System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 一种基于荧光PCR熔解曲线分析技术检测UGT1A1基因双位点多态性的试剂盒及检测方法技术_技高网

一种基于荧光PCR熔解曲线分析技术检测UGT1A1基因双位点多态性的试剂盒及检测方法技术

技术编号:40378367 阅读:9 留言:0更新日期:2024-02-20 22:17
本发明专利技术公开了一种基于荧光PCR熔解曲线分析技术检测UGT1A1基因双位点多态性的试剂盒及检测方法,涉及UGT1A1*28和UGT1A1*6位点的检测。检测试剂盒设有盒体、白色盖八连管分装的冻干试剂条、红色盖八连管分装的冻干阳性对照试剂条、绿色盖八连管分装的冻干阴性对照试剂条、备用8连管管盖。将白色盖八连管分装的冻干试剂条8条、红色盖八连管分装的冻干阳性对照试剂条2条、绿色盖八连管分装的冻干阴性对照试剂条2条、8条备用8连管管盖设在盒体内,即得一种基于荧光PCR熔解曲线分析技术检测UGT1A1基因双位点多态性的试剂盒。其方法区分UGT1A1*28和UGT1A1*6位点的野生型、杂合突变型、纯合突变型,具有操作简便、检测周期短、通量高、特异性好的优点,适合大规模临床开展。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及基因检测领域,具体为一种基于荧光pcr熔解曲线分析技术检测ugt1a1基因双位点多态性的试剂盒及检测方法。


技术介绍

1、伊立替康是(irenotecan,cpt-11)是喜树碱半合成衍生物,在体内经羟酸酯酶水解成7-乙基-10-羟基喜树碱(sn-38),sn-38是dna拓扑异构酶i的抑制剂,作用于细胞周期s期,抑制、干扰dna修复和转录,阻止或减缓肿瘤细胞生长。伊立替康主要用于治疗成人晚期/转移性大肠癌,对小细胞和非小细胞肺癌及宫颈癌和卵巢癌亦有疗效。然而,伊立替康引起的中性粒细胞减少及迟发性腹泻,成为限制其用药剂量的关键因素之一,这两种副作用均是剂量限制性毒副反应,严重时可能导致患者死亡。

2、研究结果显示,伊立替康的毒性主要是由其活性代谢产物sn-38引起的。sn-38主要与血浆蛋白结合,在发挥完抗肿瘤作用后,活性sn-38通过位于肝脏的尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶1a1(ugt1a1)的催化作用而转变为无活性的sn-38g,后者再通过尿液、胆汁排出,从而保护健康细胞免受细胞毒性的影响。

3、ugt1a1的多态性与伊立替康不良反应具有密切相关性。该基因的多态性常发生在启动子区,表现为ta重复的个数不同,正常野生型有6个ta重复序列,称为ugt1a1*1。变异后,ta重复的数目发生变化,可以产生5个ta、7个ta或8个ta的重复,分别称为ugt1a1*36、ugt1a1*28、ugt1a1*37。其中ugt1a1*28多态性最常见,包括纯合突变型*28/*28(ta7/ta7)和杂合突变型*1/*28(ta6/ta7),ugt1a1*36和ugt1a1*37多态性少见,几乎只出现在非洲人群。野生型*1/*1(ta6/ta6)在接受伊立替康治疗时产生毒副作用风险较低,而ugtial*28杂合突变型*1/*28(ta6/ta7)产生毒副作用的几率为12.5%,纯合突变型*28/*28(ta7/ta7)则有50%产生毒副作用的可能性。在亚洲人中,野生型*1/*1(ta6/ta6)、杂合突变型*1/*28(ta6/ta7)和纯合突变型*28/*28(ta7/ta7)的发生频率分别为70.2%、27.7%和2.1%。除启动子区外,研究发现该基因第1外显子211位会发生g>a的突变,这一等位基因型也被称为ugt1a1*6,位点野生型为g/g,杂合突变型为g/a,纯合突变型为a/a。亚洲人群中,g/a和a/a携带者在伊立替康治疗中,发生3-4级中性粒细胞减少和非血液学毒性的风险显著提高,ugt1a1*6型突变在亚洲人群中的携带比例高达13-23%。

4、综上所述,通过检测ugt1a1*28和ugt1a1*6位点的多态性,可以从基因水平上预测患者对伊立替康的不良反应,对制定临床个体化化疗方案具有重要意义。

5、目前,ugt1a1基因多态性检测的方法主要有直接测序法、聚合酶链反应限制性片段长度多态性分析(pcr-rflp)法、等位基因特异性pcr(as-pcr)法、基因芯片法等。直接测序法是基因多态性检测最常见的方法,也是基因多态性位点检测的金标准,但该方法存在测序实验操作较为复杂、实验周期较长、工作量大的缺点,不适合于做大量样本的检测。pcr-pflp法依赖限制性内切酶消化、电泳分析等原因,往往出现结果误判现象,影响其检测准确率,另外其检测周期长、通量较低,亦不适用于大量人群的快速筛选。as-pcr根据snp位点的碱基差异设计特异性引物从而检测出突变,方法简便、快捷、费用低廉,但假阳性率较高,对实验条件要求严格。基因芯片快速准确、灵敏度高,缺点是价格昂贵,且无法同时处理大量样本。


技术实现思路

1、(一)解决的技术问题

2、针对现有技术的不足,本专利技术提供了一种基于荧光pcr熔解曲线分析技术检测ugt1a1基因双位点多态性的试剂盒及检测方法。

3、(二)技术方案

4、为实现上述目的,本专利技术提供如下技术方案:一种基于荧光pcr熔解曲线分析技术检测ugt1a1基因双位点多态性的试剂盒,包括针对ugt1a1*28和ugt1a1*6位点的特异性扩增引物和荧光标记探针;

5、引物及探针序列为:

6、

7、本专利技术改进有,*标记碱基为硫代修饰,探针的前三个碱基为保护碱基,不是与模板特异结合的序列。

8、本专利技术改进有,探针5’端的荧光基团为fam,3’端的粹灭基团为bhq1。

9、本专利技术改进有,探针5’端的荧光基团可替换为rox、hex、cy5、cy3、vic、texas red或tet;3’端的粹灭基团可替换为bhq2、bhq3或mgb;荧光基团和粹灭基团的位置可以互换。

10、本专利技术进一步提供一种基于荧光pcr熔解曲线分析技术检测ugt1a1基因双位点多态性的检测方法,包括以下步骤:

11、步骤1、提取待测样本的基因组dna,要求浓度大于2ng/μl,od260nm/od280nm=1.7~2.0,总量大于80μl;

12、步骤2、试剂准备,每次检测前取检测试剂ugt1a1*28标记孔数为检测样数、取检测试剂ugt1a1*6标记孔数为检测样数、取阳性对照试剂ugt1a1*28标记孔1孔、取阳性对照试剂ugt1a1*6标记孔1孔、取阴性对照试剂ugt1a1*28标记孔1孔、取阴性对照试剂ugt1a1*6标记孔1孔;

13、步骤3、样本加样,在和ugt1a1*6标记孔中计入提取的基因组dna20μl每孔;

14、步骤4、阳性对照加样,在阳性对照试剂条ugt1a1*28标记孔和ugt1a1*6标记孔中加入超纯水20μl每孔;

15、步骤5、阴性对照加样,在阴性对照试剂条ugt1a1*28标记孔和ugt1a1*6标记孔中加入超纯水20μl每孔;

16、步骤6、加盖、混匀、离心,检测试剂条、阳性对照试剂条、阴性对照试剂条加样后用备用pcr 8连管盖加盖,震荡混匀10s,离心10s;

17、步骤7、上机检测,进行pcr扩增反应及熔解曲线分析;

18、步骤8、结果判读,在质控结果符合预期的前提下,根据熔解曲线进行结果判定,并根据熔解峰和tm值来判断结果;

19、其中:

20、试剂为冻干剂pcr反应试剂:

21、所述ugt1a1*28检测的冻干粉由0.4μl ugt1a1*28-f(1μm)、0.4μlugt1a1*28-r(10μm)、0.2μl ugt1a1*28-probe(10μm)、4μl 5×pcr buffer、0.48μl taq酶(5u/μl)、5μl冻干保护剂、9.52μl超纯水混合冻干而来,检测时加20uldna模板;

22、所述ugt1a1*6检测的冻干粉由0.4μl ugt1a1*6-f(1μm)、0.4μlugt1a1*6-r(10μm)、0.2μl ugt1a1*6-probe(10μm)、4μl 5×pcr本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于荧光PCR熔解曲线分析技术检测UGT1A1基因双位点多态性的试剂盒,其特征在于,包括针对UGT1A1*28和UGT1A1*6位点的特异性扩增引物和荧光标记探针;

2.根据权利要求1所述的一种基于荧光PCR熔解曲线分析技术检测UGT1A1基因双位点多态性的试剂盒,其特征在于,其设有盒体、盒盖、白色盖八连管分装的冻干试剂条、红色盖八连管分装的冻干阳性对照试剂条、绿色盖八连管分装的冻干阴性对照试剂条;所述盒盖设在盒体上;盒体内有标准的8*12共96孔PCR管放置孔可放置12条8连管试剂条;8条白色盖八连管分装的冻干试剂条、2条红色盖八连管分装的冻干阳性对照试剂条、2条绿色盖八连管分装的冻干阴性对照试剂条分别插入盒体标准的8*12共96孔PCR管放置孔上;所述试剂条为冻干剂试剂装在0.2ml白色透明8连PCR管内后盖上不同颜色的盖子区分不同试剂分类,所述试剂条的盖子上标注UGT1A1*28或UGT1A1*6区分试剂检测位点;不同颜色的盖子具体为白色盖试剂条为检测试剂、红色盖试剂条为阳性对照试剂、绿色盖试剂条为阴性对照试剂;

3.根据权利要求1所述的一种基于荧光PCR熔解曲线分析技术检测UGT1A1基因双位点多态性的试剂盒,其特征在于:所述探针UGT1A1*28-Probe和UGT1A1*6-Probe还包括5’端不与模板特异结合的随机保护碱基,UGT1A1*28-Probe的5’端的保护碱基是*c*aa,UGT1A1*6-Probe的5’端保护碱基*T*AC,*标记碱基为硫代修饰,这三个碱基可更换为其他不与模板结合的随机碱基序列。

4.根据权利要求1所述的一种基于荧光PCR熔解曲线分析技术检测UGT1A1基因双位点多态性的试剂盒,其特征在于:所述的荧光基团包括:FAM、ROX、HEX、Cy5、Cy3、VIC、TexasRed、TET,3’端的粹灭基团包括:BHQ1、BHQ2、BHQ3、MGB;

5.一种基于荧光PCR熔解曲线分析技术检测UGT1A1基因双位点多态性的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

6.根据权利要求5所述的一种基于荧光PCR熔解曲线分析技术检测UGT1A1基因双位点多态性的检测方法,其特征在于,上机检测PCR扩增和熔解曲线分析程序如下:

...

【技术特征摘要】

1.一种基于荧光pcr熔解曲线分析技术检测ugt1a1基因双位点多态性的试剂盒,其特征在于,包括针对ugt1a1*28和ugt1a1*6位点的特异性扩增引物和荧光标记探针;

2.根据权利要求1所述的一种基于荧光pcr熔解曲线分析技术检测ugt1a1基因双位点多态性的试剂盒,其特征在于,其设有盒体、盒盖、白色盖八连管分装的冻干试剂条、红色盖八连管分装的冻干阳性对照试剂条、绿色盖八连管分装的冻干阴性对照试剂条;所述盒盖设在盒体上;盒体内有标准的8*12共96孔pcr管放置孔可放置12条8连管试剂条;8条白色盖八连管分装的冻干试剂条、2条红色盖八连管分装的冻干阳性对照试剂条、2条绿色盖八连管分装的冻干阴性对照试剂条分别插入盒体标准的8*12共96孔pcr管放置孔上;所述试剂条为冻干剂试剂装在0.2ml白色透明8连pcr管内后盖上不同颜色的盖子区分不同试剂分类,所述试剂条的盖子上标注ugt1a1*28或ugt1a1*6区分试剂检测位点;不同颜色的盖子具体为白色盖试剂条为检测试剂、红色盖试剂条为阳性对照试剂、绿色盖试剂条为阴性对照试剂;

3.根据权...

【专利技术属性】
技术研发人员:连加辨梁耀极王云铃夏璐李珣赵燕燕
申请(专利权)人:厦门大学附属第一医院厦门市第一医院厦门市红十字会医院厦门市糖尿病研究所
类型:发明
国别省市:

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