一种菌株身份识别信息方法的建立及其应用技术

技术编号:41305746 阅读:23 留言:0更新日期:2024-05-13 14:51
本发明专利技术公开了一种菌株身份识别信息方法的建立及其应用。本发明专利技术所述的菌株为植物乳植杆菌。本研究表明,建立的方法能够针对实验室的批量分离菌株进行快速分型,获取具有不同RAPD扩增指纹图谱的菌株,并通过RAPD条带及特异基因扩增结果能够实现实验室菌株的准确鉴定;可具有针对性的设计荧光实时定量PCR特异性引物,准确定量混菌发酵体系中的不同单菌株,可实现对混菌体系中单菌株的实时监控,具有特异性强,灵敏度高的特点。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及微生物技术和益生菌发酵领域,具体涉及一种针对植物乳植杆菌身份识别信息的建立及混菌发酵中单一菌株的活菌实时定量的方法及其应用。


技术介绍

1、传统的菌株身份识别方法通常依赖于形态学特征、生理生化特性和16s rrna序列等基因分析。然而,这些方法存在一些局限性,如需要繁琐的实验步骤、较长的分析时间、对特定设备的依赖性以及在一些特殊情况下无法准确识别菌株的问题。因此,需要一种新的菌株身份识别信息方法,以克服传统方法的不足之处。

2、混菌发酵的优势在于混菌体系中不同的单菌株可以体现自身的发酵特性,同时不同菌株之间通过相互作用能够使发酵体系生成多种香气代谢产物,使发酵产品香气更具有多样性。因此菌株筛选对提升发酵产品品质是必要的,对混菌发酵果汁中的菌株生长情况、底物消耗及代谢产物生成等发酵过程动态变化进行探究,有利于确定更好的混菌发酵组合。但目前缺乏对混菌发酵过程中不同菌株动态变化的监控方法体系。

3、有鉴于此,提出本专利技术。


技术实现思路

1、本专利技术的目的是针对现有技术的不本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种通过RAPD-PCR/微流控芯片电泳和泛基因组分析建立细菌身份识别信息的方法及其应用,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

2.如权利要求1所述方法,其特征在于,所述微生物为乳酸菌;优选的,所述微生物为植物乳植杆菌。

3.如权利要求1-2所述,其特征在于,所述的反应体系为20μL,包括2×Mix10μL,随机引物2μL,DNA模板2μL,ddH2O 6μL。

4.如权利要求1-3所述的方法,其特征在于,所述RAPD-PCR/微流控芯片电泳反应条件为94℃预变性3min,94℃变性1min,48℃退火1min,72℃延伸2min,共进行35个循环扩...

【技术特征摘要】

1.一种通过rapd-pcr/微流控芯片电泳和泛基因组分析建立细菌身份识别信息的方法及其应用,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

2.如权利要求1所述方法,其特征在于,所述微生物为乳酸菌;优选的,所述微生物为植物乳植杆菌。

3.如权利要求1-2所述,其特征在于,所述的反应体系为20μl,包括2×mix10μl,随机引物2μl,dna模板2μl,ddh2o 6μl。

4.如权利要求1-3所述的方法,其特征在于,所述rapd-pcr/微流控芯片电泳反应条件为94℃预变性3min,94℃变性1min,48℃退火1min,72℃延伸2min,共进行35个循环扩增,72℃延伸10min。rapd-pcr产物浓度为10-20ng/μl,优选为15ng/μl。

5.如权利要1-4所述的方法,其特征在于,根据构建的细菌泛基因组数据挖掘每个菌株的特异基因,并建立菌株-特异基因个数-特异基因名称-特异基因序列-rapd扩增指纹图谱数据库,所述的身份识别信息包括菌株名称、菌株分离源、菌株基因组信息、菌株基因序列、菌株序列id等身份识别信息中的一个或者多个。

6.如权利要求1-5所述的方法在混...

【专利技术属性】
技术研发人员:薄文浩李俊龙王杰李语诺朱雨萱朱保庆
申请(专利权)人:北京林业大学
类型:发明
国别省市:

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