。

34.如权利要求33所述的沙粒病毒颗粒,其中所述第一s区段上经编码的所述抗原片段与所述第二s区段上经编码的所述抗原片段相同,但以与所述第二s区段上经编码的所述抗原片段彼此融合的次序不同的次序彼此融合。

35.如权利要求1至26和29至34中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒基因组还包含编码突变akt1、突变braf、突变her2、突变mek1、突变met、突变nras、突变pik3ca、突变ret、突变apc、突变u2af1、突变egfr、突变fbxw7、突变smad4、突变gnas、突变erbb2、突变erbb3、突变cdkn2a、突变tp53和/或突变ctnnb1的抗原片段的核苷酸序列,并且其中所述抗原片段包含相应突变。

36.如权利要求1至26和29至35中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒基因组还包含编码突变pi3kca的抗原片段的核苷酸序列,其中所述抗原片段包含e545k、h1047r和/或e542k突变。

37.如权利要求1至26和29至36中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒基因组还包含编码突变braf的抗原片段的核苷酸序列,其中所述抗原片段包含v600e突变。

38.如权利要求1至26和29至37中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒基因组还包含编码突变u2af1的抗原片段的核苷酸序列,其中所述抗原片段包含s34f突变。

39.如权利要求1至26和29至38中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒基因组还包含编码突变tp53的抗原片段的核苷酸序列,其中所述抗原片段包含g245s、y220c、r248q、r282w、h179r、v157f、r273c、r213l、r273h、r273l、r175h、r158l、r196p、r248w和/或c277f突变。

40.如权利要求1至26和29至39中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒基因组还包含编码birc家族、ceacam家族、cta家族、eph家族、erbb家族、folr家族、gast家族、gucy2家族、ido家族、il13ra家族、kdr家族、klk家族、mage家族、muc家族、pemt家族、sdc家族、slamf家族、tert家族、tlr家族、tpte家族、tyr家族、wt家族和/或xbp家族的抗原片段的核苷酸序列。

41.如前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒,其中所述沙粒病毒颗粒来源于淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒(lcmv)或皮钦德病毒。

42.一种药物组合物,所述药物组合物包含前述权利要求中任一项所述的沙粒病毒颗粒。

43.一种一个或多个核酸的集合,所述一个或多个核酸编码权利要求1至41中任一项所述的沙粒病毒颗粒的基因组。

44.一种宿主细胞,所述宿主细胞包含权利要求43所述的一个或多个核酸的集合。

45.一种制造权利要求1至41中任一项所述的沙粒病毒颗粒的方法,其中所述方法包括培养权利要求44所述的宿主细胞以及收集所述沙粒病毒颗粒。

46.一种治疗有需要的受试者的赘生性疾病的方法,其中所述方法包括向所述受试者施用沙粒病毒颗粒,其中

47.如权利要求46所述的方法,其中kras中的所述突变在kras的氨基酸位置g12、g13、a18、a59、q61、k117、a146或d119处。

48.如权利要求46至47中任一项所述的方法,其中kras中的所述突变为a18d、a59e、a59g、a59p、a59t、a59s、a59v、a146p、a146s、a146t、a146v、d119n、g12a、g12c、g12d、g12f、g12l、g12r、g12s、g12v、g13a、g13c、g13d、g13e、g13r、g13s、g13v、k117n、q61e、q61h、q61k、q61l、q61p、q61r或其组合。

49.如权利要求46至48中任一项所述的方法,其中kras中的所述突变为g12a、g12c、g12d、g12r、g12s、g12v、g13d、q61h、q61r、a146t或其组合。

50.如权利要求46至49中任一项所述的方法,其中kras中的所述突变为g13d、g12v、g12c、g12d和g12r中的一者、多者或全部。

51.如权利要求50所述的方法,其中所述核苷酸序列编码分别包含突变g13d、g12v、g12c、g12d和g12r的突变kras的n末端至c末端片段。

52.如权利要求50所述的方法,其中kras中的所述突变为以任何可能次序排列的g13d、g12v、g12c、g12d和g12r中的全部。

53.如权利要求46所述的方法,其中所述沙粒病毒基因组包含与seq id no:20的序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一的核苷酸序列。

54.如权利要求46所述的方法,其中所述沙粒病毒基因组包含编码表达产物的核苷酸序列,所述表达产物的氨基酸序列与seq id no:19的氨基酸序列至少80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一。

55.如权利要求46至54中任一项所述的方法,其中突变kras的所述抗原片段为8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30个氨基酸长。

56.如权利要求46至54中任一项所述的方法,其中突变kras的所述抗原片段为18个氨基酸长。

57.如权利要求46至52中任一项所述的方法,其中侧接所述抗原片段的n末端处的突变的区域为0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸长。

58.如权利要求46至52中任一项所述的方法,其中侧接所述抗原片段的n末端处的突变的区域为8或9个氨基酸长。

59.如权利要求46至58中任一项所述的方法,其中侧接所述抗原片段的c末端处的突变的区域为0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个氨基酸长。

60.如权利要求46至58中任一项所述的方法,其中侧接所述抗原片段的c末端处的突变的区域为8或9个氨基酸长。

61.如权利要求46至60中任一项所述的方法,其中所述核苷酸序列编码突变kras的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20个抗原片段,并且其中每个抗原片段包含所述突变kras蛋白中的一者的突变。

62.如权利要求46至60中任一项所述的方法,其中所述核苷酸序列编码突变kras的五个抗原片段,并且其中每个抗原片段包含所述突变kras蛋白中的一者的突变。

63.如权利要求62所述的方法,其中突变kras的所述五个抗原片段包含突变g13d、g12v、g12c、g12d和g12r。

64.如权利要求61所述的方法,其中所述抗原片段包含突变kras蛋白的相同或不同突变。

65.如权利要求61所述的方法,其中所述抗原片段经由相同或不同接头彼此融合。

66.如权利要求61-63中任一项所述的方法,其中所述抗原片段彼此之间没有间插序列即直接融合。

67.如权利要求65所述的方法,其中所述接头为aay接头(aay)、aaa接头(aaa)、gs接头(ggsggggsgg)(seq id no:42),或经由计算机预测优化的aay、aaa和gs接头序列的变体。

68.如权利要求46至67中任一项所述的方法,其中所述核苷酸序列经工程化以减少或去除任何cpg和tpa岛。

69.如权利要求68所述的方法,其中所述cpg和tpa岛的去除包括三个周期:

70.如权利要求46至69中任一项所述的方法,其中所述沙粒病毒基因组包含:

71.如权利要求46至64、66和68至70中任一项所述的方法,其中所述沙粒病毒基因组包含:

72.如权利要求46至64、66和68至70中任一项所述的方法,其中所述沙粒病毒基因组包含:

73.如权利要求46至64、66和68至70中任一项所述的方法,其中所述沙粒病毒基因组包含:

74.如权利要求46至69中任一项所述的方法,其中所述沙粒病毒基因组包含:

75.如权利要求70和74所述的方法,其中所述第一s区段上编码所述抗原片段的核苷酸序列与所述第二s区段上编码所述抗原片段的核苷酸序列不同。

76.如权利要求70和74所述的方法,其中所述第一s区段上编码所述抗原片段的核苷酸序列与所述第二s区段上编码所述抗原片段的核苷酸序列相同。

77.如权利要求70和74所述的方法,其中所述第一s区段上经编码的所述抗原片段与所述第二s区段上经编码的所述抗原片段不同。

78.如权利要求70和74所述的方法,其中所述第一s区段上经编码的所述抗原片段与所述第二s区段上经编码的所述抗原片段相同。

79.如权利要求78所述的方法,其中所述第一s区段上经编码的所述抗原片段与所述第二s区段上经编码的所述抗原片段相同,但以与所述第二s区段上经编码的所述抗原片段彼此融合的次序不同的次序彼此融合。

80.如权利要求46至79中任一项所述的方法,其中所述赘生性疾病为胰腺癌、结直肠癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌或非小细胞肺癌(nsclc)。

81.如权利要求46至79中任一项所述的方法,其中所述沙粒病毒基因组包含编码突变kras的抗原片段的核苷酸序列,其中所述抗原片段包含突变,其中kras中的所述突变为g12d、g12v、g12r、q61h、q61r、g12c、g12s和/或g12a,并且其中所述赘生性疾病为胰腺癌。

82.如权利要求46至79中任一项所述的方法,其中所述沙粒病毒基因组包含编码突变kras的抗原片段的核苷酸序列,其中所述抗原片段包含突变,并且其中kras中的所述突变为g13d、g12v、g12c、g12d和g12r,并且其中所述赘生性疾病为胰腺癌、结直肠癌或肺腺癌。

83.如权利要求46至71和74至79中任一项所述的方法,其中所述沙粒病毒基因组还包含编码突变tp53的抗原片段的核苷酸序列,其中所述抗原片段包含突变,其中kras中的所述突变为g12d、g12r、g12v、q61h和/或q61r,其中tp53中的所述突变为r175h、r248w、g245s、r282w、r248q和/或r273c,并且其中所述赘生性疾病为胰腺癌。

84.如权利要求46至71和74至79中任一项所述的方法,其中所述沙粒病毒基因组还包含编码突变tp53和/或突变u2af1的抗原片段的核苷酸序列,其中所述抗原片段包含突变,其中kras中的所述突变为g12d、g12v、g12r、q61h和/或q61r,其中tp53中的所述突变为r175h、r248w、g245s、r282w、r248q和/或r273c,其中u2af1中的所述突变为s34f,并且其中所述赘生性疾病为胰腺癌。

85.如权利要求46至71和74至79中任一项所述的方法,其中所述沙粒病毒基因组还包含编码突变braf、突变tp53、突变fbxw7和/或突变pi...

【专利技术属性】
技术研发人员:亨宁·劳特巴赫约格·克里斯多夫·兰伯特穆罕默德·哈贝丁乔西帕·拉古兹蒂莫·斯奇珀斯莎拉·施密特莎拉·艾哈迈迪艾伯桑德拉·罗斯科普夫克劳斯·奥尔林格伊戈尔·马图沙尼斯基
申请(专利权)人:霍欧奇帕生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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