【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
1、将一种分化和特化的细胞类型直接谱系重编程为另一种细胞类型，是再生医学的一个主要目标。谱系决定因子(ldf)(例如，转录因子(tf)和/或mirna)的过表达可以引发重编程的过程，已经将其用于将分化的细胞，诸如成纤维细胞，转化为诱导性多能干细胞、神经元和心肌细胞。然而，在这种情况下，大多数研究已经报告，只有一小部分命运受挑战的细胞经历了重编程，因此目前限制了临床应用。
技术实现思路
1、在一方面，本公开提供了一种用于从不同细胞类型的细胞生成感兴趣细胞的方法。该方法包括相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，在所述不同细胞类型的细胞中降低至少一种屏障基因的表达水平，所述至少一种屏障基因选自atf7ip、junb、znf207、sp7、foxa1、hexim2、smarca5、sox15、chst2和nceh1；其中当所述至少一种屏障基因是atf7ip或sox15时，至少包括第二屏障基因。
2、在另一方面，本公开提供了一种用于从不同细胞类型的细胞生成感兴趣细胞的方法。该方法包括相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，在所述不同细胞类型的细胞中降低至少两种屏障基因的表达水平，所述至少两种屏障基因选自atf7ip、junb、znf207和sp7。
3、在一些实施方案中，至少一种屏障基因包括atf7ip、junb和znf207。在一些实施方案中，至少一种屏障基因还包括sp7。在一些实施方案中，该方法还包括相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，在所
4、在一些实施方案中，至少一种重编程激动剂基因选自mef2c、hspb3、tpp1、emc1、ppic、il7r、olfml3、tcta和efhd1。在一些实施方案中，该方法还包括增加至少一种谱系决定因子的表达水平。
5、在一些实施方案中，在所述至少一种屏障基因的所述表达水平降低后72小时内所述至少一种谱系决定因子的表达水平增加。在一些实施方案中，在所述至少一种屏障基因的所述表达水平降低后48小时内所述至少一种谱系决定因子的表达水平增加。在一些实施方案中，在所述至少一种屏障基因的所述表达水平降低后24小时内所述至少一种谱系决定因子的表达水平增加。
6、在一些实施方案中，不同细胞类型的细胞是成纤维细胞、内皮细胞或pbmc。
7、在一些实施方案中，该方法还包括相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，改变所述不同细胞类型的细胞的染色质结构。
8、在一些实施方案中，相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，所述不同细胞类型的细胞具有数量降低的与蛋白质结合的基序，该蛋白质由所述至少一种屏障基因表达。
9、在一些实施方案中，基序包括ap-1基序。
10、在一些实施方案中，感兴趣的细胞是心肌细胞样细胞、心肌细胞、神经元、骨骼肌细胞或诱导性多能干细胞。
11、在一些实施方案中，至少一种谱系决定因子选自mef2c、gata4、tbx5、ascl1、brn2、mytl1、oct4、klf4、sox2、myc和myod。
12、在一些实施方案中，相比于所述不同细胞类型的细胞，感兴趣的细胞具有至少一种心脏标志物的增加的表达。在一些实施方案中，至少一种心脏标志物选自actc1、myl7、tnnt2、scn5a、ryr2、nppa和nppb。在一些实施方案中，相比于所述不同细胞类型的细胞，感兴趣的细胞具有至少一种干细胞标志物的增加的表达。在一些实施方案中，至少一种干细胞标志物选自ssea4和nanog。
13、在一些实施方案中，相比于所述不同细胞类型的细胞，感兴趣的细胞具有至少一种神经元特异性标志物的增加的表达。在一些实施方案中，至少一种神经元特异性标志物选自vglut2、gad67、pvalb和syn1。
14、在一些实施方案中，降低至少一种屏障基因的表达水平包括使所述不同细胞类型的细胞与靶向所述至少一种屏障基因的至少一种sirna分子接触。
15、在一些实施方案中，所述不同细胞类型的细胞是体细胞。在一些实施方案中，感兴趣的细胞是体细胞。在一些实施方案中，该方法还包括将所述不同细胞类型的细胞转化为诱导性多能干细胞(ipsc)状态。
16、在另一方面，本公开提供了一种药物组合物，包含选自atf7ip、junb、znf207、sp7、foxa1、hexim2、smarca5、sox15、chst2和nceh1的至少一种屏障基因的至少一种抑制剂，及药学上可接受的载剂(carrier)或赋形剂；其中当所述至少一种屏障基因是atf7ip或sox15时，至少包括第二屏障基因的第二抑制剂。
17、一种药物组合物，包含选自atf7ip、junb、znf207和sp7的至少两种屏障基因的至少一种抑制剂，及药学上可接受的载剂或赋形剂。
18、在一些实施方案中，至少一种屏障基因包括atf7ip、junb和znf207。在一些实施方案中，至少一种屏障基因还包括sp7。在一些实施方案中，至少一种抑制剂包括靶向所述至少一种屏障基因的至少一种sirna分子。
19、在另一方面，本公开提供了用于修复或恢复有需要的对象中的受损组织的功能和结构完整性的方法，包括向所述对象施用有效量的本文所公开的药物组合物。
20、如权利要求32所述的方法，还包括施用至少一种谱系决定因子。
21、在一些实施方案中，在施用所述药物组合物后72小时内施用一种谱系决定因子。在一些实施方案中，在施用所述药物组合物后48小时内施用至少一种谱系决定因子。在一些实施方案中，在施用所述药物组合物后24小时内施用至少一种谱系决定因子。在一些实施方案中，受损组织是心脏组织并且其中所述至少一种谱系决定因子是mef2c、gata4或tbx5。
22、在一些实施方案中，受损组织是神经组织并且其中所述至少一种谱系决定因子是ascl1、brn2或mytl1。在一些实施方案中，受损组织是骨骼肌组织并且其中所述至少一种谱系决定因子是myod。在一些实施方案中，受损组织是干细胞谱系并且其中所述至少一种谱系决定因子是oct4、klf4、sox2或myc。
23、在另一方面，本公开提供了一种用于在有需要的受体中进行细胞移植的方法，包括从供体的第一细胞生成第二细胞，其中所述供体与所述受体免疫相容，并且其中根据本文所公开的方法生成所述第二细胞；并且将所述第二细胞移植到所述受体中。
24、在一些实施方案中，受体和所述供体是同一个体。在一些实施方案中，第一细胞是成纤维细胞或内皮细胞。在一些实施方案中，第二细胞是心肌细胞样细胞、心肌细胞、神经元、骨骼肌细胞或干细胞样细胞。
25、在另一方面，本公开提供了用于从不同细胞类型的细胞生成感兴趣的细胞的方法，该方法包括相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，在所述不同细胞类型的细胞中降低至少一本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种用于从不同细胞类型的细胞生成感兴趣的细胞的方法，包括相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，在所述不同细胞类型的细胞中降低至少一种屏障基因的表达水平，所述至少一种屏障基因选自ATF7IP、JUNB、ZNF207、Sp7、FOXA1、HEXIM2、SMARCA5、SOX15、CHST2和NCEH1；其中当所述至少一种屏障基因是ATF7IP或SOX15时，至少包括第二屏障基因。
2.一种用于从不同细胞类型的细胞生成感兴趣的细胞的方法，包括相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，在所述不同细胞类型的细胞中降低至少两种屏障基因的表达水平，所述至少两种屏障基因选自ATF7IP、JUNB、ZNF207和Sp7。
3.如权利要求1或2所述的方法，其中所述至少一种屏障基因包括ATF7IP、JUNB和ZNF207。
4.如权利要求3所述的方法，其中所述至少一种屏障基因还包括Sp7。
5.如权利要求1-4中任一项所述的方法，还包括相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，在所述不同细胞类型的细胞中增加至少一种重编程激动剂基因的表达水平。p>
6.如权利要求5所述的方法，其中所述至少一种重编程激动剂基因选自MEF2C、HSPB3、TPP1、EMC1、PPIC、IL7R、OLFML3、TCTA和EFHD1。
7.如权利要求1-6中任一项所述的方法，还包括增加至少一种谱系决定因子的表达水平。
8.如权利要求7所述的方法，其中在所述至少一种屏障基因的所述表达水平降低后72小时内所述至少一种谱系决定因子的所述表达水平增加。
9.如权利要求8所述的方法，其中在所述至少一种屏障基因的所述表达水平降低后48小时内所述至少一种谱系决定因子的所述表达水平增加。
10.如权利要求9所述的方法，其中在所述至少一种屏障基因的所述表达水平降低后24小时内所述至少一种谱系决定因子的所述表达水平增加。
11.如权利要求1-10中任一项所述的方法，其中所述不同细胞类型的细胞是成纤维细胞、内皮细胞或PBMC。
12.如权利要求1-11中任一项所述的方法，还包括相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，改变所述不同细胞类型的细胞的染色质结构。
13.如权利要求12所述的方法，其中相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，所述不同细胞类型的细胞具有数量降低的与蛋白质结合的基序，所述蛋白质由所述至少一种屏障基因表达。
14.如权利要求13所述的方法，其中所述基序包括AP-1基序。
15.如权利要求1-14中任一项所述的方法，其中所述感兴趣的细胞是心肌细胞样细胞、心肌细胞、神经元、骨骼肌细胞或诱导性多能干细胞。
16.如权利要求7-15中任一项所述的方法，其中所述至少一种谱系决定因子选自MEF2C、GATA4、TBX5、ASCL1、BRN2、MYTL1、OCT4、KLF4、SOX2、MYC和MYOD。
17.如权利要求1-16中任一项所述的方法，其中相比于所述不同细胞类型的细胞，所述感兴趣的细胞具有至少一种心脏标志物的增加的表达。
18.如权利要求17所述的方法，其中所述至少一种心脏标志物选自ACTC1、MYL7、TNNT2、SCN5A、RYR2、NPPA和NPPB。
19.如权利要求1-18中任一项所述的方法，其中相比于所述不同细胞类型的细胞，所述感兴趣的细胞具有至少一种干细胞标志物的增加的表达。
20.如权利要求19所述的方法，其中所述至少一种干细胞标志物选自SSEA4和NANOG。
21.如权利要求1-20中任一项所述的方法，其中相比于所述不同细胞类型的细胞，所述感兴趣的细胞具有至少一种神经元特异性标志物的增加的表达。
22.如权利要求21所述的方法，其中所述至少一种神经元特异性标志物选自vGLUT2、GAD67、PVALB和SYN1。
23.如权利要求1-22中任一项所述的方法，其中所述降低至少一种屏障基因的表达水平包括使所述不同细胞类型的细胞与靶向所述至少一种屏障基因的至少一种siRNA分子接触。
24.如权利要求1-23中任一项所述的方法，其中所述不同细胞类型的细胞是体细胞。
25.如权利要求1-23中任一项所述的方法，其中所述感兴趣的细胞是体细胞。
26.如权利要求1-23中任一项所述的方法，还包括将所述不同细胞类型的细胞转化为诱导性多能干细胞(iPSC)状态。
27.一种药物组合物，包含选自ATF7IP、JUNB、ZNF207、Sp7、FOXA1、HEX...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种用于从不同细胞类型的细胞生成感兴趣的细胞的方法，包括相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，在所述不同细胞类型的细胞中降低至少一种屏障基因的表达水平，所述至少一种屏障基因选自atf7ip、junb、znf207、sp7、foxa1、hexim2、smarca5、sox15、chst2和nceh1；其中当所述至少一种屏障基因是atf7ip或sox15时，至少包括第二屏障基因。
2.一种用于从不同细胞类型的细胞生成感兴趣的细胞的方法，包括相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，在所述不同细胞类型的细胞中降低至少两种屏障基因的表达水平，所述至少两种屏障基因选自atf7ip、junb、znf207和sp7。
3.如权利要求1或2所述的方法，其中所述至少一种屏障基因包括atf7ip、junb和znf207。
4.如权利要求3所述的方法，其中所述至少一种屏障基因还包括sp7。
5.如权利要求1-4中任一项所述的方法，还包括相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，在所述不同细胞类型的细胞中增加至少一种重编程激动剂基因的表达水平。
6.如权利要求5所述的方法，其中所述至少一种重编程激动剂基因选自mef2c、hspb3、tpp1、emc1、ppic、il7r、olfml3、tcta和efhd1。
7.如权利要求1-6中任一项所述的方法，还包括增加至少一种谱系决定因子的表达水平。
8.如权利要求7所述的方法，其中在所述至少一种屏障基因的所述表达水平降低后72小时内所述至少一种谱系决定因子的所述表达水平增加。
9.如权利要求8所述的方法，其中在所述至少一种屏障基因的所述表达水平降低后48小时内所述至少一种谱系决定因子的所述表达水平增加。
10.如权利要求9所述的方法，其中在所述至少一种屏障基因的所述表达水平降低后24小时内所述至少一种谱系决定因子的所述表达水平增加。
11.如权利要求1-10中任一项所述的方法，其中所述不同细胞类型的细胞是成纤维细胞、内皮细胞或pbmc。
12.如权利要求1-11中任一项所述的方法，还包括相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，改变所述不同细胞类型的细胞的染色质结构。
13.如权利要求12所述的方法，其中相比于所述不同细胞类型的细胞的野生型细胞，所述不同细胞类型的细胞具有数量降低的与蛋白质结合的基序，所述蛋白质由所述至少一种屏障基因表达。
14.如权利要求13所述的方法，其中所述基序包括ap-1基序。
15.如权利要求1-14中任一项所述的方法，其中所述感兴趣的细胞是心肌细胞样细胞、心肌细胞、神经元、骨骼肌细胞或诱导性多能干细胞。
16.如权利要求7-15中任一项所述的方法，其中所述至少一种谱系决定因子选自mef2c、gata4、tbx5、ascl1、brn2、mytl1、oct4、klf4、sox2、myc和myod。
17.如权利要求1-16中任一项所述的方法，其中相比于所述不同细胞类型的细胞，所述感兴趣的细胞具有至少一种心脏标志物的增加的表达。
18.如权利要求17所述的方法，其中所述至少一种心脏标志物选自actc1、myl7、tnnt2、scn5a、ryr2、nppa和nppb。
19.如权利要求1-18中任一项所述的方法，其中相比于所述不同细胞类型的细胞，所述感兴趣的细胞具有至少一种干细胞标志物的增加的表达。
20.如权利要求19所述的方法，其中所述至少一种干细胞标志物选自ssea4和nanog。
21.如权利要求1-20中任一项所述的方法，其中相比于所述不同细胞类型的细胞，所述感兴趣的细胞具有至少一种神经元特异性标志物的增加的表达。
22.如权利要求21所述的方法，其中所述至少一种神经元特异性标志物选自vglut2、gad67、pvalb和syn1。
23.如权利要求1-22中任一项所述的方法，其中所述降低至少一种屏障基因的表达水平包括使所述不同细胞类型的细胞与靶向所述至少一种屏障基因的至少一种sirna分子接触。
24.如权利要求1-23中任一项所述的方法，其中所述不同细胞类型的细胞是体细胞。
25.如权利要求1-23中任一项所述的方法，其中所述感兴趣的细胞是体细胞。
26.如权利要求1-23中任一项所述的方法，还包括将所述不同细胞类型的细胞转化为诱导性多能干细胞(ipsc)状态。
27.一种药物组合物，包含选自atf7ip、junb、znf207、sp7、foxa1、hexim2、smarca5、sox15、chst2和nceh1的至少一种屏障基因的至少一种抑制剂，及药学上可接受的载剂或赋形剂；其中当所述至少一种屏障基因是atf7ip或sox15时，至少包括第二屏障基因的第二抑制剂。
28.一种药物组合物，包含选自atf7ip、junb、znf207和sp7的至少两种屏障基因的至少一种抑制剂，及药学上可接受的载剂或赋形剂。
29.如权利要求27或28所述的药物组合物，其中所述至少一种屏障基因包括atf7ip、junb和znf207。
30.如权利要求29所述的药物组合物，其中所述至少一种屏障基因还包括sp7。
31.如权利要求27-30中任一项所述的药物组合物，其中所述至少一种抑制剂包括靶向所述至少一种屏障基因的至少一种sirna分子。
32.一种用于修复或恢复有需要的对象中的受损组织的功能和结构完整性的方法，包括向所述对象施用有效量的如权利要求27-31中任一项所述的药物...
【专利技术属性】
技术研发人员：亚历山大·科拉斯，玛丽亚·阿苏拉·密西奈托，迈克尔·S·余，
申请(专利权)人：桑福德伯纳姆普利斯医学发现研究所，
类型：发明
国别省市：
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