System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind()
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物技术和核酸药物领域,具体地,涉及一种优化的5'utr序列及其应用。
技术介绍
1、基于mrna的治疗方法,在实际应用中较为精准且可用于个体化治疗,因此是现代医学发展的新方向。与哺乳动物细胞系中表达的重组蛋白相比,mrna的生产更快、更灵活。在过去十年中,mrna修饰和递送系统领域的技术发展迅速推进了mrna疫苗的基础和临床研究。然而,mrna疗法面临的技术问题也很明显,比如mrna在体内表达效率低等问题,mrna疫苗的保护效力并不乐观,这些也是临床应用亟需优化的关键问题。
2、基于稳定性和蛋白翻译效率而优化开发的mrna,可以最大限度地提高mrna生产及避免递送中的损失问题。5'utr在mrna翻译过程中至关重要,包括核糖体募集,扫描和起始密码子选择。5'utr序列长度一般在100-200核苷酸。carsten rudolph等在一项研究中比较了5个不同的utr序列对于mrna稳定性和翻译效率的影响,结果显示人细胞cyba utr序列可以在不影响rna半衰期的情况下增强翻译效率。有研究发现双拷贝beta globin 3'utr序列在树突细胞中支持蛋白的高效表达。在过往研究中使用到的utr序列包括:来自cmv(cytomegalovirus,人类巨噬细胞病毒)的增强子序列,人α-珠蛋白(alpha-globin)5'utr、人生长激素utr序列、非洲爪蟾蜍β-珠蛋白(beta-globin)utr等。utr对于mrna翻译效率的影响不仅与细胞类型有关,而且高度依赖二级结构。相对较短的设计utr能更好
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供能够提高蛋白编码区翻译效率的5`-utr序列及其在制备mrna药物中的应用。
2、本专利技术的第一方面,提供了一种5`utr元件,所述5`utr元件用于构建mrna转录模板,提高所述mrna转录模板转录得到的mrna中编码区的翻译效率,所述5`-utr元件的核苷酸序列如seq id no: 1所示。
3、在另一优选例中,所述5`utr元件的核苷酸序列还包括:
4、与seq id no: 1所示序列的同源性≥70%(较佳地≥80%,更佳地≥90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%或99%),且具有提高mrna中编码区翻译效率活性的核苷酸序列;或
5、如seq id no: 1所示核苷酸序列的5`端和/或3`端增加和/或减少1-50个(较佳地1-30,更佳地1-10个,更佳地1-5个)核苷酸,且具有提高mrna中编码区翻译效率活性的核苷酸序列。
6、在另一优选例中,所述5`utr元件的长度为40-120nt,较佳地50-100nt。
7、本专利技术的第二方面,提供了一种mrna转录模板构建体,所述构建体具有式i结构:
8、z1-z2-z3-z4-z5-z6-z7 (i)
9、式中,
10、z1、z7为无或酶切位点;
11、z2为无或启动子元件或内部核糖体进入位点序列(ires);
12、z3为本专利技术第一方面所述的5`utr元件;
13、z4为可替换的编码区;
14、z5为3`utr元件;
15、z6为无或polya尾部元件。
16、在另一优选例中,所述z1、z7为平末端酶切位点或粘性末端酶切位点。
17、在另一优选例中,所述mrna转录模板构建体包括酶切位点、启动子元件、5`utr元件、可替换的编码区和3`utr。
18、在另一优选例中,所述z2为启动子元件,所述启动子选自下组:t7启动子、t3启动子、sp6启动子、cag启动子、ubc启动子、cmv启动子、u6启动子、ef1a启动子、pgk1启动子、tre启动子、ac5启动子、uas启动子、sv40启动子、adh1启动子、camv35s启动子、ubi启动子、lac启动子、ptac启动子、pl启动子,或其组合。
19、在另一优选例中,所述z3具有如seq id no: 1所示的核苷酸序列。
20、在另一优选例中,所述z4为用于预防和/或治疗传染性疾病、罕见遗传病、神经退行性疾病、视网膜病变、癌症或肿瘤的蛋白编码基因。
21、在另一优选例中,所述z4选自下组:病原体抗原基因、基因组中的转座子(包括沉默和活跃转座子)、细胞因子、生长因子、蛋白激素、多肽激素、肿瘤相关抗原(taa)、肿瘤特异性抗原(tsa)、通用肿瘤突变位点抗原、蛋白佐剂、多肽佐剂、核酸佐剂,或其组合。
22、在另一优选例中,所述z5与z3来源于同一转录本。
23、在另一优选例中,所述z5与z3来源于不同转录本。
24、在另一优选例中,所述z5的核苷酸序列如seq id no: 5所示。
25、本专利技术的第三方面,提供了一种载体,所述载体含有如本专利技术第二方面所述的mrna转录模板构建体。
26、在另一优选例中,所述载体选自下组:dna、rna、病毒载体、质粒、转座子、其他基因转移系统,或其组合;优选地,所述载体为质粒。
27、本专利技术的第四方面,提供了一种宿主细胞,所述宿主细胞含有如本专利技术第三方面所述的载体。
28、在另一优选例中,所述的宿主细胞包括原核细胞或真核细胞。
29、在另一优选例中,所述的宿主细胞选自下组:大肠杆菌、酵母细胞、哺乳动物细胞。
30、本专利技术的第五方面,提供了一种产生用于制备mrna药物的优化mrna的方法,所述方法包括步骤:
31、(i) 在适合的条件下,培养如本专利技术第四方面所述的宿主细胞,从而获得含有mrna转录模板构建体的载体的培养物;
32、(ii) 从所述培养物中分离和/或回收(i)中所述载体,并酶切线性化为mrna转录模板;和
33、(iii) 将(ii)中所述mrna转录模板进行转录,从而获得所述优化mrna。
34、在另一优选例中,所述方法还包括步骤(iv):对步骤(iii)获得的优化mrna进行纯化和/或修饰。
35、本专利技术的第六方面,提供了一种优化mrna,所述优化mrna是用如本专利技术第五方面所述的方法制备得到的,并且所述优化mrna具有式ii所示结构:
36、m1-m2-m3-m4-m5-m6 (ii)
37、式中,
38、m1为5`端帽子元件;
39、m2为无或内部核糖体进入位点序列(ires);
40、m3为本专利技术第一方面所述的5`utr元件;
41、m4为可替换的编码区;
42、m5为3`utr元件;本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种5`UTR元件,所述5`UTR元件用于构建mRNA转录模板,提高所述mRNA转录模板转录得到的mRNA中编码区的翻译效率,其特征在于,所述5`-UTR元件的核苷酸序列如SEQ IDNO: 1所示,或与SEQ ID NO: 1所示的核苷酸序列具有≥70%的同源性。
2. 一种mRNA转录模板构建体,其特征在于,所述构建体具有式I结构:
3.一种载体,其特征在于,所述载体含有如权利要求2所述的mRNA转录模板构建体。
4.一种宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞含有如权利要求3所述的载体。
5.一种产生用于制备mRNA药物的优化mRNA的方法,所述方法包括步骤:
6. 一种优化mRNA,所述优化mRNA是用如权利要求5所述的方法制备得到的,并且所述优化mRNA具有式II所示结构:
7. 一种药物组合物,所述药物组合物包含:
8.如权利要求7所述的药物组合物,其特征在于,所述药物组合物是将所述mRNA用阳离子脂进行包裹所形成的脂质纳米颗粒。
9.一种如权利要求1所述的5`UTR元件的用
10.一种如权利要求6所述的优化mRNA或如权利要求7所述的药物组合物的用途,用于制备一药物,所述药物用于预防和/或治疗传染性疾病、罕见遗传病、神经退行性疾病、视网膜病变、癌症或肿瘤。
...【技术特征摘要】
1.一种5`utr元件,所述5`utr元件用于构建mrna转录模板,提高所述mrna转录模板转录得到的mrna中编码区的翻译效率,其特征在于,所述5`-utr元件的核苷酸序列如seq idno: 1所示,或与seq id no: 1所示的核苷酸序列具有≥70%的同源性。
2. 一种mrna转录模板构建体,其特征在于,所述构建体具有式i结构:
3.一种载体,其特征在于,所述载体含有如权利要求2所述的mrna转录模板构建体。
4.一种宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞含有如权利要求3所述的载体。
5.一种产生用于制备mrna药物的优化mrna的方法,所述方法包括步骤:
6. 一种优...
【专利技术属性】
技术研发人员:王筱,李和,张园园,谷翰卿,徐增军,
申请(专利权)人:艾斯拓康医药科技北京有限公司,
类型:发明
国别省市:
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。