The invention discloses a method for judging possible molecular structure of protein protein conformational disease transformation key site, which includes the following steps: the known non redundant data representative of the protein as the basis of the data set; each protein molecule basic data in M residues long divided into peptides, peptide section the total construction set; set in each segment of the polypeptide segment polypeptide homologous polypeptide piece set; to study protein molecules in M residues long divided into peptides, and j peptides on the initial position of each peptide was calculated from the evolution of regional jump to jump probability of another region; conformational change filter evolution allowed; jump the highest probability that peptides may result in key sites of protein conformational disease. The first algorithm uses the technical route of investigation, experimental research, to overcome the existing protein structural transfer research of high complexity, huge manpower and financial resources consumption, time consuming and low efficiency.
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种研究蛋白构象病的方法，尤其是一种判断可能引起 蛋白构象病的蛋白质分子结构转化关键位点的方法。
技术介绍
蛋白质是生物体执行生理功能的基本物质。生物体内绝大多数生 病理过程都有蛋白质的直接参与。其中存在一些蛋白质，它们会在病理 状态下折叠成与正常态不同的错误结构，从而引起病变,这种疾病被称为 蛋白构象病。判断蛋白质分子发生病态结构转换的发病位点是在分子水 平上研究、治疗这类疾病的一项基本要求。对该问题的研究涉及生命现 象的解析，构象病发病机制的排查，构象病临床疗法的制定，转基因生 命体设计等诸多方向和领域。该问题的研究对于临床医学尤为重要。例如，如果每个蛋白结构转 换的发病位点都是已知的，我们就可以对临床中观察到的异常表达的某 些蛋白进行人为的药物干预，阻断其错折叠途径，从而维持正常的生理 功能、达到治疗目的。蛋白质分子是由二十种氨基酸(不同的氨基酸由不同的字母来表示) 首尾相连而成的一维长链。蛋白质的三维结构是通过链内和链外的作用 力使该一维长链在三维空间中折叠、塌缩而成。当前研究构象病蛋白发 病起始点的主要方法是实验方法。如通过单残基突变产生...
【技术保护点】
一种判断可能引起蛋白构象病的蛋白质分子结构转化关键位点的方法，其特征在于利用多肽相空间的“双吸引域特性”进行预测，具体包括如下步骤： １）将已知的由自然界中有代表性的蛋白质所构成的非冗余数据集作为基础数据； ２）将基础数据中的每 个蛋白质分子视为连续的多肽链，按照ｍ残基长将每个蛋白质分子均划分成ｎ－ｍ＋１个多肽段，由此构建一个多肽段总集合，其中ｎ为蛋白质分子多肽链的残基数； ３）构建多肽段总集合中每一个多肽段的同源多肽段子集合； ４）将待研究蛋白质分子多 肽链按照ｍ残基长划分成ｎ－ｍ＋１个多肽段，并将划分的各多肽段按其起始位置定义...
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：刘鑫，赵亚溥，
申请(专利权)人：中国科学院力学研究所，
类型：发明
国别省市：11[中国|北京]
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