System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种低温下农药诱导基因表达的方法技术_技高网
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一种低温下农药诱导基因表达的方法技术

技术编号:41400073 阅读:6 留言:0更新日期:2024-05-20 19:24
本申请公开一种低温下农药诱导基因表达的方法,农药为双炔酰菌胺,诱导mcherry在大肠杆菌或根癌农杆菌中23℃下表达,将质粒1和质粒2转化大肠杆菌Top10菌株,取阳性克隆37℃摇菌,待OD600到达0.50‑0.55,加入终浓度50µM的双炔酰菌胺,转移到23℃下继续摇菌检测目标基因表达效果;将质粒3转化根癌农杆菌LBA4404菌株,取阳性克隆在28℃摇菌,待OD600到达0.50‑0.55,加入终浓度50µM的双炔酰菌胺,23℃下继续摇菌检测目标基因表达效果;通过改变T7 RNA聚合酶的分割位点,对Mandi‑T7系统进行了改造,在大肠杆菌或根癌农杆菌中实现室温范围的诱导表达。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因表达调控,具体涉及一种低温下农药诱导基因表达的方法


技术介绍

1、本专利技术是申请人之前开发的农药诱导细菌基因表达技术(专利公开号cn113234746a)的改进和在低温下应用的拓展。其中使用的农药是双炔酰菌胺(mandipropamid),一种专门针对卵菌的低毒高效农药。双炔酰菌胺是先正达公司注册的农药制剂“瑞凡(revus)”的主要成分。农药诱导细菌基因表达技术(简称mandi-t7)是两个技术的组合。第一个技术是改造过的植物激素脱落酸(aba)共受体蛋白pyr1mandi和abi,能够产生依赖于农药双炔酰菌胺的蛋白相互作用,而不再对aba敏感[1,2]。申请人已公开的专利(cn113234746a)对abi蛋白进行了环式重排(以下称为abi-cp),abi新的氨基端靠近pyr1mandi蛋白的羧基末端,距离缩小到约24埃,空间上位于abi-cp蛋白同侧,这样pyr1mandi和abi更适于作为融合蛋白使其它蛋白空间邻近。第二个技术是t7 rna聚合酶双片段互补,即t7 rna聚合酶在某些位点被拆分、改造为两段,t7n和t7c分别表达,这两段自身不会自发重组为有功能的t7 rna 聚合酶;当t7n和t7c分别融合的蛋白可以互作,则t7n和t7c有可能被拉近,互补为有功能的 t7 rna聚合酶[3]。该技术可以将蛋白互作事件以t7 rna聚合酶重组后驱动目的基因表达的方式输出[3]。将这两种技术组合起来,pyr1mandi和t7n融合表达,abi-cp和t7c融合表达,农药双炔酰菌胺诱导pyr1mandi和abi-cp互作,t7n和t7c进而被拉近互补为有功能的 t7 rna聚合酶驱动下游基因表达(专利公开号cn113234746a)。由于t7rna聚合酶在多种生物中广泛使用,具有普适性,使双炔酰菌胺诱导基因转录激活理论上也具有普适性。申请人之前的专利中mandi-t7的工作温度为37摄氏度。后续研究发现当温度较低时,例如23摄氏度,该系统无法正常工作,无论诱导与否(不依赖双炔酰菌胺)都会检测到报告基因的表达。因为23摄氏度属于通常室温范围,是很多动物、植物的适宜生长温度,例如模式植物拟南芥和模式动物果蝇和线虫。为解决低温无法诱导的问题,申请人重新检查了mandi-t7的构成原件。其中负责响应双炔酰菌胺的蛋白pyr1mandi和abi来自于植物拟南芥,23摄氏度是植物正常生长的温度,不会出现不依赖双炔酰菌胺的蛋白互作。而t7c和t7n是基于t7 rna聚合酶在179位点分割产生的两个片段,经过定向进化的改造[3, 4],研究人员在t7n中引入了10个点突变,抑制了t7c和t7n原本自发重组的能力,成为检测蛋白互作的技术平台[3, 4]。由于定向进化是在37摄氏度生长的大肠杆菌中完成,所以可以认为t7c和t7n具有温度敏感的属性。当温度降至23摄氏度,t7n中的点突变不再有效抑制t7c和t7n蛋白自发重组,产生实验中观察到的不依赖于诱导剂的报告基因表达现象。因此申请人根据已经解析的t7 rna聚合酶全酶结构,发现了一种改造t7c和t7n片段的方法。t7 rna聚合酶全长883个氨基酸残基,之前mandi-t7中t7c和t7n的分割位点是179位氨基酸残基。本专利技术改变t7c和t7n的分割位点,从179改为109,结合原来t7n中定向进化的点突变位点,成为t7n-109。t7c(180-883)相应的变为t7c(110-883)。改造后将pyr1mandi和t7n-109融合表达,abi-cp和t7c(110-883)融合表达,农药双炔酰菌胺诱导pyr1mandi和abi-cp互作,t7n-109和t7c(110-883)进而被拉近互补为有功能的 t7 rna聚合酶驱动下游基因表达。申请人在大肠杆菌和根癌农杆菌中都实现了在23摄氏度下农药双炔酰菌胺诱导表达。检索文献报道的t7 rna聚合酶分割位点有67,179,301,563,600,663,和763 [5,6],都没有在23摄氏度用于检测蛋白互作。文献检索也没有发现使用t7 rna聚合酶的109位点分割t7 rna聚合酶的技术。

2、参考文献:

3、[1], park, sy, peterson, et al. agrochemical control of plant wateruse using engineered abscisic acid receptors. nature, (2015) 520: 545–548.

4、[2], ziegler, mj, yserentant, k, et al. a chemical strategy tocontrol protein networks in vivo. biorxiv 2020.04.08.031427; doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.08.031427

5、[3], pu j , zinkus-boltz j , dickinson b c . evolution of a split rnapolymerase as a versatile biosensor platform. nature chemical biology, 2017,13(4):432-438.

6、[4], pu j, kentala k, dickinson bc. multidimensional control of cas9by evolved rna polymerase-based biosensors. acs chemical biology, 2018, 13(2):431-437. doi: 10.1021/acschembio.7b00532.

7、[5], segall-shapiro th, meyer aj, ellington ad, sontag ed, voigt ca.a 'resource allocator' for transcription based on a highly fragmented t7 rnapolymerase. mol syst biol. 2014 jul 30;10(7):742. doi: 10.15252/msb.20145299.

8、[6], han t, chen q, liu h. engineered photoactivatable geneticswitches based on the bacterium phage t7 rna polymerase. acs synth biol. 2017feb 17;6(2):357-366. doi: 10.1021/acssynbio.6b00248。


技术实现思路

1、解决的技术问题:

2、本申请针对现有技术的不足,本申请解决现有诱导表达系统的不能在23摄氏度工作的局限性,提供一种在低温下利用双炔酰菌胺调控基因表达的方法,开发了可本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种低温下农药诱导基因表达的方法,其特征在于,所述农药为双炔酰菌胺,所述诱导基因表达为诱导mcherry在大肠杆菌或根癌农杆菌中23℃下表达;其中双炔酰菌胺诱导mcherry 在大肠杆菌中23℃下表达,具体包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述低温下农药诱导基因表达的方法,其特征在于:所述步骤1中大肠杆菌Top10菌株不能使用带有内源T7 RNA聚合酶的菌株。

3.根据权利要求2所述低温下农药诱导基因表达的方法,其特征在于:所述带有内源T7RNA聚合酶的菌株为BL21(DE3)菌株。

4.根据权利要求1所述低温下农药诱导基因表达的方法,其特征在于:所述步骤2中检测目标基因表达效果用以下参数,激发光587nm,发射光610nm检测报告基因mcherry的荧光强度。

5.根据权利要求1所述低温下农药诱导基因表达的方法,其特征在于:质粒1构建,含有两个表达盒,在大肠杆菌中在109位点T7RNA 聚合酶拆分成为eT7N和T7-RNAPc;T7-RNAPc和PYR1MANDI融合表达,eT7N与ABI-CP234融合表达;两个表达盒的终止原件分别为T7 ter 和ilvBN,其中eT7N序列如SEQ ID NO.4所示,ABI-CP234序列如SEQ ID NO.5所示,PYR1MANDI序列如SEQ ID NO.6所示, T7-RNAPc序列如SEQ ID NO.7所示;两个终止原件中T7 ter序列如SEQ ID NO.11所示,ilvBN序列如SEQ ID NO.12所示。

6.根据权利要求1所述低温下农药诱导基因表达的方法,其特征在于:质粒2表达盒含有启动子PT7驱动目标基因mcherry表达,所述PT7序列如SEQ ID NO.8所示,mcherry序列如SEQ ID NO.9所示。

7.根据权利要求1所述低温下农药诱导基因表达的方法,其特征在于,所述双炔酰菌胺诱导mcherry在根癌农杆菌中在23℃下表达,具体包括如下步骤:

8.根据权利要求7所述低温下农药诱导基因表达的方法,其特征在于:质粒3序列如SEQID NO.3所示,质粒3包含3个表达盒,分割的T7 RNA聚合酶片段T7-RNAPc和PYR1MANDI融合表达,eT7N与ABI-CP234融合表达,以及启动子PT7驱动目标基因mcherry表达;其中T7-RNAPc和PYR1MANDI融合表达、eT7N与ABI-CP234融合表达两个表达盒的终止原件分别为T7 ter 和ilvBN;eT7N序列如SEQ ID NO.4所示,T7 ter序列如SEQ ID NO.11所示,ilvBN序列如SEQID NO.12所示; ABI-CP234序列如SEQ ID NO.5所示,PYR1MANDI序列如SEQ ID NO.6所示,T7-RNAPc序列如SEQ ID NO.7所示;所述PT7序列如SEQ ID NO.8所示,mcherry序列如SEQ IDNO.9所示,质粒3还含有在根癌农杆菌中维持质粒复制的复制子pVS1,所述pVS1序列如SEQID NO.10所示。

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【技术特征摘要】

1.一种低温下农药诱导基因表达的方法,其特征在于,所述农药为双炔酰菌胺,所述诱导基因表达为诱导mcherry在大肠杆菌或根癌农杆菌中23℃下表达;其中双炔酰菌胺诱导mcherry 在大肠杆菌中23℃下表达,具体包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述低温下农药诱导基因表达的方法,其特征在于:所述步骤1中大肠杆菌top10菌株不能使用带有内源t7 rna聚合酶的菌株。

3.根据权利要求2所述低温下农药诱导基因表达的方法,其特征在于:所述带有内源t7rna聚合酶的菌株为bl21(de3)菌株。

4.根据权利要求1所述低温下农药诱导基因表达的方法,其特征在于:所述步骤2中检测目标基因表达效果用以下参数,激发光587nm,发射光610nm检测报告基因mcherry的荧光强度。

5.根据权利要求1所述低温下农药诱导基因表达的方法,其特征在于:质粒1构建,含有两个表达盒,在大肠杆菌中在109位点t7rna 聚合酶拆分成为et7n和t7-rnapc;t7-rnapc和pyr1mandi融合表达,et7n与abi-cp234融合表达;两个表达盒的终止原件分别为t7 ter 和ilvbn,其中et7n序列如seq id no.4所示,abi-cp234序列如seq id no.5所示,pyr1mandi序列如seq id no.6所示, t7-rnapc序列如seq id no.7所示;两个终止原件中t7 ter序列如seq id no.11所示,ilvbn序列如seq id ...

【专利技术属性】
技术研发人员:袁圆苗靳
申请(专利权)人:南通大学
类型:发明
国别省市:

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