【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及病原基因检测,尤其是一种基于宏基因组测序数据的分析病原耐药性的方法。
技术介绍
1、病原微生物是指一类能够引起人类或者动物感染,进而导致疾病发生的微生物,包括细菌、真菌、病毒、寄生虫等。目前,使用抗生素治疗病原微生物是一种临床常用的方法,但是抗生素的过度使用造成了微生物产生耐药性。
2、目前,微生物耐药性检测通常以药敏实验为主,但是该方法存在时间长且操作复杂等问题。宏基因组测序技术能够快速、无偏地检测样本中所有微生物的序列信息,通过该技术可以检测耐药基因信息,从而辅助耐药表型的预测。专利cn2021114005405使用全基因组关联研究和机器学习的方法筛选与细菌耐药表性相关的特征,并赋予权重分析,但是未考虑到多个耐药基因的共同作用下对微生物耐药性的影响,且使用同一种模型进行耐药性预测,可能会降低预测的准确性。
3、因此,需要一种考虑多个基因相互作用的多重耐药表型预测模型,可以利用多模型的预测结果进行综合分析,提高耐药表型预测的准确性。
技术实现思路
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...【技术保护点】
1.一种分析病原微生物耐药表型的方法,其特征在于,包括耐药特征筛选模块、耐药风险评分模型确定模块和耐药性风险评估模块:
2.根据权利要求1的分析病原微生物耐药表型的方法,其特征在于,所述耐药特征筛选模块具体步骤如下:
3.根据权利要求2的分析病原微生物耐药表型的方法,其特征在于,步骤S16所述耐药特征评分模型1的计算公式为:
4.根据权利要求1的分析病原微生物耐药表型的方法,其特征在于,所述耐药风险评分模型确定模块的具体步骤如下:
5.根据权利要求4的分析病原微生物耐药表型的方法,其特征在于,步骤S21所述编码规则包括耐
...【技术特征摘要】
1.一种分析病原微生物耐药表型的方法,其特征在于,包括耐药特征筛选模块、耐药风险评分模型确定模块和耐药性风险评估模块:
2.根据权利要求1的分析病原微生物耐药表型的方法,其特征在于,所述耐药特征筛选模块具体步骤如下:
3.根据权利要求2的分析病原微生物耐药表型的方法,其特征在于,步骤s16所述耐药特征评分模型1的计算公式为:
4.根据权利要求1的分析病原微生物耐药表型的方法,其特征在于,所述耐药风险评分模型确定模块的具体步骤如下:
5.根据权利要求4的分析病原微生物耐药表型的方法,其特征在于,步骤s21所述编码规则包括耐药基因特征编码规则和耐药表型编码规则;
6.根据权利要求4的分析病原微生物耐药表型的方法,其特征在于,步骤s26所述耐药特征评分模型2的计算公式为:
7.根据权利要求1的分析病原微生物...
【专利技术属性】
技术研发人员:高乾坤,剡江梅,
申请(专利权)人:杭州洛兮医学检验实验室有限公司,
类型:发明
国别省市:
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