从环境样本中同时提纯核酸和蛋白质的方法技术

技术编号:41305915 阅读:14 留言:0更新日期:2024-05-13 14:51
本发明专利技术公开了一种同时从环境微生物群中共提取核酸和蛋白质的方法,包括如下步骤:S1、样本裂解;将样本采用破碎微生物细胞体系进行破碎,离心,上层为有机相,下层为水相;S2、取上层有机相,利用沉淀法从有机相中提取蛋白;S3、取下层水相,离心,取上清液,提取核酸溶液;S4、取部分核酸溶液提取DNA;取剩余部分核酸溶液提取RNA。可以从土壤、沉积物、水体、污泥、粪便等环境样品提取宏基因,宏转录组及宏蛋白组,从而避免了样品异质性导致的多组学间的不匹配,有利于系统性地解析环境中微生物的功能。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及环境工程,本专利技术涉及了从环境样本中同时提纯核酸和蛋白质的方法


技术介绍

1、微生物约占地球生物量的三分之一,在维持地球生态环境,人类健康等方面发挥重要作用,通过培养的方法可以深入了解环境中微生物的功能,但目前却只能从环境中培养到极少部分的微生物,很多在自然环境以及疾病中重要的的微生物仍然没有培养物。测序方法的演进推动了非培养的研究手段的发展,大大了提升了人类对环境中微生物的认识。研究来源于整个环境样本中的dna,即宏基因组,可以获得整个微生物群的包括系统发育以及功能在内的整个基因信息。通过宏基因组学,已经建立了特定微生物功能与宿主表型变化之间的联系,如人类疾病状态及土壤、地下水和极端环境的变化。但宏基因组也有其局限性,dna序列可能来源于休眠或死亡的细胞中,因为不是所有的基因都会表达,宏基因组只能代表微生物群落的潜在功能。

2、若要更全面了解复杂微生物群所执行的功能,需知道哪些基因被表达成rna(宏转录组)和被翻译成蛋白质(宏蛋白质组)。将宏基因组、宏转录组和宏蛋白组与研究对象或者系统中观察到的现象进行全面结合,形成多组学联本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种同时从环境微生物群中共提取核酸和蛋白质的方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的核酸和蛋白质共提纯方法,其特征在于:

3.根据权利要求1所述的核酸和蛋白质共提纯方法,其特征在于,步骤S1中,所述有机相体系包括:含0.1%(w/v)的8-羟基喹啉的Tris饱和酚,pH 7.7-8.1。

4.根据权利要求1所述的核酸和蛋白质共提纯方法,其特征在于,步骤S1中,所述破碎微生物细胞体系还包括磨料;所述磨料包括石英砂、玻璃珠、钢珠中的至少一种。

5.根据权利要求1所述的核酸和蛋白质共提纯方法,其特征在于,步骤S2包括如下步骤...

【技术特征摘要】

1.一种同时从环境微生物群中共提取核酸和蛋白质的方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的核酸和蛋白质共提纯方法,其特征在于:

3.根据权利要求1所述的核酸和蛋白质共提纯方法,其特征在于,步骤s1中,所述有机相体系包括:含0.1%(w/v)的8-羟基喹啉的tris饱和酚,ph 7.7-8.1。

4.根据权利要求1所述的核酸和蛋白质共提纯方法,其特征在于,步骤s1中,所述破碎微生物细胞体系还包括磨料;所述磨料包括石英砂、玻璃珠、钢珠中的至少一种。

5.根据权利要求1所述的核酸和蛋白质共提纯方法,其特征在于,步骤s2包括如下步骤:

6.根据权利要求1所述的核酸和蛋白质共提纯方法,其特征在于,步骤s3包括如下步骤:<...

【专利技术属性】
技术研发人员:肖湘刘亮霆
申请(专利权)人:上海交通大学
类型:发明
国别省市:

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