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利用旋转衬底上的弧形成像路径的测序系统和方法技术方案

技术编号:40504926 阅读:5 留言:0更新日期:2024-03-01 13:19
核酸测序系统(100)可包括耦合至旋转圆盘(201)的衬底(202)。该衬底(202)可包括多个核酸样本。检测系统(102)(例如包括物镜(104)和相机)在该衬底(202)在驱动系统(901)的作用下相对于检测系统(102)围绕垂直于衬底(202)表面的衬底(202)的旋转轴(304)旋转的同时可检测该衬底(202)上的测序事件。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

本公开涉及用于核酸测序和其他生化分析的系统。


技术介绍

1、核酸测序包括许多不同的成本,例如与购买和维护测序设备有关的成本。与现有测序装置相比,减少产生相同数量测序数据的时间可降低产生测序数据的总体成本。

2、目前可用的一些测序系统检测流动池基本上为矩形的二维平面衬底上的测序事件。光学检测系统的物镜和流动池沿着彼此相对的直线路径移动,从而使物镜的视场沿着平行路径在衬底上经过多次,其中每次经过都对衬底的一部分成像,从而对整个衬底成像。这些系统的缺点是,在成像流动池的整个衬底的所需的多次直线路径通过之间,需要减慢、停止和/或改变光学系统物镜相对于衬底的相对运动方向。这就导致在整个成像过程中,由于需要定位和控制系统组件的相对运动以恢复成像,衬底成像有一段时间无法进行。因此,需要减少或消除这种停机时间。


技术实现思路

1、本技术涉及检测测序事件的系统和方法。例如,这些系统和方法可用于对放置在衬底上的核酸分子进行测序,其中衬底可包括数百万至数十亿的单个核酸位点。衬底可形成或耦合至可旋转的圆盘上。圆盘可相对于检测系统的视场(fov)旋转和平移,例如光学检测系统的物镜,从而使视场以弧形路径(例如同心圆和/或螺旋路径)通过衬底,以便对整个衬底上的测序事件成像。所公开的用于检测测序事件的系统和方法的一个优点是,由于增加了成像系统的fov能够覆盖的衬底距离,同时对衬底上的测序事件进行连续成像,而不会减慢或停止fov和衬底之间的相对运动,从而提高了吞吐量,正如本文将要讨论的那样,大大节约了成本。

【技术保护点】

1.核酸测序系统,所述系统包括:

2.根据权利要求1所述的核酸测序系统,其中所述盖子包括中心开口。

3.根据权利要求2所述的核酸测序系统,其中所述衬底包括成像部分和非成像部分,其中所述盖子覆盖所述成像部分,并且所述中心开口与所述非成像部分的至少一部分对齐。

4.根据权利要求1-3中任一项所述的核酸测序系统,其中所述驱动系统还被配置为沿垂直于所述旋转轴的平移轴平移所述圆盘和衬底,以及

5.根据权利要求1-4中任一项所述的核酸测序系统,其中所述检测系统是包括至少一个物镜的光学检测系统。

6.根据权利要求5所述的核酸测序系统,其中所述至少一个物镜包括两个物镜,所述物镜被配置成在所述旋转轴的相对侧上成像所述衬底的部分。

7.根据权利要求1-6中任一项所述的核酸测序系统,其还包括:

8.根据权利要求7所述的核酸测序系统,其还包括:

9.根据权利要求8所述的核酸测序系统,其还包括控制系统,其中所述控制系统被配置为控制所述驱动系统从而旋转所述圆盘和衬底以及平移所述滑块以便所述物镜在所述衬底上成像一个或多个预定成像路径。

10.根据权利要求9所述的核酸测序系统,其中所述一个或多个预定成像路径包括围绕所述圆盘的圆周的一个或多个同心环。

11.根据权利要求9所述的核酸测序系统,其中所述一个或多个预定成像路径包括在所述衬底上围绕所述旋转轴缠绕多次的螺旋成像路径。

12.根据权利要求1-11中任一项所述的核酸测序系统,其还包括:

13.根据权利要求1-11中任一项所述的核酸测序系统,其还包括:

14.根据权利要求12或13中任一项所述的核酸测序系统,其中所述流体输送系统被配置为将流体输送到所述旋转轴附近从而所述衬底的旋转导致分发的所述流体流向所述衬底的周边并覆盖整个所述衬底。

15.根据权利要求12-14中任一项所述的核酸测序系统,其中所述流体输送系统被配置为通过所述中心开口输送流体至所述衬底上。

16.根据权利要求12-15中任一项所述的核酸测序系统,其中所述圆盘包括流体回收部分,所述流体回收部分被配置为排出由所述流体输送系统输送的流体。

17.根据权利要求16所述的核酸测序系统,其中所述流体输送系统包括用于捕获从所述回收部分排出的流体以重复使用所述流体的回收系统。

18.根据权利要求1-17中任一项所述的核酸测序系统,其中所述衬底包括离散间隔区域(″点″)的有序阵列,

19.根据权利要求18所述的核酸测序系统,其还包括:

20.根据权利要求19所述的核酸测序系统,其中固定在所述离散间隔区域上的所述核酸是DNB或PCR产物。

21.根据权利要求18-20中任一项所述的核酸测序系统,其中所述离散间隔区域的间距在所述衬底的外侧部分处大于在所述衬底的内侧部分处。

22.一种核酸测序方法,所述方法包括:

23.根据权利要求22所述的方法,其中检测测序事件是在所述衬底以恒定速度围绕所述旋转轴旋转至少一个完整循环的同时进行的。

24.根据权利要求22或23所述的方法,其中检测所述衬底上的测序事件包括:

25.根据权利要求22或23所述的方法,其中检测所述衬底上的测序事件包括:

...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.核酸测序系统,所述系统包括:

2.根据权利要求1所述的核酸测序系统,其中所述盖子包括中心开口。

3.根据权利要求2所述的核酸测序系统,其中所述衬底包括成像部分和非成像部分,其中所述盖子覆盖所述成像部分,并且所述中心开口与所述非成像部分的至少一部分对齐。

4.根据权利要求1-3中任一项所述的核酸测序系统,其中所述驱动系统还被配置为沿垂直于所述旋转轴的平移轴平移所述圆盘和衬底,以及

5.根据权利要求1-4中任一项所述的核酸测序系统,其中所述检测系统是包括至少一个物镜的光学检测系统。

6.根据权利要求5所述的核酸测序系统,其中所述至少一个物镜包括两个物镜,所述物镜被配置成在所述旋转轴的相对侧上成像所述衬底的部分。

7.根据权利要求1-6中任一项所述的核酸测序系统,其还包括:

8.根据权利要求7所述的核酸测序系统,其还包括:

9.根据权利要求8所述的核酸测序系统,其还包括控制系统,其中所述控制系统被配置为控制所述驱动系统从而旋转所述圆盘和衬底以及平移所述滑块以便所述物镜在所述衬底上成像一个或多个预定成像路径。

10.根据权利要求9所述的核酸测序系统,其中所述一个或多个预定成像路径包括围绕所述圆盘的圆周的一个或多个同心环。

11.根据权利要求9所述的核酸测序系统,其中所述一个或多个预定成像路径包括在所述衬底上围绕所述旋转轴缠绕多次的螺旋成像路径。

12.根据权利要求1-11中任一项所述的核酸测序系统,其还包括:

13.根据权利要求1-11中任一项所述的核酸测序系统,其还包括:

【专利技术属性】
技术研发人员:保罗·伦德奎斯特颜景堂安德里·茨普里克梁埈模乔恩·巴特曼拉兹万·基里塔杰·雪弗托米歇尔·贾雷尔王薇克拉克·雷耶斯
申请(专利权)人:深圳华大智造科技股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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