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修饰的κ轻链-结合多肽制造技术

技术编号:41119034 阅读:2 留言:0更新日期:2024-04-25 14:08
本申请涉及与免疫球蛋白或其片段结合的多肽。更具体地说,它涉及具有高结合亲和力和改进的碱稳定性的κ轻链结合多肽。一种κ轻链结合包含消化链球菌属蛋白L的突变结合结构域,所述突变结合结构域来源于氨基酸序列SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17或SEQ ID NO:18中的任何一个,所述氨基酸序列具有N6H、N41H和N56Y或N56Q突变。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

本申请涉及与免疫球蛋白或其片段结合的多肽。更具体地说,它涉及具有高结合亲和力和改进的碱稳定性的κ轻链结合多肽。


技术介绍

1、免疫球蛋白和免疫球蛋白片段代表全世界生产或开发的最普遍的生物制药产品。对于这种特定治疗市场的高商业需求,以及由此其价值,已导致重点放在制药公司上,以使它们各自的生产过程的生产力最大化,同时控制相关的成本。

2、亲和色谱,通常在包含葡萄球菌蛋白a或其变体的基质上,通常被用作在完整免疫球蛋白分子的纯化中的关键步骤之一。蛋白a对免疫球蛋白的fc链的高选择性结合提供一个对杂质和污染物具有很高的清除作用的通用步骤。

3、对于抗体片段,例如fab、单链可变片段(scfv)、双-特异性t-细胞衔接子(bite)、结构域抗体等,其缺乏fc链但具有κ轻链1、3或4子类,包含源自大消化链球菌(peptostreptococcus magnus)的蛋白l的基质(blj.biol.chem.264,19740-19746,1989;w kastern et al:j.biol.chem.267,12820-12825,1992;b hknilsonet al:j.biol.chem.267,2234-2239,1992和30美国专利6,822,075)用作提供所需的高选择性的纯化平台。

4、蛋白l基质是可作为例如来自cytivatm的captotm l经商业获得的,并可被用来分离含κ轻链的蛋白例如完整抗体、fab片段、scfv片段、结构域抗体等。约75%的由健康人类产生的抗体具有κ轻链,并且约90%的治疗性单克隆抗体和抗体片段含有κ轻链(carter,p.,lazar,g.next generation antibody drugs:pursuit ofthe'high-hanging fruit'.nat rev drug discov 17,197–223(2018).https://doi.org/10.1038/nrd.2017.227)。

5、蛋白l是一种76–106kda的蛋白质,含有四个或五个高度同源的连续细胞外ig结合结构域,这取决于从中分离它的细菌菌株。大消化链球菌(peptostreptococcus magnus)菌株312中的蛋白l基因包含多个组分,包括18aa的信号序列、90aa的氨基末端区域,接着是5个同源的抗体结合结构域。在captotml产品中,配体由功能结构域b1-b4组成(wo 00/15803a1)。此外,大消化链球菌菌株3316产生同源的蛋白l,其由四个称为c1-c4的igg结合结构域组成。在genbank数据库中发现了另一种同源蛋白,被认为是“假定的蛋白”,在本文称为d结构域。

6、任何生物处理色谱应用需要全面注意污染物的明确去除。这样的污染物可以是例如在色谱程序中吸附于固定相或基质的非洗脱分子,例如非期望的生物分子或微生物,包括例如蛋白、碳水化合物、脂质、细菌和病毒。从基质去除这样的污染物通常在首次洗脱期望的产物后执行,以在后续使用之前再生基质。这样的去除通常涉及称为原位清洗(cip)的程序,其中使用能够从固定相洗脱污染物的试剂。一类常常与色谱介质一起使用的这样的试剂是碱性溶液,其在基质上通过。目前最广泛使用的清洁和消毒剂是naoh,并且理想的是以范围从0.05至最多例如1m的浓度使用,这取决于污染的程度和性质。然而,与例如蛋白a比较,蛋白l是一种对碱相当敏感的蛋白,并且以90%的剩余结合容量,使用15分钟接触时间,仅耐受15mm naoh 80个循环。由于树脂的容量损失,另外的较不理想的清洁溶液,例如尿素或胍鎓盐,也可能必须使用,以确保足够的清洁。

7、因此,本领域存在获得含有蛋白l-衍生的配体的分离基质的需要,所述配体对碱性清洁程序具有改进的稳定性。


技术实现思路

1、专利技术人的目标是提供具有高碱稳定性的蛋白l配体。专利技术人进一步的目标是提供至少保持亲和力和选择性的蛋白l配体。

2、通过提供一种κ轻链-结合多肽实现所述目标,该多肽由消化链球菌属(peptostreptococcus)蛋白l的至少一个突变结合结构域组成,基本上由消化链球菌属蛋白l的至少一个突变结合结构域组成,或包含消化链球菌属蛋白l的至少一个突变结合结构域,所述结构域与氨基酸序列seq id no:10、seq id no:11、seq id no:12、seq id no:13、seq id no:14、seq id no:15、seq id no:16、seq id no:17或seq id no:18中的任何一个具有至少90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的blosum矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3,并且其中相对于seq id no:10-18中的任何一个,所述多肽在位置6和41中每一个的天冬酰胺突变为组氨酸,并且在位置56的天冬酰胺突变为酪氨酸或谷氨酰胺。

3、消化链球菌属蛋白l的结合结构域与氨基酸序列seq id no:1、seq id no:2、seqid no:3、seq id no:4、seq id no:5、seq id no:6、seq id no:7或seq id no:8中的任何一个可具有至少90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的blosum矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3,并且其中相对于seq idno:1-4和6-9,所述多肽在位置10和45中每一个的天冬酰胺突变为组氨酸,并且在位置60的天冬酰胺突变为酪氨酸或谷氨酰胺;或

4、与seq id no:9具有至少90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的blosum矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3,并且其中相对于seq id no:5,所述多肽在位置9和44中每一个的天冬酰胺突变为组氨酸,并且在位置59的天冬酰胺突变为酪氨酸或谷氨酰胺。

5、消化链球菌属蛋白l的结合结构域可以选自b2结构域、b3结构域、b4结构域、c2结构域、c3结构域、c4结构域和d1结构域。优选地,消化链球菌属蛋白l的结合结构域选自b3结构域、c2结构域、c3结构域和d结构域。

6、所述结构域与序列seq id no:3、seq id no:6或seq id no:7中的任何一个可具有90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的blosum矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3。

7、c2结构域可以是其中另外地,在位置57的天冬酰胺已突变为酪氨酸或谷氨酰胺,例如酪氨酸的结构域。该结构域与seq id no:31或seq id no:32可具有90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的blosum矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3。

8、c3结构域可本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种κ轻链-结合多肽,其由消化链球菌属蛋白L的至少一个突变结合结构域组成,基本上由消化链球菌属蛋白L的至少一个突变结合结构域组成,或包含消化链球菌属蛋白L的至少一个突变结合结构域,

2.根据权利要求1所述的κ轻链-结合多肽,其中消化链球菌属蛋白L的结合结构域与氨基酸序列SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ IDNO:6、SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:8中的任何一个具有至少90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的BLOSUM矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3,并且其中相对于SEQ ID NO:1-4和6-9,所述多肽在位置10和45中每一个的天冬酰胺突变为组氨酸,并且在位置60的天冬酰胺突变为酪氨酸或谷氨酰胺;或

3.根据前述权利要求中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中消化链球菌属蛋白L的结合结构域选自B2结构域、B3结构域、B4结构域、C2结构域、C3结构域、C4结构域和D1结构域。

4.根据权利要求3所述的κ轻链-结合多肽,其中消化链球菌属蛋白L的结合结构域选自B3结构域、C2结构域、C3结构域和D结构域。

5.根据前述权利要求中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中所述结构域与序列SEQ IDNO:3、SEQ ID NO:6或SEQ ID NO:7中的任何一个具有90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的BLOSUM矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3。

6.根据权利要求3-5中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中所述C2结构域是其中另外地,在位置57的天冬酰胺已突变为酪氨酸或谷氨酰胺,例如酪氨酸(Y)的结构域。

7.根据前述权利要求中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中所述结构域与SEQ ID NO:31或SEQ ID NO:32具有90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的BLOSUM矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3。

8.根据权利要求3-5中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中所述C3结构域是其中另外地,在位置57的天冬酰胺已突变为酪氨酸或谷氨酰胺,例如酪氨酸,并且在位置39的天冬酰胺已突变为天冬氨酸的结构域。

9.根据权利要求1-5或8中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中所述结构域与SEQ IDNO:33或SEQ ID NO:34具有90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的BLOSUM矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3。

10.根据前述权利要求中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中所述多肽与序列SEQ IDNO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ IDNO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ IDNO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ IDNO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:48、SEQ IDNO:49、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ IDNO:55、SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:57、SEQ ID NO:58、SEQ ID NO:59或SEQ ID NO:60中的任何一个具有90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的BLOSUM矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3。

11.根据权利要求10所述的κ轻链-结合多肽,其中所述多肽与序列SEQ ID NO:21、SEQID NO:22、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:47、SEQID NO:48、SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55或SEQ ID NO:56中的任何一个具有90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种κ轻链-结合多肽,其由消化链球菌属蛋白l的至少一个突变结合结构域组成,基本上由消化链球菌属蛋白l的至少一个突变结合结构域组成,或包含消化链球菌属蛋白l的至少一个突变结合结构域,

2.根据权利要求1所述的κ轻链-结合多肽,其中消化链球菌属蛋白l的结合结构域与氨基酸序列seq id no:1、seq id no:2、seq id no:3、seq id no:4、seq id no:5、seq idno:6、seq id no:7或seq id no:8中的任何一个具有至少90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的blosum矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3,并且其中相对于seq id no:1-4和6-9,所述多肽在位置10和45中每一个的天冬酰胺突变为组氨酸,并且在位置60的天冬酰胺突变为酪氨酸或谷氨酰胺;或

3.根据前述权利要求中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中消化链球菌属蛋白l的结合结构域选自b2结构域、b3结构域、b4结构域、c2结构域、c3结构域、c4结构域和d1结构域。

4.根据权利要求3所述的κ轻链-结合多肽,其中消化链球菌属蛋白l的结合结构域选自b3结构域、c2结构域、c3结构域和d结构域。

5.根据前述权利要求中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中所述结构域与序列seq idno:3、seq id no:6或seq id no:7中的任何一个具有90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的blosum矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3。

6.根据权利要求3-5中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中所述c2结构域是其中另外地,在位置57的天冬酰胺已突变为酪氨酸或谷氨酰胺,例如酪氨酸(y)的结构域。

7.根据前述权利要求中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中所述结构域与seq id no:31或seq id no:32具有90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的blosum矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3。

8.根据权利要求3-5中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中所述c3结构域是其中另外地,在位置57的天冬酰胺已突变为酪氨酸或谷氨酰胺,例如酪氨酸,并且在位置39的天冬酰胺已突变为天冬氨酸的结构域。

9.根据权利要求1-5或8中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中所述结构域与seq idno:33或seq id no:34具有90%、95%或98%的序列同一性,或77.5%的序列相似性,如通过75的blosum矩阵确定的,其中空位开放罚分为12,空位延伸罚分为3。

10.根据前述权利要求中任一项所述的κ轻链-结合多肽,其中所述多肽与序列seq idno:21、seq id no:22、seq id no:23、seq id no:24、seq id no:25、seq id no:26、seq idno:27、seq id no:28、seq id no:29、seq id no:30、seq id no:35、seq id no:36、seq idno:37、seq id no:38、seq id no:39、seq id n...

【专利技术属性】
技术研发人员:M·安德尔J·嘉利A·L·琼松G·罗德里戈
申请(专利权)人:思拓凡生物工艺研发有限公司
类型:发明
国别省市:

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