【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种检测茄科植物病原体的方法，具体涉及一种枸杞质型弹状病毒a的检测引物及方法，属于植物病害诊断。
技术介绍
1、枸杞(lycium sp.)是一种茄科(solanaceae)灌木植物，枸杞子是宁夏枸杞(l.barbarum l.)的干燥成熟果实，地骨皮是枸杞(l.chinense mill.)或宁夏枸杞的干燥根皮，是我国传统中药材，具有改善视力和肝肾功能的作用(中国药典)。枸杞也可以用作食物，具有很高的营养价值。枸杞约有80种，主要分布在南美洲，少数种类分布于欧亚大陆温带，我国约有7种3变种，主要分布于北部(中国植物志，第67(1)卷茄科、茄族、枸杞亚族、枸杞属lycium)。
2、目前，除了在枸杞(l.chinense miller)中发现的枸杞褪绿绿化病毒(goji berrychloroosis virus,gbcv)，尚没有关于在枸杞中发现过其他病毒方面的报道。
3、2017年，在中国宁夏自治区吴忠市同心县发现了一株叶子皱缩的宁夏枸杞植株，疑似由病毒侵染引起，本专利技术人利用高通量测序(hts)技术对病叶中的病毒种类进行分析，鉴定到其为质型弹状病毒属(cytorhabdovirus)的一种新病毒，并通过sanger测序确定该病毒的基因组序列。该病毒具有典型的质型弹状病毒属的基因组结构，并且与质型弹状病毒属成员的亲缘关系最近。专利技术人将该病毒命名为枸杞质型弹状病毒a(gojicytorhabdovirus a,gcva)，并将其归类为弹状病毒科(rhabdoviridae)质性弹状病
4、rt-pcr是目前最常使用的病毒检测方法之一，是一种核酸水平的检测方法。对于生物学检测、电子显微镜检测、血清学检测等检测方法具有：灵敏度高(能够将极微量的核酸快速扩增至可检测水平，灵敏度可达pg级)、特异性强(不受相体内杂蛋白的影响)、快速(样本检测可在24h内完成)等优点。
5、基于此，本申请针对枸杞质型弹状病毒a(gcva)设计了特异性检测引物，为该病毒的检测提供了有效的工具。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供一种分离的生物体，所述分离的生物体是目前尚未报道过的新物种，其包含seq id no.1所示的核苷酸，为质型弹状病毒属cytorhabdovirus病毒，更具体的，为枸杞质型弹状病毒a(goji cytorhabdovirus a,gcva)。
2、本专利技术的另一目的是提供枸杞质型弹状病毒a(gcva)的检测引物，采用其可实现对枸杞质型弹状病毒a进行特异性检测。
3、本专利技术的另一目的还在于提供利用上述检测引物检测枸杞质型弹状病毒a的方法。
4、为了达到上述目的，本专利技术采用如下技术方案：
5、一种分离的生物体，其包含seq id no.1所示的核苷酸，所述生物体是质型弹状病毒属cytorhabdovirus病毒，更具体的是，所述生物体为枸杞质型弹状病毒a。
6、一种枸杞质型弹状病毒a的检测引物，所述检测引物选自以下任一的引物对：seqid no.2和seq id no.3所示的引物对、seq id no.4和seq id no.5所示的引物对、seq idno.6和seq id no.7所示的引物对、seq id no.8和seq id no.9所示的引物对；所述枸杞质型弹状病毒a的核苷酸序列如seq id no.1所示。
7、上述检测引物在制备检测枸杞质型弹状病毒a的产品中的应用。
8、进一步，所述产品是试剂的形式或芯片的形式。
9、一种检测枸杞质型弹状病毒a的产品，其包含上述检测引物。
10、进一步，所述产品为试剂(或试剂盒)的形式，所述试剂(或试剂盒)中，包含上述检测引物。
11、进一步，所述产品为芯片的形式，在载体上结合(包被)有上述检测引物。
12、一种检测枸杞质型弹状病毒a的方法，包括如下步骤：
13、(1)获得待测样本的核苷酸；
14、(2)采用上述检测引物接触所述待测样本的核苷酸(或所述核苷酸的扩增产物，或所述核苷酸的逆转录产物)；
15、(3)确定是否存在序列如seq id no.1所示的核苷酸。
16、如确定在待测样本中存在seq id no.1所示的核苷酸时，则判定所述待测样本感染的是枸杞质型弹状病毒a；如在待测样本中不存在seq id no.1所示的核苷酸时，则判定所述待测样本没有感染枸杞质型弹状病毒a。
17、进一步，所述待测样本为枸杞属植物，包括但不限于宁夏枸杞、黄果枸杞、枸杞、北方枸杞、柱筒枸杞、新疆枸杞、红枝枸杞、柔茎枸杞、黑果枸杞、截萼枸杞、云南枸杞。
18、与现有技术相比，本专利技术具有以下优点：
19、1)本专利技术首次鉴定出枸杞质型弹状病毒a(gcva)，并提供了该病毒的全长序列，对于枸杞质型弹状病毒a的研究具有开拓性的意义。
20、2)本专利技术公开了枸杞质型弹状病毒a的检测引物，为枸杞质型弹状病毒a(gcva)的检测提供了有效的工具。
21、3)本专利技术的检测方法方便、快速、灵敏，并且特异性强。
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1.一种分离的生物体，其包含选自SEQ ID No.1所示的核苷酸或其片段，或互补于SEQID No.1所示核苷酸的核苷酸。
2.如权利要求1所述的分离的生物体，其特征在于，所述生物体是质型弹状病毒属Cytorhabdovirus病毒。
3.一种枸杞质型弹状病毒A的检测引物，其特征在于，所述检测引物选自以下任一的引物对：SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示的引物对、SEQ ID No.4和SEQ ID No.5所示的引物对、SEQ ID No.6和SEQ ID No.7所示的引物对、SEQ ID No.8和SEQ ID No.9所示的引物对；所述枸杞质型弹状病毒A的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示或与SEQ ID No.1具有90％以上的核苷酸序列相似性。
4.权利要求3所述检测引物在制备检测枸杞质型弹状病毒A的产品中的应用。
5.如权利要求4所述的应用，其特征在于，所述产品是试剂的形式或芯片的形式。
6.一种检测枸杞质型弹状病毒A的产品，其特征在于，包含权利要求3所述检测引物。
7.如权
8.一种检测枸杞质型弹状病毒A的方法，其特征在于，包括如下步骤：
9.如权利要求8所述检测枸杞质型弹状病毒A的方法，其特征在于，所述待测样本为枸杞属植物。
10.如权利要求9所述检测枸杞质型弹状病毒A的方法，其特征在于，所述枸杞属植物选自以下任一项：宁夏枸杞、黄果枸杞、枸杞、北方枸杞、柱筒枸杞、新疆枸杞、红枝枸杞、柔茎枸杞、黑果枸杞、截萼枸杞、云南枸杞。
...【技术特征摘要】
1.一种分离的生物体，其包含选自seq id no.1所示的核苷酸或其片段，或互补于seqid no.1所示核苷酸的核苷酸。
2.如权利要求1所述的分离的生物体，其特征在于，所述生物体是质型弹状病毒属cytorhabdovirus病毒。
3.一种枸杞质型弹状病毒a的检测引物，其特征在于，所述检测引物选自以下任一的引物对：seq id no.2和seq id no.3所示的引物对、seq id no.4和seq id no.5所示的引物对、seq id no.6和seq id no.7所示的引物对、seq id no.8和seq id no.9所示的引物对；所述枸杞质型弹状病毒a的核苷酸序列如seq id no.1所示或与seq id no.1具有90％以上的核苷酸序列相似性。
4.权利要求3所...
【专利技术属性】
技术研发人员：王蓉，李勇，丁万隆，魏建和，
申请(专利权)人：中国医学科学院药用植物研究所，
类型：发明
国别省市：
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