一种扩增甲型流感病毒全基因组的引物组及含其试剂盒与应用制造技术

本发明专利技术属于分子生物学检测领域，具体涉及一种扩增甲型流感病毒全基因组的引物组及含其试剂盒与应用

【技术实现步骤摘要】
一种扩增甲型流感病毒全基因组的引物组及含其试剂盒与应用


[0001]本专利技术属于分子生物学检测领域，具体涉及一种扩增甲型流感病毒全基因组的引物组及含其试剂盒与应用
。

技术介绍

[0002]甲型流感病毒是一类单股
、
负链
、
分节段
RNA
病毒，有8个功能不同的
RNA
节段，长度分别为
2.3kb、2.3kb、2.2kb、1.8kb、1.6kb、1.4kb、1.0kb、0.9kb
，总长为
13.5kb。
根据分布在病毒表面的
HA
和
NA
的蛋白结构和基因特性区分亚型，目前发现的
HA
和
NA
分别有
18
个
(H1
‑
18)
和
11
个
(N1
‑
11)
亚型，可组合为
198
种甲型流感亚型
。
[0003]由于流感病毒的复制没有
RNA
校正酶参与，
RNA
聚合酶每复制大约一万个核苷酸就会出错，致使其发生突变的频率高于其他病毒；并且，流感病毒基因组的节段性使得不同亚型病毒同时感染一个细胞时，可能发生基因重组，导致病毒基因组出现较大的突变，加上传播速度极易引起季节性流行
。
因此，监测甲型流感病毒基因组变异情况，对新型流感病毒做出预警，预测
、
预警流感流行趋势变得尤为重要
。
[0004]甲型流感病毒的鉴定和分型方法主要有病毒分离培养
、
免疫学方法和分子检测方法，不同的方法，病毒检测时间窗口也不相同
。
病毒培养是流感病毒鉴定的金标准，可以进行后续的抗原耐药监测实验，但实际操作耗时费力，常需要5‑7天，且无法大规模临床诊断使用
。
免疫学方法中，血清学方法可以精确到亚型和病毒系水平，可以进行大批量样本操作，常常用在人群水平的血清学监测，在临床上一般用来做回顾性研究；胶体金方法检测速度快，时间短，常在
10
‑
15min
即可得到结果，但准确性较低，不能作为流感阴性确诊的标准
。
[0005]目前通过分子检测方法监测甲型流感病毒基因组变异情况或鉴定分型主要包括两种：一是针对单一亚型设计叠瓦式的多重引物，经过多重
PCR
扩增后进行测序获得全基因组序列，因甲流病毒基因组变异大，此方法仅针对单一亚型，且需要根据变异情况实时更新
。
[0006]因此，需要针对甲型流感的所有亚型提供一种更简单快速的方法及引物组，以实现均匀地扩增甲型流感病毒的全基因组
。

技术实现思路

[0007]为了克服现有技术的缺陷，以实现均匀地扩增甲型流感病毒的全基因组，从而达到监测甲型流感病毒变异情况的技术目的
。
[0008]本专利技术特此提出了以下技术方案：
[0009]在第一方面，本专利技术提供了一种扩增甲型流感病毒全基因组的引物组所述引物组包括：
[0010]第一核酸组合物：
[0011]扩增甲型流感病毒8个节段的引物：
Uni
‑
12
‑
F1、Uni
‑
12
‑
F2
和
Uni
‑
13
；
[0012]第二核酸组合物：
[0013]扩增甲型流感病毒
PB2
节段的引物：
A
‑
PB2
‑
UniF
和
A
‑
PB2
‑
UniR
；扩增甲型流感病毒
PB1
节段的引物：
A
‑
PB1
‑
UniF
和
A
‑
PB1
‑
UniR
；扩增甲型流感病毒
PA
节段的引物：
A
‑
PA
‑
UniF
和
A
‑
PA
‑
UniR
；扩增甲型流感病毒
HA
节段的引物：
A
‑
HA
‑
UniF
和
A
‑
HA
‑
UniR
；扩增甲型流感病毒
NA
节段的引物：
A
‑
NA
‑
UniF
和
A
‑
NA
‑
UniR
；
[0014]其中，所述
Uni
‑
12
‑
F1
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:1
所示；
[0015]所述
Uni
‑
12
‑
F2
核苷酸序列如
SEQ ID NO:2
所示；
[0016]所述
Uni
‑
13
核苷酸序列如
SEQ ID NO:3
所示；
[0017]所述
A
‑
PB2
‑
UniF
的核苷酸如
SEQ ID NO:4
所示；
[0018]所述
A
‑
PB2
‑
UniR
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:5
所示；
[0019]所述
A
‑
PB1
‑
UniF
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:6
所示；
[0020]所述
A
‑
PB1
‑
UniR
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:7
所示；
[0021]所述
A
‑
PA
‑
UniF
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:8
所示；
[0022]所述
A
‑
PA
‑
UniR
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:9
所示；
[0023]所述
A
‑
HA
‑
UniF
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:10
所示；
[0024]所述
A
‑
HA
‑
UniR
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:11
所示；<本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种扩增甲型流感病毒全基因组的引物组，其特征在于，所述引物组包括：第一核酸组合物：扩增甲型流感病毒8个节段的引物：
Uni
‑
12
‑
F1、Uni
‑
12
‑
F2
和
Uni
‑
13
；第二核酸组合物：扩增甲型流感病毒
PB2
节段的引物：
A
‑
PB2
‑
UniF
和
A
‑
PB2
‑
UniR
；扩增甲型流感病毒
PB1
节段的引物：
A
‑
PB1
‑
UniF
和
A
‑
PB1
‑
UniR
；扩增甲型流感病毒
PA
节段的引物：
A
‑
PA
‑
UniF
和
A
‑
PA
‑
UniR
；扩增甲型流感病毒
HA
节段的引物：
A
‑
HA
‑
UniF
和
A
‑
HA
‑
UniR
；扩增甲型流感病毒
NA
节段的引物：
A
‑
NA
‑
UniF
和
A
‑
NA
‑
UniR
；其中，所述
Uni
‑
12
‑
F1
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:1
所示；所述
Uni
‑
12
‑
F2
核苷酸序列如
SEQ ID NO:2
所示；所述
Uni
‑
13
核苷酸序列如
SEQ ID NO:3
所示；所述
A
‑
PB2
‑
UniF
的核苷酸如
SEQ ID NO:4
所示；所述
A
‑
PB2
‑
UniR
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:5
所示；所述
A
‑
PB1
‑
UniF
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:6
所示；所述
A
‑
PB1
‑
UniR
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:7
所示；所述
A
‑
PA
‑
UniF
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:8
所示；所述
A
‑
PA
‑
UniR
的核苷酸序列如
SEQ ID NO:9
所示；所述
A
‑
HA
‑

【专利技术属性】
技术研发人员：杨丽，曹桂元，刘佳，陈姮玉，戴立忠，邓小龙，
申请(专利权)人：圣湘生物科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：