System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种非编码RNA CsrB突变体、基因工程菌及应用制造技术_技高网

一种非编码RNA CsrB突变体、基因工程菌及应用制造技术

技术编号:40780405 阅读:3 留言:0更新日期:2024-03-25 20:24
本发明专利技术属于基因工程技术领域,具体涉及一种非编码RNA CsrB突变体、基因工程菌及应用。所述非编码RNA CsrB突变体是在Gene ID为2847719的大肠杆菌野生型非编码RNA CsrB基础上获得,至少将第178位t突变为a。对产岩藻糖基乳糖和/或唾液酸基乳糖的大肠杆菌基因工程菌中野生型非编码RNA CsrB进行突变,使其非编码RNA CsrB第178位t突变为a后,所获得的大肠杆菌基因工程菌岩藻糖基乳糖和/或唾液酸基乳糖的产量可得到进一步提高,具有更高的产业应用前景。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因工程,具体涉及一种非编码rna csrb突变体、基因工程菌及应用。


技术介绍

1、岩藻糖基乳糖(2'-岩藻糖基乳糖(2'-fucosyllactose,2'-fl)、3-岩藻糖基乳糖(3-fucosyllactose,3-fl))和唾液酸基乳糖(3'-唾液酸基乳糖(3'-sialyllactose,3'-sl)、6'-唾液酸基乳糖(6'-sialyllactose,6'-sl))是母乳低聚糖(human milkoligosaccharides,hmos)的重要成分,在调节肠道菌群、免疫力等方面发挥重要作用,具有广阔的市场前景。目前岩藻糖基乳糖和唾液酸基乳糖的生产方法包括化学合成法、酶合成法、微生物发酵法等。微生物发酵法具有环境友好、成本低等优势。大肠杆菌遗传背景清晰、代谢旺盛且增殖迅速,是微生物发酵法中常用的工程菌株。

2、本领域对岩藻糖基乳糖的从头合成途径和补救途径的关键酶、糖外排转运体等已有深入了解(zhu yy, et al. recent advances on 2'-fucosyllactose: physiologicalproperties, applications, and production approaches[j]. critical reviews infood science and nutrition, 2022, 62(8):2083-2092.),并通过对相关酶或转运体编码基因的基因编辑,考察了其对岩藻糖基乳糖发酵产率的影响。根据报道,敲除以下基因中的一种或多种:β-半乳糖苷酶编码基因 lacz、udp-葡萄糖脂质载体转移酶编码基因 wcaj、乳糖lac操纵子序列中的调节基因 laci、l-岩藻糖异构酶编码基因 fuci、l-墨角藻糖激酶编码基因 fuck、l-墨角藻糖-1-磷酸醛缩酶编码基因 fuca(ni zj, et al. multi-pathoptimization for efficient production of 2′-fucosyllactose in anengineered escherichia colic41 (de3) derivative[j]. frontiers inbioengineering and biotechnology, 2020, 8:611900.);和/或过表达以下基因的一种或多种:gdp-岩藻糖合成酶编码基因 wcag、gdp-甘露糖-4,6-脱水酶编码基因 gmd、β-半乳糖苷透性酶编码基因 lacy、磷酸甘露糖异构酶编码基因 mana、磷酸甘露糖变位酶编码基因 manb、糖外排转运体a编码基因 seta、甘露糖-1-磷酸鸟嘌呤转移酶编码基因 manc、l-阿拉伯糖异构酶编码基因 araa、鼠李糖异构酶编码基因 rhaa、2'-岩藻糖基乳糖合成酶编码基因 futc、l-岩藻糖激酶/gdp-l-岩藻糖焦磷酸化酶编码基因 fkp有利于提高岩藻糖基乳糖的发酵产率。由于α-(1,3)-岩藻糖基转移酶(futa)的低活性和不溶性表达,与2'-岩藻糖基乳糖相比,3-岩藻糖基乳糖的发酵产率较低。因此,进一步过表达或插入α-(1,3)-岩藻糖基转移酶编码基因 futa或对α-(1,3)-岩藻糖基转移酶编码基因 futa进行有益突变 ,更有利于提高3-岩藻糖基乳糖的发酵产率(yun hc, et al. biosynthesis of the human milkoligosaccharide 3‐fucosyllactose in metabolically engineered escherichia coli via the salvage pathway through increasing gtp synthesis and β‐galactosidasemodification[j]. biotechnology and bioengineering, 2019, 116(12):3324-3332.)。并且,本领域对唾液酸基乳糖的从头合成途径已有深入了解(zhu yy, et al. recentprogress on health effects and biosynthesis of two key sialylated human milkoligosaccharides, 3'-sialyllactose and 6'-sialyllactose[j]. biotechnologyadvances, 2023, 62:108058.),并通过对相关酶编码基因的基因编辑,考察了其对唾液酸基乳糖发酵产率的影响。根据报道,敲除以下基因中的一种或多种:β-半乳糖苷酶编码基因 lacz、乳糖lac操纵子序列中的调节基因 laci、n-乙酰神经氨酸裂解酶nana、n-乙酰神经氨酸:h+同转运体nant、n-乙酰甘露糖胺-6-磷酸2-庚二酸酶nane、n-乙酰甘露糖胺激酶nank;和/或过表达以下基因的一种或多种:udp-glcnac差向异构酶neuc、n-乙酰神经氨酸合酶neub、n-乙酰基神经氨酸胞苷酰转移酶neua、唾液酸转移酶siat,有利于提高唾液酸基乳糖的发酵产率。

3、csrb是大肠杆菌碳储存调控系统的一种新的非编码rna,是包含369个碱基的rna分子,在大肠杆菌中csrb结合18个csra蛋白(ashok k dubey, et al. rna sequence andsecondary structure participate in high-affinity csra-rna interaction[j].rna,2005 11(10):1579-1587.)。csra是一种转录后调节大肠杆菌中心碳通量、生物膜形成和运动的调控蛋白,激活菌体指数期的代谢途径,减缓菌体进入稳定期(suzuki k, et al.identification of a novel regulatory protein (csrd) that targets the globalregulatory rnas csrb and csrb for degradation by rnase e[j].genes&devel本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种非编码RNA CsrB突变体,其特征在于,所述非编码RNA CsrB突变体的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;或所述非编码RNA CsrB突变体的核苷酸序列对应于SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列至少第178位碱基为a,且与SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列具有至少90%之同源性。

2.一种产岩藻糖基乳糖和/或唾液酸基乳糖的基因工程菌,其特征在于,所述基因工程菌为大肠杆菌基因工程菌,所述大肠杆菌基因工程菌的基因组携带权利要求1所述的非编码RNA CsrB突变体核苷酸序列。

3.根据权利要求2所述的基因工程菌,其特征在于,所述大肠杆菌基因工程菌的基因组携带SEQ ID NO.1所示的非编码RNA CsrB突变体核苷酸序列。

4.根据权利要求2所述的基因工程菌,其特征在于,所述大肠杆菌基因工程菌为产岩藻糖基乳糖的大肠杆菌基因工程菌。

5.根据权利要求4所述的基因工程菌,其特征在于,所述岩藻糖基乳糖为2'-岩藻糖基乳糖、3-岩藻糖基乳糖中的任一种。

6.根据权利要求2所述的基因工程菌,其特征在于,所述大肠杆菌基因工程菌为产唾液酸基乳糖的大肠杆菌基因工程菌。

7.根据权利要求6所述的基因工程菌,其特征在于,所述唾液酸基乳糖为3'-唾液酸基乳糖、6'-唾液酸基乳糖中的任一种。

8.权利要求1所述非编码RNA CsrB突变体的应用,其特征在于,所述非编码RNA CsrB突变体用于提高大肠杆菌发酵制备岩藻糖基乳糖和/或唾液酸基乳糖的产量。

9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述岩藻糖基乳糖为2'-岩藻糖基乳糖、3-岩藻糖基乳糖中的任一种。

10.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述唾液酸基乳糖为3'-唾液酸基乳糖、6'-唾液酸基乳糖中的任一种。

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【技术特征摘要】

1.一种非编码rna csrb突变体,其特征在于,所述非编码rna csrb突变体的核苷酸序列如seq id no.1所示;或所述非编码rna csrb突变体的核苷酸序列对应于seq id no.1所示的核苷酸序列至少第178位碱基为a,且与seq id no.1所示的核苷酸序列具有至少90%之同源性。

2.一种产岩藻糖基乳糖和/或唾液酸基乳糖的基因工程菌,其特征在于,所述基因工程菌为大肠杆菌基因工程菌,所述大肠杆菌基因工程菌的基因组携带权利要求1所述的非编码rna csrb突变体核苷酸序列。

3.根据权利要求2所述的基因工程菌,其特征在于,所述大肠杆菌基因工程菌的基因组携带seq id no.1所示的非编码rna csrb突变体核苷酸序列。

4.根据权利要求2所述的基因工程菌,其特征在于,所述大肠杆菌基因工程菌为产岩藻糖基乳糖的大肠杆菌基因工程菌。

【专利技术属性】
技术研发人员:宗剑飞李庆刚李玉肖卫华路福平
申请(专利权)人:山东合成远景生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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