System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种用于检测2型糖尿病易感基因多态性位点的引物探针组及试剂盒制造技术_技高网

一种用于检测2型糖尿病易感基因多态性位点的引物探针组及试剂盒制造技术

技术编号:41403468 阅读:3 留言:0更新日期:2024-05-20 19:29
本发明专利技术公开了一种用于检测2型糖尿病易感基因多态性位点的引物探针组及试剂盒,试剂盒包括PCR预混液1‑4,PCR预混液1‑4包括用于检测CYP2C9c.1075A>C、IRS1c.2911G>A、KCNJ11c.67T>C、C11orf65c.175‑5285C>A、SLC30A8c.826C>T、PPARGc.34C>G位点的引物探针组,引物探针组包括阻滞引物和ARMS引物。本发明专利技术的检测试剂盒支持血液直扩,操作简单,通过设置预混形式的PCR预混液并协调各个位点的组合,实现了一管式检测3个靶标基因和1个内标基因,特异性强、灵敏度高,体系稳定,通量高,大大降低了成本且适用广泛。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及基因检测领域,特别涉及一种用于检测2型糖尿病易感基因多态性位点的引物探针组及试剂盒


技术介绍

1、糖尿病已经成为当前威胁全球人类健康的最重要的慢性病之一,其中2型糖尿病(t2dm)占糖尿病患者90%以上,近年来呈快速增长趋势,可危及大血管、微血管及周围神经,导致心肌梗死、卒中、肾衰竭、失明及截肢等严重并发症,不仅严重影响患者的生活质量,同时也是患者致死的重要原因。目前临床上治疗和控制糖尿病及其并发症的口服降糖药种类较多,如二甲双胍、磺脲类、格列奈类、α-糖苷酶抑制剂、噻唑烷二酮类、dpp-4抑制剂、sglt2抑制剂,根据作用效果的不同,口服降糖药可分为主要以促进胰岛素分泌为主要作用的药物(磺脲类、格列奈类、二肽基肽酶-4(dpp-4)抑制剂)和通过其他机制降低血糖的药物(双胍类、噻唑烷二酮类、α-糖苷酶抑制剂、钠-葡萄糖协同转运蛋白2(sglt2)抑制剂),为t2dm患者提供了更多的治疗选择。

2、然而,t2dm患者对降糖药的治疗效果因个体差异显著,研究表明遗传作为t2dm发病的主要因素,不同的基因多态性可以造成不同人群对于t2dm不同的易感性。有研究报道,cyp2c9 c.1075a>c(rs1057910)基因多态性因单一氨基酸的替换而降低酶代谢底物活性,从而降低cyp2c9对磺脲类药物的代谢,该位点在东亚人群中的发生突变的频率为0.0436;irs1 c.2911g>a(rs1801278)位点的基因多态性与胰岛素抵抗和胰岛素分泌受损有关,其在东亚人群中发生突变的频率为0.0084;kcnj11基因在胰腺高度表达,对胰岛素分泌具有重要的调节作用,该基因c.67t>c(rs5219)位点突变可能通过影响katp通道对atp的敏感性,从而影响β细胞胰岛素分泌功能,在东亚人群中该位点发生突变的频率为0.6112;c11orf65 c.175-5285c>a(rs11212617)基因多态性与二甲双胍的降糖效果具有显著的相关性,携带c等位基因的个体二甲双胍疗效优于不带c等位基因个体,该位点在东亚人群中发生突变的频率为0.3989;slc30a8编码的是一种在胰岛细胞大量表达的锌离子转运蛋白,是一种多次跨膜蛋白,并且蛋白经过了多种形式的修饰,其主要功能是将胞浆内的锌离子转运到胰岛素分泌囊泡中,参与胰岛素合成、储存和分泌的重要功能,而c.826c>t(rs13266634)位点的c等位基因是中国人ii型糖尿病的风险等位基因,该等位基因在东亚人群中的发生频率为0.5860;过氧化物酶体增殖物激活受体γ(pparg)基因定位于3q25属于转录因子的核激素受体超家族,在调节胰岛素敏感性方面发挥着重要作用,tzd的疗效与pparg基因错义突变(cca-gca),即c.34c>g(rs1801282)位点的多态性相关,该位点在东亚人群中发生突变的频率为0.0409。因此,通过检测相关基因的snp位点对临床上更合理地使用口服降糖药具有重要的价值和意义。

3、现有的分子生物学检测基因多态性的方法有很多种,如中国专利号cn107955834b,名称为用于检测2型糖尿病易感基因的突变位点组合及其检测引物与应用,公开了通过基因测序的技术检测与2型糖尿病相关基因的snp位点,涉及到外周血提取—pcr扩增—多重pcr文库构建—产物纯化—文库检测—上机测序等步骤,尽管该方法有高通量、多位点的优势,但该方法同时存在步骤繁琐,试验周期长,成本高,灵敏度低,样本易污染等问题,不利于临床大面积推广。此外,中国专利号cn101619351b名称为一种糖尿病药物治疗相关基因突变的检测方法及其专用芯片和试剂盒,通过特异性探针杂交法(ssop)基因芯片技术检测糖尿病相关基因突变,需先进行pcr扩增,之后将含有目的snp位点的pcr产物与突变探针、野生探针杂交,通过比较两个探针杂交信号强度判断样品基因型。该方法操作过程繁琐,难以实现批量化与自动化,结果不易判读,假阳性概率高。再如飞行时间质谱检测技术,其适用20个以上基因位点的检测,少于10个基因位点,检测成本高,时间慢,另外仪器昂贵,对操作人员的要求也高。

4、因此,迫切需要开发一种操作简单、特异性强、灵敏度高、通量高、可靠性强和成本低的针对2型糖尿病药物敏感性相关snp位点进行检测的产品和方案。


技术实现思路

1、本专利技术的专利技术目的在于:针对上述存在的问题,提供一种用于检测2型糖尿病易感基因多态性位点的引物探针组及试剂盒,以克服现有技术所存在的不足。

2、本专利技术采用的技术方案如下:一种用于检测2型糖尿病易感基因多态性位点的引物探针组,包括用于检测cyp2c9 c.1075a>c、irs1 c.2911g>a、kcnj11 c.67t>c、c11orf65c.175-5285g>t、slc30a8 c.826c>t和pparg c.34c>g位点的引物探针组,引物探针组的核苷酸序列如表1所示:

3、表1

4、

5、

6、其中,用于检测cyp2c9 c.1075a>c位点的野生型引物探针组包括:核苷酸序列如seq id no.1所示的正向野生型引物、seq id no.3所示的反向共用引物和seq id no.4所示的探针;其突变型引物探针组包括:核苷酸序列如seq id no.2所示的正向突变型引物、seq id no.3所示的反向共用引物和seq id no.4所示的探针;

7、用于检测irs1 c.2911g>a位点的野生型引物探针组包括:核苷酸序列如seq idno.5所示的反向野生型引物、seq id no.7所示的正向共用引物和seq id no.8所示的探针;其突变型引物探针组包括:核苷酸序列如seq id no.6所示的反向突变型引物、seq idno.7所示的正向共用引物和seq id no.8所示的探针;

8、用于检测kcnj11 c.67t>c位点的野生型引物探针组包括:核苷酸序列如seq idno.9所示的正向野生型引物、seq id no.11所示的反向共用引物和seq id no.12所示的探针;其突变型引物探针组包括:核苷酸序列如seq id no.10所示的正向突变型引物、seq idno.11所示的反向共用引物和seq id no.12所示的探针;

9、用于检测slc30a8 c.826c>t位点的野生型引物探针组包括:核苷酸序列如seq idno.13所示的正向野生型引物、seq id no.16所示的反向共用引物和seq id no.17所示的探针;其突变型引物探针组包括:核苷酸序列如seq id no.14所示的正向突变型引物、seqid no.15所示的突变型阻滞引物、seq id no.16所示的反向共用引物和seq id no.17所示的探针;

10、用于检测c11orf65 c.175-5285g>t位点的野生本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于检测2型糖尿病易感基因多态性位点的引物探针组,其特征在于,包括用于检测CYP2C9 c.1075A>C、IRS1 c.2911G>A、KCNJ11 c.67T>C、C11orf65 c.175-5285G>T、SLC30A8 c.826C>T和PPARG c.34C>G位点的引物探针组,引物探针组的核苷酸序列如表1所示:

2.如权利要求1所述的引物探针组,其特征在于,检测CYP2C9 c.1075A>C位点的引物在其3’端的第2-5位置引入错配碱基,在其5’端的第2-6位置引入错配碱基;

3.如权利要求1或2所述的引物探针组,其特征在于,所述探针为Taqman荧光探针,所述探针的5’端选用FAM、Texas Red、HEX、CY5、Alexa Fluor 680、ROX其中的一种荧光染料进行标记;所述探针的3’端选用BHQ1、BHQ2其中的一种荧光染料进行标记。

4.一种用于检测2型糖尿病易感基因多态性位点的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括如权利要求1-3任一所述的引物探针组。

>5.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR预混液1-4,所述PCR预混液1包括检测CYP2C9 c.1075A>C、IRS1 c.2911G>A和KCNJ11 c.67T>C位点的野生型引物探针组;

6.如权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR预混液1-4中还包括用于检测内标基因RPPH的引物探针组合物,所述用于检测内标基因的引物核苷酸序列如SEQ ID NO.27和SEQ ID NO.28所示,所述探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.29所示。

7.如权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,PCR预混液1中检测CYP2C9 c.1075A>C、IRS1 c.2911G>A和KCNJ11 c.67T>C位点野生型引物的浓度为0.2-0.25μM,公用引物浓度为0.2-0.25μM,探针的浓度为0.15μM;

8.如权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR预混液1-4中还包括Tris-HCl、MgCl2、dNTPs、Taq酶及Buffer,所述MgCl2的终浓度为1.25mM,Tris-HCl的pH值为8.0,所述dNTPs的终浓度为0.15mM。

9.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包含SDS、甲酰胺、HCl成分的样本稀释液。

10.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包含阴性对照和阳性对照,所述阴性对照为生理盐水,所述阳性对照为包含所有目标基因靶序列多态性位点的DNA重组质粒。

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【技术特征摘要】

1.一种用于检测2型糖尿病易感基因多态性位点的引物探针组,其特征在于,包括用于检测cyp2c9 c.1075a>c、irs1 c.2911g>a、kcnj11 c.67t>c、c11orf65 c.175-5285g>t、slc30a8 c.826c>t和pparg c.34c>g位点的引物探针组,引物探针组的核苷酸序列如表1所示:

2.如权利要求1所述的引物探针组,其特征在于,检测cyp2c9 c.1075a>c位点的引物在其3’端的第2-5位置引入错配碱基,在其5’端的第2-6位置引入错配碱基;

3.如权利要求1或2所述的引物探针组,其特征在于,所述探针为taqman荧光探针,所述探针的5’端选用fam、texas red、hex、cy5、alexa fluor 680、rox其中的一种荧光染料进行标记;所述探针的3’端选用bhq1、bhq2其中的一种荧光染料进行标记。

4.一种用于检测2型糖尿病易感基因多态性位点的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括如权利要求1-3任一所述的引物探针组。

5.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括pcr预混液1-4,所述pcr预混液1包括检测cyp2c9 c.1075a>c、irs1 c.2911g>a和kc...

【专利技术属性】
技术研发人员:王鸿邓波范亮波杨静静刘琳郭晓荣李红东李明
申请(专利权)人:西安天隆科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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