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5`-UTR序列及其应用制造技术

技术编号:40968218 阅读:4 留言:0更新日期:2024-04-18 20:49
本发明专利技术提供了能够提高蛋白编码区翻译效率的5`‑UTR序列及其应用。本发明专利技术的5`‑UTR序列能够提高蛋白编码区的翻译效率,进而降低mRNA药物剂量、降低递送系统带来的潜在副作用,用于mRNA药物的制备。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物技术和核酸药物领域,具体地,涉及能够提高蛋白编码区翻译效率的5`-utr序列及其应用。


技术介绍

1、基于mrna的治疗方法,在实际应用中较为精准且可用于个体化治疗,因此是现代医学发展的新方向。与哺乳动物细胞系中表达的重组蛋白相比,mrna的生产更快、更灵活。在过去十年中,mrna修饰和递送系统领域的技术发展迅速推进了mrna疫苗的基础和临床研究。然而,mrna疗法面临的技术问题也很明显,比如mrna在体内表达效率低等问题,mrna疫苗的保护效力并不乐观,这些也是临床应用亟需优化的关键问题。

2、基于稳定性和蛋白翻译效率而优化开发的mrna,可以最大限度地提高mrna生产及避免递送中的损失问题。5`utr在mrna翻译过程中至关重要,包括核糖体募集、扫描和起始密码子选择。5`utr序列长度一般在100-200核苷酸。carsten rudolph等在一项研究中比较了5个不同的utr序列对于mrna稳定性和翻译效率的影响,结果显示人细胞cybautr序列可以在不影响rna半衰期的情况下增强翻译效率。有发现双拷贝beta globin 3`-utr序列在树突细胞中支持蛋白的高效表达。在过往研究中使用到的utr序列包括:来自cmv(cytomegalovirus,人类巨噬细胞病毒)的增强子序列,人alpha-globin(α-珠蛋白)5`utr、人生长激素utr序列、非洲爪蟾蜍beta-globin(β-珠蛋白)utr等。utr对于mrna翻译效率的影响不仅与细胞类型有关,而且高度依赖二级结构。相对较短的设计utr能更好的完成预设目的,设计出最短的utr序列是非常有必要的,既可以免受细胞类型差异的影响,又能够在插入修饰核苷酸时使其对翻译效率的影响降至最弱。


技术实现思路

1、本专利技术的目的在于提供能够提高蛋白编码区翻译效率的5`-utr序列及其在制备mrna药物中的应用。

2、本专利技术的第一方面,提供了一种5`-utr元件,所述5`-utr元件用于构建mrna转录模板,提高所述mrna转录模板转录得到的mrna中编码区的翻译效率,所述5`-utr元件的核苷酸序列选自下组:

3、(a)如seq id no:1-4中任一项所示的核苷酸序列;

4、(b)与seq id no:1-4中任一项所示序列的同源性≥70%(较佳地≥80%,更佳地≥90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%或99%),且具有提高mrna中编码区翻译效率活性的核苷酸序列;或

5、(c)如seq id no:1-4中任一项所示核苷酸序列的5`端和/或3`端增加和/或减少1-50个(较佳地1-30,更佳地1-10个,更佳地1-5个)核苷酸,且具有提高mrna中编码区翻译效率活性的核苷酸序列。

6、在另一优选例中,所述5`-utr元件的长度为20-100nt,较佳地25-90nt。

7、在另一优选例中,所述5`-utr元件为mdm2基因的5`-utr。

8、在另一优选例中,所述5`-utr元件的核苷酸序列为mdm2基因的5`-utr的野生型序列,如seq id no:1所示。

9、在另一优选例中,所述5`-utr元件的核苷酸序列为mdm2基因的5`-utr的人工改造序列。

10、在另一优选例中,所述mdm2基因的5`-utr序列的人工改造序列如seq id no:2所示。

11、在另一优选例中,所述5`-utr元件的核苷酸序列为与seq id no:1或2所示序列的同源性≥70%(较佳地≥80%,更佳地≥90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%或99%),且具有提高mrna中编码区翻译效率活性的核苷酸序列。

12、在另一优选例中,所述5`-utr元件的核苷酸序列为如seq id no:1或2所示核苷酸序列的5`端和/或3`端增加和/或减少1-50个(较佳地1-30,更佳地1-10个,更佳地1-5个)核苷酸,且具有提高mrna中编码区翻译效率活性的核苷酸序列。

13、在另一优选例中,所述5`-utr元件为p16基因的5`-utr。

14、在另一优选例中,所述5`-utr元件的核苷酸序列为p16基因的5`-utr的野生型序列,如seq id no:3所示。

15、在另一优选例中,所述5`-utr元件的核苷酸序列为p16基因的5`-utr的人工改造序列。

16、在另一优选例中,所述p16基因的5`-utr序列的人工改造序列如seq id no:4所示。

17、在另一优选例中,所述5`-utr元件的核苷酸序列为与seq id no:3或4所示序列的同源性≥70%(较佳地≥80%,更佳地≥90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%或99%),且具有提高mrna中编码区翻译效率活性的核苷酸序列。

18、在另一优选例中,所述5`-utr元件的核苷酸序列为如seq id no:3或4所示核苷酸序列的5`端和/或3`端增加和/或减少1-50个(较佳地1-30,更佳地1-10个,更佳地1-5个)核苷酸,且具有提高mrna中编码区翻译效率活性的核苷酸序列。

19、在另一优选例中,所述5`-utr元件含有用于增强翻译活性的序列元件。

20、在另一优选例中,所述用于增强翻译活性的序列元件具有如seq id no:12(gccacc)所示的核苷酸序列。

21、本专利技术的第二方面,提供了一种mrna转录模板构建体,所述构建体具有式i结构:

22、z1-z2-z3-z4-z5-z6-z7                 (i)

23、式中,

24、z1、z7为无或酶切位点;

25、z2为无或启动子元件或无核糖体入核位点序列(ires);

26、z3为本专利技术第一方面所述的5`-utr元件;

27、z4为可替换的编码区;

28、z5为3`-utr元件;

29、z6为无或polya尾部元件。

30、在另一优选例中,所述z1、z6为平末端酶切位点或粘性末端酶切位点。

31、在另一优选例中,所述mrna转录模板构建体包括酶切位点、启动子元件、5`-utr元件、可替换的编码区和3`-utr。

32、在另一优选例中,所述z2为启动子,所述启动子选自下组:t7启动子、t3启动子、sp6启动子、cag启动子、ubc启动子、cmv启动子、u6启动子、ef1a启动子、pgk1启动子、tre启动子、ac5启动子、uas启动子、sv40启动子、adh1启动子、camv35s启动子、ubi启动子、lac启动子、ptac启动子、pl启动子,或其组合。

33、在另一优选例中,所述z3选自下组:如seq id no:1-4中任一项所示的核苷本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种5`-UTR元件,其特征在于,所述5`-UTR元件用于构建mRNA转录模板,提高所述mRNA转录模板转录得到的mRNA中编码区的翻译效率,所述5`-UTR元件的核苷酸序列选自下组:

2.一种mRNA转录模板构建体,其特征在于,所述构建体具有式I结构:

3.一种载体,其特征在于,所述载体含有如权利要求2所述的mRNA转录模板构建体。

4.一种宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞含有如权利要求3所述的载体。

5.一种产生用于制备mRNA药物的优化mRNA的方法,所述方法包括步骤:

6.一种优化mRNA,其特征在于,所述优化mRNA是用如权利要求5所述的方法制备得到的,并且所述优化mRNA具有式II所示结构:

7.一种药物组合物,其特征在于,所述药物组合物包含:

8.一种mRNA药物组合物的制备方法,其特征在于,所述方法包括:将如权利要求6所述的优化mRNA与药学上可接受的载体混合,从而获得所述mRNA药物组合物。

9.一种如权利要求1所述的5`-UTR元件的用途,用于构建mRNA转录模板,从而提高所述mRNA转录模板转录得到的mRNA中编码区的翻译效率。

10.一种如权利要求6所述的优化mRNA或如权利要求7所述的药物组合物的用途,用于制备一药物,所述药物用于预防和/或治疗传染性疾病、罕见遗传病、神经退行性疾病、视网膜病变、癌症或肿瘤。

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【技术特征摘要】

1.一种5`-utr元件,其特征在于,所述5`-utr元件用于构建mrna转录模板,提高所述mrna转录模板转录得到的mrna中编码区的翻译效率,所述5`-utr元件的核苷酸序列选自下组:

2.一种mrna转录模板构建体,其特征在于,所述构建体具有式i结构:

3.一种载体,其特征在于,所述载体含有如权利要求2所述的mrna转录模板构建体。

4.一种宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞含有如权利要求3所述的载体。

5.一种产生用于制备mrna药物的优化mrna的方法,所述方法包括步骤:

6.一种优化mrna,其特征在于,所述优化mrna是用如权利要求5所述的方法制备得到...

【专利技术属性】
技术研发人员:请求不公布姓名李和韩斌斌张园园谷翰卿田晓辉刘璐璐刘月娥贾福浩王筱张慧聪
申请(专利权)人:艾斯拓康医药科技北京有限公司
类型:发明
国别省市:

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